171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2234 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_2234  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 419 aa  824    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1588  extracellular solute-binding protein  35.49 
 
 		 452 aa  227  3e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  36.26 
 
 		 422 aa  218  1e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  23.63 
 
 		 417 aa  93.6  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2151  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 466 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  25.28 
 
 		 414 aa  89.4  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2855  extracellular solute-binding protein  24.72 
 
 		 451 aa  89  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0292  extracellular solute-binding protein  25.28 
 
 		 452 aa  87.8  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2936  extracellular solute-binding protein family 1  27.7 
 
 		 447 aa  87.8  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14550  extracellular solute-binding protein family 1  24.45 
 
 		 432 aa  85.1  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000299418  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  22.97 
 
 		 431 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13200  extracellular solute-binding protein family 1  23.67 
 
 		 424 aa  82.4  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4345  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 450 aa  81.3  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0355  extracellular solute-binding protein family 1  23.86 
 
 		 453 aa  80.1  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1946  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 		 449 aa  79.3  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2325  extracellular solute-binding protein family 1  24.34 
 
 		 444 aa  79  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032194  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3307  extracellular solute-binding protein  23.88 
 
 		 449 aa  78.6  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0387  extracellular solute-binding protein family 1  23.21 
 
 		 453 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  23.88 
 
 		 424 aa  77.8  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0785  ABC transporter substrate binding protein (alpha-glucoside)  23.38 
 
 		 452 aa  76.6  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 		 412 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2327  extracellular solute-binding protein family 1  24.08 
 
 		 424 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2337  ABC-type glucosylglycerol transport system substrate-binding protein  27.76 
 
 		 448 aa  74.7  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176838  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2873  ABC alpha-glucoside transporter, perplasmic substrate-binding protein  24.93 
 
 		 450 aa  74.7  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182804  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  21.55 
 
 		 434 aa  73.9  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  23.64 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0616  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 432 aa  73.6  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 		 412 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  22.13 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1147  extracellular solute-binding protein  23.65 
 
 		 544 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  21.01 
 
 		 414 aa  72.8  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2910  ABC alpha-glucoside transporter extracellular solute-binding protein, family 1  22.51 
 
 		 452 aa  71.6  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.320115 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1519  extracellular solute-binding protein  23.82 
 
 		 450 aa  71.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  0.200847 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 419 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  28.04 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0996  extracellular solute-binding protein family 1  27.89 
 
 		 455 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0869  extracellular solute-binding protein family 1  24.2 
 
 		 436 aa  70.5  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.293785 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  28.04 
 
 		 420 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  28.04 
 
 		 420 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0434  extracellular solute-binding protein family 1  34.13 
 
 		 444 aa  70.1  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  24.06 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  28.04 
 
 		 419 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3483  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 		 417 aa  69.3  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 		 419 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1652  putative solute-binding protein 1 family  24.71 
 
 		 452 aa  68.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182094  hitchhiker  0.00000465499 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.88 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.283496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7166  alpha-glucoside ABC transporter  26.67 
 
 		 451 aa  67.4  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3587  extracellular solute-binding protein  29.94 
 
 		 447 aa  67  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.69287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  23.26 
 
 		 415 aa  67  0.0000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  27.69 
 
 		 427 aa  66.2  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26130  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.25 
 
 		 448 aa  66.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0719829  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  26.5 
 
 		 417 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0267  extracellular solute-binding protein family 1  31.07 
 
 		 462 aa  65.5  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.39283  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3169  extracellular solute-binding protein family 1  23.5 
 
 		 445 aa  64.7  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187022 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  23.63 
 
 		 451 aa  64.3  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1625  alpha-glucoside ABC transporter periplasmic- binding protein  22.29 
 
 		 442 aa  64.3  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.234885  normal  0.190993 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3182  extracellular solute-binding protein family 1  32.76 
 
 		 464 aa  63.2  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.145583 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3451  ABC sugar (maltose) transporter, periplasmic ligand binding protein  23.64 
 
 		 415 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  36.97 
 
 		 428 aa  61.6  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3379  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 		 445 aa  62  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3967  extracellular solute-binding protein  29.56 
 
 		 448 aa  62  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182057  normal  0.154584 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5137  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 		 433 aa  61.6  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.319423  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4648  extracellular solute-binding protein family 1  28.29 
 
 		 448 aa  61.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000260895 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0208  putative extracellular solute-binding protein  24.26 
 
 		 458 aa  61.2  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0085185  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  25.13 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  27.21 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3914  extracellular solute-binding protein  33.04 
 
 		 457 aa  58.9  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3237  extracellular solute-binding protein family 1  27.11 
 
 		 464 aa  59.7  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4906  extracellular solute-binding protein family 1  29.02 
 
 		 438 aa  59.3  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.507884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1028  extracellular solute-binding protein family 1  23.83 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00732462  normal  0.0899654 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  24.03 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1110  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139598  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  24.03 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0477  extracellular solute-binding protein family 1  23.92 
 
 		 432 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0628  extracellular solute-binding protein  22.77 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6328  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5758  extracellular solute-binding protein family 1  26.18 
 
 		 498 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal  0.192043 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2520  extracellular solute-binding protein family 1  24.4 
 
 		 452 aa  57.4  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2191  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.38 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.537651  hitchhiker  0.00669154 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0998  extracellular solute-binding protein family 1  25.52 
 
 		 451 aa  56.6  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5027  extracellular solute-binding protein family 1  26.4 
 
 		 434 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0894368  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  27.97 
 
 		 441 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1180  extracellular solute-binding protein  22.38 
 
 		 485 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0402  extracellular solute-binding protein family 1  22.02 
 
 		 447 aa  54.7  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  23.6 
 
 		 468 aa  54.7  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2762  extracellular solute-binding protein  23.44 
 
 		 431 aa  54.7  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1001  extracellular solute-binding protein family 1  24.39 
 
 		 427 aa  54.3  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.628257  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  20.3 
 
 		 422 aa  54.3  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2626  extracellular solute-binding protein family 1  24.31 
 
 		 455 aa  53.9  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0491272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4071  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  23.42 
 
 		 415 aa  53.5  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00185695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  21.59 
 
 		 455 aa  53.5  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2430  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 		 415 aa  53.1  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.682399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0860  extracellular solute-binding protein family 1  24.9 
 
 		 415 aa  53.1  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0321479  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3838  extracellular solute-binding protein  23.72 
 
 		 420 aa  52.8  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  22.22 
 
 		 424 aa  53.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0828  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 		 415 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00532301  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  36.04 
 
 		 433 aa  52.8  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  26.35 
 
 		 441 aa  51.6  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>