162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7707 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7707  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 		 485 aa  996    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.570568 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5528  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  54.32 
 
 		 485 aa  516  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.217643  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2047  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  48.75 
 
 		 479 aa  428  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1941  extracellular solute-binding protein family 1  43.62 
 
 		 487 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.948884  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3207  extracellular solute-binding protein  39.79 
 
 		 467 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2983  extracellular solute-binding protein  39.17 
 
 		 467 aa  294  2e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23850  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  38.1 
 
 		 484 aa  281  3e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3996  extracellular solute-binding protein family 1  33.06 
 
 		 472 aa  221  3e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0734403  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2855  extracellular solute-binding protein family 1  33.54 
 
 		 483 aa  218  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.830086 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0556  ABC transporter, solute-binding protein  27.15 
 
 		 461 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0540  ABC transporter, substrate-binding protein  28.36 
 
 		 461 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0573  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 		 460 aa  97.1  6e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1792  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 462 aa  96.3  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0145  extracellular solute-binding protein family 1  26.85 
 
 		 442 aa  89.7  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2102  periplasmic protein  24.92 
 
 		 447 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.502645  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  23.09 
 
 		 468 aa  79  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2255  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.85 
 
 		 440 aa  74.3  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190437  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2983  extracellular solute-binding protein family 1  26.28 
 
 		 425 aa  72.8  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  24.78 
 
 		 431 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  24.61 
 
 		 427 aa  72  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  23.83 
 
 		 454 aa  71.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  22.15 
 
 		 417 aa  71.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1705  extracellular solute-binding protein  26.02 
 
 		 444 aa  70.9  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.751939  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  24.74 
 
 		 414 aa  70.1  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  21.97 
 
 		 434 aa  69.3  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0625  extracellular solute-binding protein family 1  22.57 
 
 		 437 aa  69.7  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  31.08 
 
 		 427 aa  69.7  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 		 427 aa  68.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  22.54 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  25.16 
 
 		 410 aa  66.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  26.44 
 
 		 432 aa  64.7  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  23.47 
 
 		 495 aa  64.7  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 		 452 aa  63.9  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0891  extracellular solute-binding protein family 1  22.6 
 
 		 438 aa  63.9  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0493428 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  24.01 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  23.57 
 
 		 455 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3941  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25 
 
 		 436 aa  61.6  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  22.83 
 
 		 435 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  26.85 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 		 421 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  26 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  23.9 
 
 		 408 aa  59.7  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  29.8 
 
 		 429 aa  59.3  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  23.85 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3494  extracellular solute-binding protein  24.01 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2576  extracellular solute-binding protein family 1  20.94 
 
 		 614 aa  58.2  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  26.39 
 
 		 445 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 		 420 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 		 420 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3264  extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.591163 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.08 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0168  extracellular solute-binding protein family 1  25.28 
 
 		 412 aa  57  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3651  hypothetical protein  22.5 
 
 		 437 aa  57  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  0.0762923 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01480  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.63 
 
 		 435 aa  57  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0434  extracellular solute-binding protein family 1  25.84 
 
 		 444 aa  57  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  26.42 
 
 		 422 aa  56.6  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1218  extracellular solute-binding protein family 1  25.78 
 
 		 444 aa  56.6  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 		 419 aa  56.6  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  28.77 
 
 		 444 aa  56.2  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3350  extracellular solute-binding protein family 1  25.9 
 
 		 461 aa  56.2  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  32.52 
 
 		 427 aa  54.7  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  22.25 
 
 		 493 aa  55.1  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  26.24 
 
 		 424 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2999  extracellular solute-binding protein  28.79 
 
 		 419 aa  54.3  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.662901  hitchhiker  0.0000395876 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  22.19 
 
 		 434 aa  54.3  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  42.47 
 
 		 435 aa  53.9  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1490  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.05 
 
 		 442 aa  53.9  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.095095  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2380  extracellular solute-binding protein family 1  23.87 
 
 		 415 aa  53.5  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1482  extracellular solute-binding protein family 1  31.11 
 
 		 420 aa  53.5  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3786  extracellular solute-binding protein family 1  31.11 
 
 		 419 aa  53.5  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 		 412 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 		 412 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.36 
 
 		 438 aa  52.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3534  extracellular solute-binding protein family 1  23.75 
 
 		 445 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.582574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2783  extracellular solute-binding protein family 1  24.54 
 
 		 431 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3246  extracellular solute-binding protein family 1  23.85 
 
 		 443 aa  53.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0910  extracellular solute-binding protein family 1  27.03 
 
 		 466 aa  52.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.764586  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1306  extracellular solute-binding protein family 1  26.74 
 
 		 445 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  22.7 
 
 		 439 aa  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1378  extracellular solute-binding protein family 1  30.37 
 
 		 420 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3491  extracellular solute-binding protein family 1  30.37 
 
 		 419 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2415  extracellular solute-binding protein family 1  23.75 
 
 		 433 aa  51.6  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0616  extracellular solute-binding protein family 1  21.11 
 
 		 432 aa  51.6  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1485  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.49 
 
 		 429 aa  51.6  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3716  extracellular solute-binding protein family 1  26.24 
 
 		 440 aa  52  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3379  extracellular solute-binding protein  23.51 
 
 		 445 aa  51.2  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  25.99 
 
 		 434 aa  50.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4889  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.95 
 
 		 429 aa  50.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6971  extracellular solute-binding protein family 1  24.92 
 
 		 431 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.487837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5820  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.88 
 
 		 447 aa  50.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0998  extracellular solute-binding protein family 1  26.18 
 
 		 451 aa  50.1  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0477  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 		 432 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838392  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  25.86 
 
 		 435 aa  50.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  22.69 
 
 		 410 aa  49.7  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  26.76 
 
 		 414 aa  50.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7806  extracellular solute-binding protein family 1  20.92 
 
 		 452 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>