211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2047 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2047  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 		 479 aa  979    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7707  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  49.79 
 
 		 485 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.570568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1941  extracellular solute-binding protein family 1  42.97 
 
 		 487 aa  385  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.948884  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5528  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  43.58 
 
 		 485 aa  357  1.9999999999999998e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.217643  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23850  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  37.97 
 
 		 484 aa  293  6e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3207  extracellular solute-binding protein  38.19 
 
 		 467 aa  291  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2983  extracellular solute-binding protein  37.42 
 
 		 467 aa  285  9e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2855  extracellular solute-binding protein family 1  38.67 
 
 		 483 aa  271  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.830086 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3996  extracellular solute-binding protein family 1  31.59 
 
 		 472 aa  211  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0734403  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0556  ABC transporter, solute-binding protein  29.18 
 
 		 461 aa  193  6e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0540  ABC transporter, substrate-binding protein  28.94 
 
 		 461 aa  190  5e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0145  extracellular solute-binding protein family 1  23.55 
 
 		 442 aa  85.9  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.61 
 
 		 438 aa  83.2  0.000000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  21.54 
 
 		 417 aa  80.5  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2102  periplasmic protein  21.99 
 
 		 447 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.502645  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  22.92 
 
 		 408 aa  77.4  0.0000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  25.15 
 
 		 435 aa  75.5  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0625  extracellular solute-binding protein family 1  26.22 
 
 		 437 aa  73.6  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  27.92 
 
 		 434 aa  72.8  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 422 aa  72.4  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1792  extracellular solute-binding protein  22.11 
 
 		 462 aa  70.5  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  25.22 
 
 		 468 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  26.34 
 
 		 431 aa  68.2  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  24.04 
 
 		 434 aa  68.2  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2255  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  21.94 
 
 		 440 aa  67  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190437  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1705  extracellular solute-binding protein  30.59 
 
 		 444 aa  67  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.751939  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  32.52 
 
 		 422 aa  66.6  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0168  extracellular solute-binding protein family 1  30.67 
 
 		 412 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  25.27 
 
 		 442 aa  65.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  23.59 
 
 		 454 aa  65.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  24.67 
 
 		 470 aa  64.3  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  25.22 
 
 		 424 aa  63.9  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  27.24 
 
 		 455 aa  63.9  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  27.96 
 
 		 448 aa  63.9  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3716  extracellular solute-binding protein family 1  26.27 
 
 		 440 aa  63.5  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 		 435 aa  63.5  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0573  extracellular solute-binding protein  21.79 
 
 		 460 aa  63.2  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  30.22 
 
 		 427 aa  62.4  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.44 
 
 		 435 aa  62  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0434  extracellular solute-binding protein family 1  23.93 
 
 		 444 aa  62.4  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  24.1 
 
 		 441 aa  62  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2983  extracellular solute-binding protein family 1  24.62 
 
 		 425 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  24.92 
 
 		 414 aa  62  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  29.05 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24620  carbohydrate-binding protein  25.29 
 
 		 424 aa  61.2  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  29.79 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  22.73 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  22.61 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  22.61 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  23.26 
 
 		 423 aa  59.7  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  24.11 
 
 		 427 aa  59.3  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  22.61 
 
 		 412 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00840  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.68 
 
 		 451 aa  58.9  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14550  extracellular solute-binding protein family 1  29.01 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000299418  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3600  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 		 425 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 		 439 aa  58.9  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  25.41 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  27.51 
 
 		 442 aa  58.2  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1248  extracellular solute-binding protein family 1  23.67 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.494424  normal  0.639356 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  22.34 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13200  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 424 aa  57.4  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  20.9 
 
 		 420 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  20.9 
 
 		 420 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3041  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 		 429 aa  57  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887996  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 		 428 aa  57  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  20.9 
 
 		 419 aa  57  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3483  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  21.01 
 
 		 421 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  23.78 
 
 		 408 aa  56.2  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5137  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 		 433 aa  56.2  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.319423  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  21.32 
 
 		 417 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001061  ABC-type sugar transport system component  26.82 
 
 		 414 aa  55.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  24.27 
 
 		 427 aa  55.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.64 
 
 		 380 aa  55.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.283496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0616  extracellular solute-binding protein family 1  22.14 
 
 		 432 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  26.2 
 
 		 429 aa  55.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  21.2 
 
 		 434 aa  55.1  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  20.63 
 
 		 419 aa  55.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1625  alpha-glucoside ABC transporter periplasmic- binding protein  26.62 
 
 		 442 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.234885  normal  0.190993 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25 
 
 		 427 aa  55.1  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  32.41 
 
 		 451 aa  54.7  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  22.11 
 
 		 419 aa  54.7  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  23.56 
 
 		 495 aa  54.3  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4751  extracellular solute-binding protein family 1  27.23 
 
 		 417 aa  54.3  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137656  normal  0.378465 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2999  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 		 419 aa  54.3  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.662901  hitchhiker  0.0000395876 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0996  extracellular solute-binding protein family 1  23.29 
 
 		 455 aa  53.9  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2380  extracellular solute-binding protein family 1  27.33 
 
 		 415 aa  53.9  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 		 414 aa  53.9  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  21.01 
 
 		 419 aa  53.5  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2472  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 		 419 aa  53.1  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.250047 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4662  extracellular solute-binding protein family 1  25.56 
 
 		 417 aa  53.5  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.917353 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1728  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 		 411 aa  53.5  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00458236  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  27.22 
 
 		 441 aa  53.1  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  27.08 
 
 		 413 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1001  extracellular solute-binding protein family 1  24.06 
 
 		 427 aa  53.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.628257  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2151  extracellular solute-binding protein family 1  25.93 
 
 		 466 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0910  extracellular solute-binding protein family 1  27.71 
 
 		 466 aa  53.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.764586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  24.59 
 
 		 479 aa  52.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2098  extracellular solute-binding protein family 1  28.04 
 
 		 411 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.072788 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>