More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1792 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0573  extracellular solute-binding protein  92.64 
 
 		 460 aa  865    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1792  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 462 aa  934    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2102  periplasmic protein  63.01 
 
 		 447 aa  535  1e-151  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.502645  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0145  extracellular solute-binding protein family 1  45.47 
 
 		 442 aa  410  1e-113  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0540  ABC transporter, substrate-binding protein  35.13 
 
 		 461 aa  263  4.999999999999999e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0556  ABC transporter, solute-binding protein  34.48 
 
 		 461 aa  258  2e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5528  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  31.27 
 
 		 485 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.217643  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  30.17 
 
 		 435 aa  92.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7707  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.27 
 
 		 485 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.570568 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3207  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 		 467 aa  88.2  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0625  extracellular solute-binding protein family 1  28.7 
 
 		 437 aa  83.6  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2983  extracellular solute-binding protein  27.66 
 
 		 467 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2855  extracellular solute-binding protein family 1  27.37 
 
 		 483 aa  82  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.830086 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3246  extracellular solute-binding protein family 1  28 
 
 		 443 aa  80.5  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3996  extracellular solute-binding protein family 1  25.38 
 
 		 472 aa  77.4  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0734403  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  27.42 
 
 		 441 aa  77.8  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1055  extracellular solute-binding protein  28.22 
 
 		 418 aa  76.3  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.404897  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0891  extracellular solute-binding protein family 1  28.21 
 
 		 438 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0493428 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23850  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.86 
 
 		 484 aa  74.7  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0529  extracellular solute-binding protein  25.77 
 
 		 464 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.361956  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  32.16 
 
 		 445 aa  73.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1941  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 		 487 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.948884  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1243  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 		 444 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4136  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  28.21 
 
 		 400 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1705  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 		 444 aa  71.6  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.751939  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4267  extracellular solute-binding protein family 1  27.44 
 
 		 400 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 		 493 aa  68.2  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4289  extracellular solute-binding protein family 1  27.59 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  28.07 
 
 		 434 aa  67.4  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 		 427 aa  67  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2983  extracellular solute-binding protein family 1  26.86 
 
 		 425 aa  64.7  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6732  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 425 aa  65.1  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1756  ABC transporter substrate-binding protein  25.3 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  0.574192 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  25.85 
 
 		 434 aa  64.3  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  30.94 
 
 		 433 aa  63.9  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  26.7 
 
 		 434 aa  62.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2576  extracellular solute-binding protein family 1  50 
 
 		 614 aa  62  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7806  extracellular solute-binding protein family 1  24.1 
 
 		 452 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2283  extracellular solute-binding protein  30.38 
 
 		 456 aa  62.4  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462772  hitchhiker  0.0000190717 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 		 451 aa  61.6  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0616  extracellular solute-binding protein family 1  26.15 
 
 		 432 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3379  extracellular solute-binding protein  26.98 
 
 		 445 aa  61.6  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2284  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  28.8 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.61221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  23.74 
 
 		 439 aa  61.2  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1262  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.953049  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.77 
 
 		 435 aa  61.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  24.7 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  27.04 
 
 		 442 aa  60.5  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  28.8 
 
 		 419 aa  60.1  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0828  extracellular solute-binding protein  28.26 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00532301  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2047  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.27 
 
 		 479 aa  60.1  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  24.11 
 
 		 404 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  25.21 
 
 		 424 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  27.18 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0701  extracellular solute-binding protein family 1  26.13 
 
 		 432 aa  59.7  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24620  carbohydrate-binding protein  23.87 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  25.78 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.1 
 
 		 438 aa  58.5  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  26.33 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3469  extracellular solute-binding protein family 1  32.46 
 
 		 446 aa  59.3  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1321  extracellular solute-binding protein family 1  23.68 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1218  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2327  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  29.81 
 
 		 433 aa  58.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0840  extracellular solute-binding protein  27.72 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.961003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.31 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  23.59 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 		 455 aa  57.8  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  26.92 
 
 		 414 aa  57.4  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  25.36 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  23.1 
 
 		 417 aa  57.8  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0929  extracellular solute-binding protein  27.72 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14550  extracellular solute-binding protein family 1  27.11 
 
 		 432 aa  57  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000299418  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0489  extracellular solute-binding protein  27.72 
 
 		 415 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0816838  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0968  extracellular solute-binding protein  27.72 
 
 		 415 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278189  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0628  extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2472  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 		 419 aa  56.6  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.250047 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 		 424 aa  56.6  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1306  extracellular solute-binding protein family 1  24.91 
 
 		 445 aa  56.6  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9200  ABC-type sugar transport system periplasmic component  26.79 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  24.76 
 
 		 413 aa  56.6  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4071  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  27.07 
 
 		 415 aa  56.6  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00185695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2255  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.85 
 
 		 440 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190437  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  27 
 
 		 408 aa  56.2  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  24.39 
 
 		 428 aa  56.2  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6357  extracellular solute-binding protein family 1  27.52 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  24.9 
 
 		 405 aa  56.6  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 		 428 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3914  extracellular solute-binding protein  28.31 
 
 		 457 aa  56.2  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  24.76 
 
 		 399 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1879  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 		 437 aa  56.2  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000146819  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3169  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 		 445 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187022 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13200  extracellular solute-binding protein family 1  24.17 
 
 		 424 aa  56.2  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2430  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 		 415 aa  56.2  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.682399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0434  extracellular solute-binding protein family 1  25.21 
 
 		 444 aa  55.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0832  multiple sugar transport system substrate-binding protein  23.35 
 
 		 416 aa  55.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.669088  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3451  ABC sugar (maltose) transporter, periplasmic ligand binding protein  28.4 
 
 		 415 aa  55.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05214  maltose ABC transporter periplasmic protein  23.4 
 
 		 416 aa  55.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  29.87 
 
 		 452 aa  55.5  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>