89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2873 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1147  extracellular solute-binding protein  88.22 
 
 		 544 aa  808    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2873  ABC alpha-glucoside transporter, perplasmic substrate-binding protein  100 
 
 		 450 aa  906    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182804  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3307  extracellular solute-binding protein  66.67 
 
 		 449 aa  636    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1519  extracellular solute-binding protein  99.11 
 
 		 450 aa  902    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  0.200847 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2855  extracellular solute-binding protein  67.42 
 
 		 451 aa  639    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2910  ABC alpha-glucoside transporter extracellular solute-binding protein, family 1  66.59 
 
 		 452 aa  630  1e-179  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.320115 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0292  extracellular solute-binding protein  68.84 
 
 		 452 aa  621  1e-177  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0785  ABC transporter substrate binding protein (alpha-glucoside)  62.39 
 
 		 452 aa  607  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4345  extracellular solute-binding protein  61.11 
 
 		 450 aa  596  1e-169  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0355  extracellular solute-binding protein family 1  64.73 
 
 		 453 aa  593  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0387  extracellular solute-binding protein family 1  63.81 
 
 		 453 aa  587  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1652  putative solute-binding protein 1 family  63.28 
 
 		 452 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182094  hitchhiker  0.00000465499 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1946  extracellular solute-binding protein  63.03 
 
 		 449 aa  547  1e-154  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14550  extracellular solute-binding protein family 1  44.23 
 
 		 432 aa  342  7e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000299418  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1180  extracellular solute-binding protein  44.2 
 
 		 485 aa  329  5.0000000000000004e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13200  extracellular solute-binding protein family 1  42.68 
 
 		 424 aa  319  5e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3914  extracellular solute-binding protein  39.52 
 
 		 457 aa  266  5.999999999999999e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7166  alpha-glucoside ABC transporter  38.61 
 
 		 451 aa  260  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3716  extracellular solute-binding protein family 1  40.98 
 
 		 440 aa  261  3e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3182  extracellular solute-binding protein family 1  41.34 
 
 		 464 aa  259  1e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.145583 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3587  extracellular solute-binding protein  37.75 
 
 		 447 aa  258  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.69287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3967  extracellular solute-binding protein  37.07 
 
 		 448 aa  257  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182057  normal  0.154584 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2337  ABC-type glucosylglycerol transport system substrate-binding protein  39.01 
 
 		 448 aa  256  4e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176838  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0267  extracellular solute-binding protein family 1  37.5 
 
 		 462 aa  251  2e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.39283  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01750  carbohydrate-binding protein  37.2 
 
 		 457 aa  249  9e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110954  normal  0.899537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5758  extracellular solute-binding protein family 1  37.59 
 
 		 498 aa  248  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal  0.192043 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3237  extracellular solute-binding protein family 1  37.5 
 
 		 464 aa  246  6.999999999999999e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26130  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  34.84 
 
 		 448 aa  239  5e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0719829  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4648  extracellular solute-binding protein family 1  35.64 
 
 		 448 aa  238  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000260895 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5152  extracellular solute-binding protein family 1  35.04 
 
 		 482 aa  237  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2325  extracellular solute-binding protein family 1  35.71 
 
 		 444 aa  207  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032194  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0869  extracellular solute-binding protein family 1  31.59 
 
 		 436 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.293785 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2151  extracellular solute-binding protein family 1  32.43 
 
 		 466 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2936  extracellular solute-binding protein family 1  34.21 
 
 		 447 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2626  extracellular solute-binding protein family 1  33.85 
 
 		 455 aa  181  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0491272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1625  alpha-glucoside ABC transporter periplasmic- binding protein  30.99 
 
 		 442 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.234885  normal  0.190993 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2534  extracellular solute-binding protein family 1  32.03 
 
 		 404 aa  155  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.478006  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0402  extracellular solute-binding protein family 1  29.9 
 
 		 447 aa  151  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5673  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 		 435 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0285739  normal  0.0925972 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2234  extracellular solute-binding protein family 1  24.38 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3169  extracellular solute-binding protein family 1  27.87 
 
 		 445 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187022 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  25.91 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  23.1 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  23.45 
 
 		 441 aa  67.4  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3379  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 		 445 aa  66.6  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4906  extracellular solute-binding protein family 1  29.27 
 
 		 438 aa  64.7  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.507884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  24.5 
 
 		 445 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  28.65 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  24.71 
 
 		 431 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  27.51 
 
 		 442 aa  57.4  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4984  extracellular solute-binding protein family 1  25.34 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  24.25 
 
 		 434 aa  56.2  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  24.31 
 
 		 434 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2914  extracellular solute-binding protein family 1  28.81 
 
 		 440 aa  55.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  28.5 
 
 		 493 aa  55.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  24.56 
 
 		 414 aa  55.1  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 		 451 aa  54.3  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1588  extracellular solute-binding protein  22.43 
 
 		 452 aa  53.1  0.000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  23.88 
 
 		 435 aa  53.1  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0616  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 432 aa  52.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 		 427 aa  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  22.9 
 
 		 422 aa  52.4  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  28.15 
 
 		 410 aa  52.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  30.39 
 
 		 424 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 422 aa  51.6  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  21.64 
 
 		 408 aa  51.6  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2327  extracellular solute-binding protein family 1  29.41 
 
 		 424 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.65 
 
 		 435 aa  50.4  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3469  extracellular solute-binding protein family 1  26.37 
 
 		 446 aa  49.3  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1001  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 		 427 aa  48.5  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.628257  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2404  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 		 424 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.57 
 
 		 427 aa  48.1  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 429 aa  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  28.42 
 
 		 413 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0477  extracellular solute-binding protein family 1  26.43 
 
 		 432 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  28.42 
 
 		 399 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3657  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  28.44 
 
 		 423 aa  47  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  24.53 
 
 		 448 aa  46.6  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  23.32 
 
 		 495 aa  46.6  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  25.77 
 
 		 441 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.29 
 
 		 428 aa  45.8  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  22.49 
 
 		 421 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 		 420 aa  45.8  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  25.97 
 
 		 424 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  21.79 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  27.84 
 
 		 444 aa  43.9  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4758  extracellular solute-binding protein family 1  29.95 
 
 		 417 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  23.92 
 
 		 419 aa  43.1  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  26.51 
 
 		 442 aa  43.1  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>