218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7166 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7166  alpha-glucoside ABC transporter  100 
 
 
451 aa  916    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3967  extracellular solute-binding protein  66.96 
 
 
448 aa  635    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182057  normal  0.154584 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3587  extracellular solute-binding protein  64 
 
 
447 aa  608  1e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.69287  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2337  ABC-type glucosylglycerol transport system substrate-binding protein  59.18 
 
 
448 aa  535  1e-151  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176838  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3914  extracellular solute-binding protein  58.22 
 
 
457 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4648  extracellular solute-binding protein family 1  54.99 
 
 
448 aa  509  1e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000260895 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3182  extracellular solute-binding protein family 1  53.66 
 
 
464 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.145583 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0267  extracellular solute-binding protein family 1  52.38 
 
 
462 aa  457  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.39283  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3237  extracellular solute-binding protein family 1  48.58 
 
 
464 aa  440  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5758  extracellular solute-binding protein family 1  48.81 
 
 
498 aa  427  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal  0.192043 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01750  carbohydrate-binding protein  50.23 
 
 
457 aa  422  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110954  normal  0.899537 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5152  extracellular solute-binding protein family 1  49.88 
 
 
482 aa  399  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1180  extracellular solute-binding protein  44.44 
 
 
485 aa  325  7e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0355  extracellular solute-binding protein family 1  40 
 
 
453 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0387  extracellular solute-binding protein family 1  40 
 
 
453 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4345  extracellular solute-binding protein  39.46 
 
 
450 aa  278  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2910  ABC alpha-glucoside transporter extracellular solute-binding protein, family 1  39.04 
 
 
452 aa  278  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.320115 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2855  extracellular solute-binding protein  35.84 
 
 
451 aa  272  8.000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0292  extracellular solute-binding protein  38.28 
 
 
452 aa  271  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1147  extracellular solute-binding protein  38.37 
 
 
544 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3307  extracellular solute-binding protein  36 
 
 
449 aa  262  6.999999999999999e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1519  extracellular solute-binding protein  38.61 
 
 
450 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  0.200847 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2873  ABC alpha-glucoside transporter, perplasmic substrate-binding protein  38.61 
 
 
450 aa  260  3e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182804  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1652  putative solute-binding protein 1 family  37.62 
 
 
452 aa  257  3e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182094  hitchhiker  0.00000465499 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0785  ABC transporter substrate binding protein (alpha-glucoside)  36.25 
 
 
452 aa  255  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14550  extracellular solute-binding protein family 1  35.9 
 
 
432 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000299418  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1946  extracellular solute-binding protein  35.87 
 
 
449 aa  251  1e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13200  extracellular solute-binding protein family 1  35.61 
 
 
424 aa  246  4.9999999999999997e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3716  extracellular solute-binding protein family 1  36.73 
 
 
440 aa  246  8e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26130  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  34.75 
 
 
448 aa  228  1e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0719829  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1625  alpha-glucoside ABC transporter periplasmic- binding protein  33.51 
 
 
442 aa  189  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.234885  normal  0.190993 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0869  extracellular solute-binding protein family 1  32.04 
 
 
436 aa  189  7e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.293785 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2325  extracellular solute-binding protein family 1  33.6 
 
 
444 aa  176  6e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032194  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2626  extracellular solute-binding protein family 1  30.75 
 
 
455 aa  175  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0491272  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2151  extracellular solute-binding protein family 1  29.35 
 
 
466 aa  164  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2936  extracellular solute-binding protein family 1  30.42 
 
 
447 aa  141  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2534  extracellular solute-binding protein family 1  27.54 
 
 
404 aa  125  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.478006  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0402  extracellular solute-binding protein family 1  23.72 
 
 
447 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  22.94 
 
 
431 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  25.48 
 
 
434 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  23.21 
 
 
417 aa  74.3  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 
435 aa  73.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1862  extracellular solute-binding protein  22.36 
 
 
430 aa  71.6  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144249  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  27.04 
 
 
495 aa  70.5  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  27.09 
 
 
442 aa  70.5  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  29.68 
 
 
422 aa  70.1  0.00000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  30.14 
 
 
451 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3169  extracellular solute-binding protein family 1  25.55 
 
 
445 aa  68.2  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187022 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2914  extracellular solute-binding protein family 1  25.17 
 
 
440 aa  68.2  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 
441 aa  68.6  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  25.58 
 
 
441 aa  67.8  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 
434 aa  67.4  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2234  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 
419 aa  67.4  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.2 
 
 
435 aa  66.6  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 
415 aa  65.9  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  25.93 
 
 
424 aa  66.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  25.73 
 
 
441 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  25.58 
 
 
414 aa  65.1  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  25.35 
 
 
434 aa  63.9  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 
427 aa  62.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1941  extracellular solute-binding protein family 1  25.48 
 
 
487 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.948884  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  29.14 
 
 
493 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  29.29 
 
 
441 aa  61.6  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  25.23 
 
 
428 aa  61.6  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  23.38 
 
 
412 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  23.38 
 
 
412 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.46 
 
 
438 aa  61.2  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  24.35 
 
 
448 aa  60.8  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3815  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 
440 aa  60.5  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.725217  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  28.21 
 
 
423 aa  60.1  0.00000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0168  extracellular solute-binding protein family 1  25.96 
 
 
412 aa  59.7  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 
441 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  22.16 
 
 
408 aa  59.3  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 
427 aa  59.7  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  23.45 
 
 
408 aa  59.3  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  25.41 
 
 
468 aa  58.9  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6265  extracellular solute-binding protein family 1  26.34 
 
 
443 aa  58.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0654  extracellular solute-binding protein family 1  24.52 
 
 
554 aa  58.2  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  27.41 
 
 
413 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0998  extracellular solute-binding protein family 1  25.29 
 
 
451 aa  58.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  27.41 
 
 
399 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  29.24 
 
 
429 aa  58.2  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  22.52 
 
 
455 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2380  extracellular solute-binding protein family 1  23.58 
 
 
415 aa  58.2  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  26.14 
 
 
454 aa  57.8  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  24.63 
 
 
422 aa  57.8  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0905  extracellular solute-binding protein  28 
 
 
412 aa  57.4  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  31.13 
 
 
445 aa  57.4  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  23.28 
 
 
432 aa  57.4  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5673  extracellular solute-binding protein family 1  23.19 
 
 
435 aa  57.4  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0285739  normal  0.0925972 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  26.42 
 
 
441 aa  57  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2094  extracellular solute-binding protein family 1  25.52 
 
 
441 aa  56.6  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000152964 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  24.73 
 
 
442 aa  56.6  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  23.88 
 
 
410 aa  56.6  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0127  extracellular solute-binding protein family 1  24.65 
 
 
442 aa  56.2  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0556  ABC transporter, solute-binding protein  31.11 
 
 
461 aa  56.2  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3379  extracellular solute-binding protein  23.5 
 
 
445 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0477  extracellular solute-binding protein family 1  26.02 
 
 
432 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838392  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 
415 aa  56.2  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0540  ABC transporter, substrate-binding protein  31.11 
 
 
461 aa  55.5  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>