170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3182 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0267  extracellular solute-binding protein family 1  74.67 
 
 
462 aa  704    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.39283  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3182  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
464 aa  938    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.145583 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3914  extracellular solute-binding protein  62.58 
 
 
457 aa  566  1e-160  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01750  carbohydrate-binding protein  61.11 
 
 
457 aa  547  1e-154  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110954  normal  0.899537 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3237  extracellular solute-binding protein family 1  56.56 
 
 
464 aa  501  1e-140  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7166  alpha-glucoside ABC transporter  53.66 
 
 
451 aa  481  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5758  extracellular solute-binding protein family 1  55.61 
 
 
498 aa  473  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal  0.192043 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3587  extracellular solute-binding protein  53.88 
 
 
447 aa  472  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.69287  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3967  extracellular solute-binding protein  54 
 
 
448 aa  471  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182057  normal  0.154584 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4648  extracellular solute-binding protein family 1  49.78 
 
 
448 aa  441  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000260895 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2337  ABC-type glucosylglycerol transport system substrate-binding protein  54.12 
 
 
448 aa  433  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176838  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5152  extracellular solute-binding protein family 1  52.66 
 
 
482 aa  397  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1180  extracellular solute-binding protein  43.13 
 
 
485 aa  304  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2855  extracellular solute-binding protein  40.33 
 
 
451 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1652  putative solute-binding protein 1 family  39.39 
 
 
452 aa  271  1e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182094  hitchhiker  0.00000465499 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1946  extracellular solute-binding protein  40.09 
 
 
449 aa  265  1e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0387  extracellular solute-binding protein family 1  38.59 
 
 
453 aa  264  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4345  extracellular solute-binding protein  41.24 
 
 
450 aa  264  3e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0355  extracellular solute-binding protein family 1  37.73 
 
 
453 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2873  ABC alpha-glucoside transporter, perplasmic substrate-binding protein  41.34 
 
 
450 aa  259  9e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182804  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1519  extracellular solute-binding protein  40.9 
 
 
450 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  0.200847 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0292  extracellular solute-binding protein  37.79 
 
 
452 aa  258  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3307  extracellular solute-binding protein  40.24 
 
 
449 aa  256  6e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1147  extracellular solute-binding protein  37.61 
 
 
544 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2910  ABC alpha-glucoside transporter extracellular solute-binding protein, family 1  35.87 
 
 
452 aa  248  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.320115 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0785  ABC transporter substrate binding protein (alpha-glucoside)  34.47 
 
 
452 aa  247  4e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13200  extracellular solute-binding protein family 1  34.05 
 
 
424 aa  241  2.9999999999999997e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14550  extracellular solute-binding protein family 1  37.44 
 
 
432 aa  241  2.9999999999999997e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000299418  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3716  extracellular solute-binding protein family 1  33.69 
 
 
440 aa  220  5e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26130  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  31.78 
 
 
448 aa  205  2e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0719829  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2626  extracellular solute-binding protein family 1  33.7 
 
 
455 aa  193  5e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0491272  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0869  extracellular solute-binding protein family 1  31.92 
 
 
436 aa  176  6e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.293785 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1625  alpha-glucoside ABC transporter periplasmic- binding protein  31.07 
 
 
442 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.234885  normal  0.190993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2151  extracellular solute-binding protein family 1  31.11 
 
 
466 aa  154  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2325  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 
444 aa  151  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032194  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2936  extracellular solute-binding protein family 1  31.89 
 
 
447 aa  124  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0402  extracellular solute-binding protein family 1  25.91 
 
 
447 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2534  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 
404 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.478006  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2914  extracellular solute-binding protein family 1  29.9 
 
 
440 aa  84.3  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
431 aa  73.2  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 
435 aa  70.5  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 
434 aa  68.2  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  32.71 
 
 
422 aa  67.4  0.0000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  26.2 
 
 
424 aa  66.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1862  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 
430 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144249  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  26.11 
 
 
441 aa  64.7  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2234  extracellular solute-binding protein family 1  32.76 
 
 
419 aa  63.2  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  22.39 
 
 
417 aa  61.6  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  26.52 
 
 
441 aa  61.6  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  25.63 
 
 
433 aa  59.7  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  25.74 
 
 
427 aa  59.3  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 
441 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  28.7 
 
 
445 aa  59.3  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.83 
 
 
435 aa  57.8  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  28.09 
 
 
448 aa  56.6  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3623  extracellular solute-binding protein family 1  31.55 
 
 
442 aa  56.2  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00170169  normal  0.0768086 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  26.05 
 
 
442 aa  55.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  27.41 
 
 
434 aa  55.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1956  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  28.35 
 
 
417 aa  55.5  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.318288  normal  0.222736 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.79 
 
 
438 aa  55.1  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 
421 aa  55.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0849  extracellular solute-binding protein  21.76 
 
 
434 aa  54.3  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0177782  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4906  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 
438 aa  54.7  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.507884  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4984  extracellular solute-binding protein family 1  24.15 
 
 
428 aa  54.7  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7939  ABC transporter (substrate-binding protein)  22.66 
 
 
428 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  0.560439 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5137  extracellular solute-binding protein  28.77 
 
 
433 aa  54.3  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.319423  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  23.49 
 
 
408 aa  54.3  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3657  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  25.28 
 
 
423 aa  53.9  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 
415 aa  53.9  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17020  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  33.63 
 
 
431 aa  53.9  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00301962  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0127  extracellular solute-binding protein family 1  26.26 
 
 
442 aa  53.5  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 
415 aa  53.1  0.000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0556  ABC transporter, solute-binding protein  27.27 
 
 
461 aa  53.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0540  ABC transporter, substrate-binding protein  27.27 
 
 
461 aa  53.1  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  25.27 
 
 
429 aa  52.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3169  extracellular solute-binding protein family 1  25.16 
 
 
445 aa  53.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187022 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2416  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 
417 aa  52.4  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.230559  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  21.92 
 
 
468 aa  52.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2284  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  27.04 
 
 
410 aa  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.61221  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5673  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 
435 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0285739  normal  0.0925972 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  22.73 
 
 
410 aa  52.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3554  putative ABC transporter periplasmic-binding protein  27.95 
 
 
440 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263542  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3170  extracellular solute-binding protein  29.17 
 
 
414 aa  51.6  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2327  extracellular solute-binding protein family 1  29.73 
 
 
424 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169538  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  23.1 
 
 
495 aa  50.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 
408 aa  50.8  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  27.86 
 
 
451 aa  50.4  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0168  extracellular solute-binding protein family 1  24.53 
 
 
412 aa  50.1  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  22.53 
 
 
442 aa  50.1  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1413  extracellular solute-binding protein family 1  22.98 
 
 
436 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
427 aa  50.1  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.16 
 
 
421 aa  49.7  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0092  extracellular solute-binding protein  27.56 
 
 
425 aa  49.7  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  24.63 
 
 
420 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  24.63 
 
 
420 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  24 
 
 
452 aa  49.3  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  29.89 
 
 
408 aa  49.3  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  24.63 
 
 
419 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1941  extracellular solute-binding protein family 1  24.26 
 
 
487 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.948884  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0637  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
425 aa  49.3  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>