180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1941 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1941  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 487 aa  1002    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.948884  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7707  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  43.62 
 
 		 485 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.570568 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2047  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  41.34 
 
 		 479 aa  362  9e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3207  extracellular solute-binding protein  39.29 
 
 		 467 aa  300  3e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2983  extracellular solute-binding protein  38.36 
 
 		 467 aa  297  3e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23850  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  39.24 
 
 		 484 aa  290  3e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5528  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  36.55 
 
 		 485 aa  286  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.217643  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2855  extracellular solute-binding protein family 1  35.29 
 
 		 483 aa  284  3.0000000000000004e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.830086 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3996  extracellular solute-binding protein family 1  30.54 
 
 		 472 aa  238  1e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0734403  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0540  ABC transporter, substrate-binding protein  28.75 
 
 		 461 aa  176  6e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0556  ABC transporter, solute-binding protein  28.79 
 
 		 461 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 		 435 aa  102  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1705  extracellular solute-binding protein  27.39 
 
 		 444 aa  91.3  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.751939  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0145  extracellular solute-binding protein family 1  25.38 
 
 		 442 aa  83.6  0.000000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  23.05 
 
 		 417 aa  80.1  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  24.74 
 
 		 434 aa  79.3  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 		 451 aa  79  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  21.81 
 
 		 408 aa  78.2  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.19 
 
 		 435 aa  76.3  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  23.81 
 
 		 441 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  22.31 
 
 		 424 aa  72.8  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1792  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 		 462 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0998  extracellular solute-binding protein family 1  23.16 
 
 		 451 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0625  extracellular solute-binding protein family 1  23.47 
 
 		 437 aa  70.1  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.76 
 
 		 438 aa  69.7  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  26.87 
 
 		 448 aa  69.3  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  33.86 
 
 		 441 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0573  extracellular solute-binding protein  24.27 
 
 		 460 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  21.85 
 
 		 468 aa  68.2  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1490  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.8 
 
 		 442 aa  68.6  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.095095  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  24.28 
 
 		 399 aa  67  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1485  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  22.46 
 
 		 429 aa  67  0.0000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  24.63 
 
 		 434 aa  66.6  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  24.28 
 
 		 413 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2102  periplasmic protein  23.03 
 
 		 447 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.502645  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  23.77 
 
 		 414 aa  65.5  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0891  extracellular solute-binding protein family 1  22.55 
 
 		 438 aa  65.1  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0493428 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  23.92 
 
 		 470 aa  64.7  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2255  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  21.63 
 
 		 440 aa  64.7  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190437  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  21.91 
 
 		 454 aa  64.3  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  25.6 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7166  alpha-glucoside ABC transporter  25.48 
 
 		 451 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  25.66 
 
 		 442 aa  62  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  24.26 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  29.69 
 
 		 441 aa  60.8  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0693  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  28.49 
 
 		 421 aa  59.7  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0998966  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  26.04 
 
 		 422 aa  59.3  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1625  alpha-glucoside ABC transporter periplasmic- binding protein  23.49 
 
 		 442 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.234885  normal  0.190993 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 		 421 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  25.33 
 
 		 451 aa  58.9  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1090  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0996  extracellular solute-binding protein family 1  22.37 
 
 		 455 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  26.42 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3404  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  26.94 
 
 		 445 aa  58.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.93 
 
 		 427 aa  57  0.0000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 		 419 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3914  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 		 457 aa  56.6  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  22.53 
 
 		 408 aa  55.8  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  19.85 
 
 		 495 aa  55.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  22.08 
 
 		 441 aa  55.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3246  extracellular solute-binding protein family 1  24.4 
 
 		 443 aa  55.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1218  extracellular solute-binding protein family 1  21.94 
 
 		 444 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0092  extracellular solute-binding protein  26.98 
 
 		 425 aa  55.1  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 		 419 aa  55.1  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  27.75 
 
 		 420 aa  54.7  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  23.18 
 
 		 455 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5887  extracellular solute-binding protein family 1  29.02 
 
 		 412 aa  54.3  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  24.1 
 
 		 423 aa  54.3  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  23.03 
 
 		 493 aa  53.9  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  23.96 
 
 		 410 aa  53.5  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 		 412 aa  53.5  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 		 412 aa  53.5  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  23.8 
 
 		 435 aa  53.5  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0434  extracellular solute-binding protein family 1  26.56 
 
 		 444 aa  52.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3237  extracellular solute-binding protein family 1  22.02 
 
 		 464 aa  52.8  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1685  extracellular solute-binding protein family 1  23.94 
 
 		 434 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  22.32 
 
 		 433 aa  52.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3985  extracellular solute-binding protein  24.54 
 
 		 631 aa  52.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0580929  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  21.87 
 
 		 442 aa  52.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7218  extracellular solute-binding protein  21.57 
 
 		 412 aa  52.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  23.96 
 
 		 435 aa  52.4  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3483  extracellular solute-binding protein  21.89 
 
 		 417 aa  52  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3817  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 		 421 aa  51.6  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284829  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  21.28 
 
 		 431 aa  51.6  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0127  extracellular solute-binding protein family 1  26.64 
 
 		 442 aa  51.6  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3600  extracellular solute-binding protein family 1  21.7 
 
 		 425 aa  52  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2083  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  28.57 
 
 		 412 aa  50.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.206037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4349  extracellular solute-binding protein  23.46 
 
 		 415 aa  51.2  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000381076  hitchhiker  0.000997313 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3170  extracellular solute-binding protein  23.74 
 
 		 414 aa  50.8  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5027  extracellular solute-binding protein family 1  28.68 
 
 		 434 aa  50.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0894368  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  20.25 
 
 		 439 aa  50.8  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3041  extracellular solute-binding protein  22.52 
 
 		 429 aa  50.4  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887996  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  24.29 
 
 		 412 aa  50.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2950  extracellular solute-binding protein  27.93 
 
 		 435 aa  50.4  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110397  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>