148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3237 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_3237  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 464 aa  937    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01750  carbohydrate-binding protein  59.78 
 
 		 457 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110954  normal  0.899537 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3914  extracellular solute-binding protein  57.08 
 
 		 457 aa  505  9.999999999999999e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0267  extracellular solute-binding protein family 1  55.6 
 
 		 462 aa  504  1e-141  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.39283  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3182  extracellular solute-binding protein family 1  56.77 
 
 		 464 aa  494  9.999999999999999e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.145583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7166  alpha-glucoside ABC transporter  48.58 
 
 		 451 aa  438  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3587  extracellular solute-binding protein  51.01 
 
 		 447 aa  440  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.69287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3967  extracellular solute-binding protein  50 
 
 		 448 aa  437  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182057  normal  0.154584 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2337  ABC-type glucosylglycerol transport system substrate-binding protein  51.69 
 
 		 448 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176838  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5758  extracellular solute-binding protein family 1  46.56 
 
 		 498 aa  388  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal  0.192043 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4648  extracellular solute-binding protein family 1  42.27 
 
 		 448 aa  380  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000260895 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5152  extracellular solute-binding protein family 1  40.46 
 
 		 482 aa  334  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1180  extracellular solute-binding protein  38.78 
 
 		 485 aa  286  8e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2855  extracellular solute-binding protein  36.89 
 
 		 451 aa  256  5e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0387  extracellular solute-binding protein family 1  34.41 
 
 		 453 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2873  ABC alpha-glucoside transporter, perplasmic substrate-binding protein  37.5 
 
 		 450 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182804  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1147  extracellular solute-binding protein  36.14 
 
 		 544 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1519  extracellular solute-binding protein  37.5 
 
 		 450 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  0.200847 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0355  extracellular solute-binding protein family 1  34.62 
 
 		 453 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4345  extracellular solute-binding protein  34.88 
 
 		 450 aa  237  3e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0292  extracellular solute-binding protein  34.75 
 
 		 452 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1946  extracellular solute-binding protein  37.5 
 
 		 449 aa  227  4e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2910  ABC alpha-glucoside transporter extracellular solute-binding protein, family 1  35.82 
 
 		 452 aa  227  4e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.320115 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1652  putative solute-binding protein 1 family  35.48 
 
 		 452 aa  226  6e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182094  hitchhiker  0.00000465499 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3307  extracellular solute-binding protein  34.29 
 
 		 449 aa  222  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0785  ABC transporter substrate binding protein (alpha-glucoside)  32.56 
 
 		 452 aa  215  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3716  extracellular solute-binding protein family 1  31.38 
 
 		 440 aa  208  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14550  extracellular solute-binding protein family 1  33.25 
 
 		 432 aa  207  4e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000299418  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26130  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  33.98 
 
 		 448 aa  202  8e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0719829  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13200  extracellular solute-binding protein family 1  33.51 
 
 		 424 aa  202  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2626  extracellular solute-binding protein family 1  32.55 
 
 		 455 aa  170  6e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0491272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0869  extracellular solute-binding protein family 1  30.87 
 
 		 436 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.293785 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1625  alpha-glucoside ABC transporter periplasmic- binding protein  28.57 
 
 		 442 aa  139  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.234885  normal  0.190993 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2325  extracellular solute-binding protein family 1  30.9 
 
 		 444 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032194  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2151  extracellular solute-binding protein family 1  27.56 
 
 		 466 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2936  extracellular solute-binding protein family 1  30.2 
 
 		 447 aa  120  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2534  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 404 aa  111  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.478006  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0402  extracellular solute-binding protein family 1  25.68 
 
 		 447 aa  101  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  31.78 
 
 		 445 aa  70.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  31.53 
 
 		 431 aa  68.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  31.58 
 
 		 422 aa  68.6  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  27.42 
 
 		 434 aa  61.6  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0127  extracellular solute-binding protein family 1  27.7 
 
 		 442 aa  61.2  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  26.88 
 
 		 495 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2234  extracellular solute-binding protein family 1  28.09 
 
 		 419 aa  59.3  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2914  extracellular solute-binding protein family 1  27.52 
 
 		 440 aa  58.9  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  22.36 
 
 		 424 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5137  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 		 433 aa  59.3  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.319423  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5673  extracellular solute-binding protein family 1  29.77 
 
 		 435 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0285739  normal  0.0925972 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3657  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  25.13 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1588  extracellular solute-binding protein  24.14 
 
 		 452 aa  57.4  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  20.73 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.27 
 
 		 438 aa  57  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2380  extracellular solute-binding protein family 1  22.57 
 
 		 415 aa  57  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  25.11 
 
 		 434 aa  56.2  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0998  extracellular solute-binding protein family 1  23.4 
 
 		 451 aa  56.2  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  28.02 
 
 		 459 aa  56.2  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1941  extracellular solute-binding protein family 1  21.93 
 
 		 487 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.948884  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0168  extracellular solute-binding protein family 1  25.91 
 
 		 412 aa  55.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  21.72 
 
 		 441 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  29.93 
 
 		 435 aa  54.7  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  26.84 
 
 		 415 aa  54.3  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23850  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.33 
 
 		 484 aa  54.3  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.06 
 
 		 435 aa  53.9  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1138  extracellular solute-binding protein family 1  29.05 
 
 		 423 aa  53.1  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.443513  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1685  extracellular solute-binding protein family 1  26.58 
 
 		 434 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3996  extracellular solute-binding protein family 1  27.44 
 
 		 472 aa  52.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0734403  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  23.63 
 
 		 420 aa  52.4  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  27.53 
 
 		 435 aa  52  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  24.34 
 
 		 441 aa  52.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0905  extracellular solute-binding protein  21.6 
 
 		 412 aa  50.8  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  23.79 
 
 		 422 aa  50.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3623  extracellular solute-binding protein family 1  30.73 
 
 		 442 aa  50.4  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00170169  normal  0.0768086 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1956  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  27.17 
 
 		 417 aa  50.4  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.318288  normal  0.222736 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  20.21 
 
 		 408 aa  50.4  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2337  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 411 aa  50.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.836128  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1015  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.97 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3935  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 		 420 aa  49.7  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0774395  normal  0.611638 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1862  extracellular solute-binding protein  22.67 
 
 		 430 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144249  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.63 
 
 		 407 aa  49.3  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2098  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 411 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.072788 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  24.53 
 
 		 434 aa  48.9  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1053  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 		 428 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00219882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3170  extracellular solute-binding protein  28.16 
 
 		 414 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  25.45 
 
 		 427 aa  49.3  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  24.66 
 
 		 410 aa  48.9  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7939  ABC transporter (substrate-binding protein)  22.75 
 
 		 428 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  0.560439 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0693  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.75 
 
 		 421 aa  48.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0998966  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4370  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 		 433 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.878399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  26.58 
 
 		 424 aa  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2284  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  24.29 
 
 		 410 aa  48.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.61221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  24.03 
 
 		 442 aa  48.5  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  21.74 
 
 		 428 aa  48.5  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  22.99 
 
 		 423 aa  48.5  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2137  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 		 467 aa  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0556  ABC transporter, solute-binding protein  26.35 
 
 		 461 aa  47.8  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  25.08 
 
 		 433 aa  47.8  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0540  ABC transporter, substrate-binding protein  26.35 
 
 		 461 aa  47.8  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2047  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.74 
 
 		 479 aa  47.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  20.9 
 
 		 408 aa  47.4  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>