40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3996 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3996  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 472 aa  963    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0734403  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23850  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  42.68 
 
 		 484 aa  358  9.999999999999999e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1941  extracellular solute-binding protein family 1  30.54 
 
 		 487 aa  238  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.948884  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7707  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  33.06 
 
 		 485 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.570568 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3207  extracellular solute-binding protein  29.14 
 
 		 467 aa  197  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2047  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  32.41 
 
 		 479 aa  197  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2983  extracellular solute-binding protein  28.93 
 
 		 467 aa  189  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5528  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.41 
 
 		 485 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.217643  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2855  extracellular solute-binding protein family 1  26.19 
 
 		 483 aa  163  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.830086 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0556  ABC transporter, solute-binding protein  29.52 
 
 		 461 aa  123  6e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0540  ABC transporter, substrate-binding protein  29.21 
 
 		 461 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0573  extracellular solute-binding protein  25.66 
 
 		 460 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1792  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 		 462 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0145  extracellular solute-binding protein family 1  24.26 
 
 		 442 aa  75.9  0.000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2102  periplasmic protein  25.53 
 
 		 447 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.502645  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  20.68 
 
 		 408 aa  54.7  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  20.98 
 
 		 435 aa  53.9  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  21.36 
 
 		 417 aa  50.8  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2255  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  22.41 
 
 		 440 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190437  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1248  extracellular solute-binding protein family 1  23.65 
 
 		 414 aa  48.5  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.494424  normal  0.639356 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24620  carbohydrate-binding protein  34.31 
 
 		 424 aa  47.8  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  25.9 
 
 		 495 aa  47.4  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3483  extracellular solute-binding protein  22.71 
 
 		 417 aa  47  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7166  alpha-glucoside ABC transporter  26.75 
 
 		 451 aa  47  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0625  extracellular solute-binding protein family 1  24.73 
 
 		 437 aa  47  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  24.4 
 
 		 433 aa  47  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  23.63 
 
 		 434 aa  46.2  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 		 441 aa  46.6  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3914  extracellular solute-binding protein  28.06 
 
 		 457 aa  46.2  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  19.55 
 
 		 408 aa  46.6  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  25.27 
 
 		 441 aa  46.2  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  22.42 
 
 		 468 aa  45.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  27.75 
 
 		 442 aa  44.3  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.52 
 
 		 435 aa  43.9  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3967  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 448 aa  43.9  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182057  normal  0.154584 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3600  extracellular solute-binding protein family 1  26.92 
 
 		 425 aa  43.5  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  25.25 
 
 		 448 aa  43.5  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14550  extracellular solute-binding protein family 1  25.58 
 
 		 432 aa  43.1  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000299418  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3246  extracellular solute-binding protein family 1  26.02 
 
 		 443 aa  43.5  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  22.18 
 
 		 408 aa  43.1  0.01  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>