276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_13200 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_13200  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
424 aa  865    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14550  extracellular solute-binding protein family 1  58.54 
 
 
432 aa  522  1e-147  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000299418  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1147  extracellular solute-binding protein  42.68 
 
 
544 aa  324  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1180  extracellular solute-binding protein  39.75 
 
 
485 aa  322  7e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2873  ABC alpha-glucoside transporter, perplasmic substrate-binding protein  42.68 
 
 
450 aa  319  5e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182804  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1519  extracellular solute-binding protein  42.68 
 
 
450 aa  319  7e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  0.200847 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0292  extracellular solute-binding protein  40.6 
 
 
452 aa  309  5e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0785  ABC transporter substrate binding protein (alpha-glucoside)  40.2 
 
 
452 aa  308  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0387  extracellular solute-binding protein family 1  40.35 
 
 
453 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0355  extracellular solute-binding protein family 1  40.35 
 
 
453 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2855  extracellular solute-binding protein  39.8 
 
 
451 aa  301  1e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4345  extracellular solute-binding protein  39.29 
 
 
450 aa  295  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3307  extracellular solute-binding protein  38.19 
 
 
449 aa  287  2e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2910  ABC alpha-glucoside transporter extracellular solute-binding protein, family 1  38.1 
 
 
452 aa  286  7e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.320115 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3716  extracellular solute-binding protein family 1  40.83 
 
 
440 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1652  putative solute-binding protein 1 family  37.91 
 
 
452 aa  270  5e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182094  hitchhiker  0.00000465499 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1946  extracellular solute-binding protein  36.02 
 
 
449 aa  268  1e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3587  extracellular solute-binding protein  34.38 
 
 
447 aa  251  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.69287  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3967  extracellular solute-binding protein  35.84 
 
 
448 aa  247  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182057  normal  0.154584 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7166  alpha-glucoside ABC transporter  35.61 
 
 
451 aa  246  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2337  ABC-type glucosylglycerol transport system substrate-binding protein  35.26 
 
 
448 aa  246  6.999999999999999e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176838  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3914  extracellular solute-binding protein  35.47 
 
 
457 aa  245  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26130  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  33 
 
 
448 aa  242  1e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0719829  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01750  carbohydrate-binding protein  37.7 
 
 
457 aa  241  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110954  normal  0.899537 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3182  extracellular solute-binding protein family 1  37.63 
 
 
464 aa  239  5e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.145583 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2325  extracellular solute-binding protein family 1  37.3 
 
 
444 aa  238  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032194  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5758  extracellular solute-binding protein family 1  35.49 
 
 
498 aa  236  6e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal  0.192043 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0869  extracellular solute-binding protein family 1  35.52 
 
 
436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.293785 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4648  extracellular solute-binding protein family 1  34.18 
 
 
448 aa  219  6e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000260895 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5152  extracellular solute-binding protein family 1  34.95 
 
 
482 aa  215  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1625  alpha-glucoside ABC transporter periplasmic- binding protein  34.7 
 
 
442 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.234885  normal  0.190993 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0267  extracellular solute-binding protein family 1  34.73 
 
 
462 aa  213  7.999999999999999e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.39283  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2626  extracellular solute-binding protein family 1  32.88 
 
 
455 aa  206  6e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0491272  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0402  extracellular solute-binding protein family 1  32.39 
 
 
447 aa  204  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2936  extracellular solute-binding protein family 1  30.69 
 
 
447 aa  203  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2151  extracellular solute-binding protein family 1  32.13 
 
 
466 aa  203  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3237  extracellular solute-binding protein family 1  33.42 
 
 
464 aa  202  8e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2534  extracellular solute-binding protein family 1  30.17 
 
 
404 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.478006  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  27.32 
 
 
495 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  26.1 
 
 
417 aa  107  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  27.13 
 
 
434 aa  98.2  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5673  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 
435 aa  96.7  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0285739  normal  0.0925972 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  28.31 
 
 
422 aa  92.8  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  27.46 
 
 
442 aa  91.7  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5137  extracellular solute-binding protein  23.72 
 
 
433 aa  90.9  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.319423  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  26.04 
 
 
427 aa  89.4  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 
422 aa  89.4  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  23.21 
 
 
431 aa  89  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  24.81 
 
 
434 aa  88.6  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2112  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 
473 aa  87.8  3e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28 
 
 
435 aa  87  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 
427 aa  87  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  25.64 
 
 
423 aa  86.7  7e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 
429 aa  85.5  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2342  extracellular solute-binding protein  26.98 
 
 
477 aa  84  0.000000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.936887  normal  0.0125511 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  23.12 
 
 
422 aa  82.8  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0616  extracellular solute-binding protein family 1  23 
 
 
432 aa  82  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2234  extracellular solute-binding protein family 1  23.45 
 
 
419 aa  82  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1588  extracellular solute-binding protein  24.69 
 
 
452 aa  81.6  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  22.37 
 
 
435 aa  82  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  25.46 
 
 
445 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.41 
 
 
438 aa  80.5  0.00000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3657  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  24.79 
 
 
423 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  23.01 
 
 
408 aa  77.8  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  24.72 
 
 
448 aa  77  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7939  ABC transporter (substrate-binding protein)  22.08 
 
 
428 aa  77  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  0.560439 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  22.76 
 
 
408 aa  76.6  0.0000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  23.71 
 
 
441 aa  75.9  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  26.52 
 
 
424 aa  75.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3469  extracellular solute-binding protein family 1  23.45 
 
 
446 aa  75.9  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 
420 aa  75.1  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 
408 aa  75.1  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 
442 aa  75.1  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 
455 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  23.78 
 
 
432 aa  71.2  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  24.91 
 
 
441 aa  70.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  22.48 
 
 
435 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  26.34 
 
 
410 aa  70.1  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1136  extracellular solute-binding protein family 1  24.56 
 
 
431 aa  69.7  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1001  extracellular solute-binding protein family 1  23.96 
 
 
427 aa  69.7  0.00000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.628257  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  22.15 
 
 
424 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0477  extracellular solute-binding protein family 1  26.04 
 
 
432 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838392  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3169  extracellular solute-binding protein family 1  23.33 
 
 
445 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187022 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  22.44 
 
 
428 aa  67.8  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4906  extracellular solute-binding protein family 1  23.73 
 
 
438 aa  66.6  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.507884  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  28.41 
 
 
434 aa  66.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2327  extracellular solute-binding protein family 1  21.85 
 
 
424 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169538  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  22.74 
 
 
427 aa  64.7  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  24.56 
 
 
441 aa  64.7  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  22.91 
 
 
441 aa  64.3  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  21.27 
 
 
415 aa  64.3  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0540  ABC transporter, substrate-binding protein  24.73 
 
 
461 aa  63.5  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 
415 aa  63.2  0.000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3379  extracellular solute-binding protein  23.85 
 
 
445 aa  63.2  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 
451 aa  63.2  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0905  extracellular solute-binding protein  22.84 
 
 
412 aa  62  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  24.57 
 
 
454 aa  61.6  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0556  ABC transporter, solute-binding protein  24.46 
 
 
461 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  29.03 
 
 
451 aa  62  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  23.03 
 
 
493 aa  61.6  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>