91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4345 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4345  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
450 aa  916    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2910  ABC alpha-glucoside transporter extracellular solute-binding protein, family 1  69.47 
 
 
452 aa  659    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.320115 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0785  ABC transporter substrate binding protein (alpha-glucoside)  67.04 
 
 
452 aa  631  1e-180  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3307  extracellular solute-binding protein  64.67 
 
 
449 aa  630  1e-179  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2855  extracellular solute-binding protein  64.75 
 
 
451 aa  630  1e-179  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0292  extracellular solute-binding protein  65.49 
 
 
452 aa  604  9.999999999999999e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2873  ABC alpha-glucoside transporter, perplasmic substrate-binding protein  61.11 
 
 
450 aa  596  1e-169  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182804  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0355  extracellular solute-binding protein family 1  63.58 
 
 
453 aa  597  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1519  extracellular solute-binding protein  61.33 
 
 
450 aa  597  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  0.200847 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0387  extracellular solute-binding protein family 1  63.13 
 
 
453 aa  591  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1147  extracellular solute-binding protein  60.22 
 
 
544 aa  590  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1652  putative solute-binding protein 1 family  61.54 
 
 
452 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182094  hitchhiker  0.00000465499 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1946  extracellular solute-binding protein  59.48 
 
 
449 aa  530  1e-149  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1180  extracellular solute-binding protein  43.84 
 
 
485 aa  346  6e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14550  extracellular solute-binding protein family 1  42.31 
 
 
432 aa  333  3e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000299418  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13200  extracellular solute-binding protein family 1  39.29 
 
 
424 aa  295  1e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7166  alpha-glucoside ABC transporter  39.46 
 
 
451 aa  278  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4648  extracellular solute-binding protein family 1  38.24 
 
 
448 aa  278  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000260895 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3914  extracellular solute-binding protein  39.43 
 
 
457 aa  276  5e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3587  extracellular solute-binding protein  38.65 
 
 
447 aa  268  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.69287  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3967  extracellular solute-binding protein  36.83 
 
 
448 aa  265  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182057  normal  0.154584 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0267  extracellular solute-binding protein family 1  37.42 
 
 
462 aa  264  3e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.39283  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3182  extracellular solute-binding protein family 1  41.24 
 
 
464 aa  264  3e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.145583 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3716  extracellular solute-binding protein family 1  38.88 
 
 
440 aa  257  3e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2337  ABC-type glucosylglycerol transport system substrate-binding protein  36.41 
 
 
448 aa  256  7e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176838  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5758  extracellular solute-binding protein family 1  36.36 
 
 
498 aa  255  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal  0.192043 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5152  extracellular solute-binding protein family 1  36.43 
 
 
482 aa  246  8e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26130  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  35.25 
 
 
448 aa  242  1e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0719829  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3237  extracellular solute-binding protein family 1  34.88 
 
 
464 aa  238  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01750  carbohydrate-binding protein  35.32 
 
 
457 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110954  normal  0.899537 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2626  extracellular solute-binding protein family 1  34.23 
 
 
455 aa  206  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0491272  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2325  extracellular solute-binding protein family 1  32.63 
 
 
444 aa  190  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032194  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2151  extracellular solute-binding protein family 1  32.76 
 
 
466 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0869  extracellular solute-binding protein family 1  31.52 
 
 
436 aa  180  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.293785 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1625  alpha-glucoside ABC transporter periplasmic- binding protein  33.07 
 
 
442 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.234885  normal  0.190993 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2534  extracellular solute-binding protein family 1  32.45 
 
 
404 aa  166  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.478006  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2936  extracellular solute-binding protein family 1  26.76 
 
 
447 aa  143  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0402  extracellular solute-binding protein family 1  25.51 
 
 
447 aa  139  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2234  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 
419 aa  81.3  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  31.65 
 
 
427 aa  64.7  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  22.5 
 
 
431 aa  63.9  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  23.96 
 
 
441 aa  63.2  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5673  extracellular solute-binding protein family 1  23.5 
 
 
435 aa  60.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0285739  normal  0.0925972 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  23.51 
 
 
408 aa  60.5  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  23.88 
 
 
434 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  27.23 
 
 
441 aa  58.9  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  23.47 
 
 
422 aa  58.2  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1588  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 
452 aa  57.4  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0849  extracellular solute-binding protein  22.9 
 
 
434 aa  55.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0177782  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 
434 aa  53.1  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  31.51 
 
 
429 aa  53.1  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  21.23 
 
 
417 aa  53.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  27 
 
 
433 aa  52  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3815  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 
440 aa  50.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.725217  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3657  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  24.57 
 
 
423 aa  50.1  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4906  extracellular solute-binding protein family 1  25.96 
 
 
438 aa  50.1  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.507884  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3169  extracellular solute-binding protein family 1  25.7 
 
 
445 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187022 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
421 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  23.69 
 
 
495 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6265  extracellular solute-binding protein family 1  23.04 
 
 
443 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2327  extracellular solute-binding protein family 1  23.26 
 
 
424 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169538  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4984  extracellular solute-binding protein family 1  23.85 
 
 
428 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.43 
 
 
428 aa  47.8  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.09 
 
 
441 aa  47.4  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  28.09 
 
 
493 aa  47  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.13 
 
 
427 aa  46.6  0.0009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  26.82 
 
 
435 aa  46.6  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3379  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 
445 aa  46.6  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  22.05 
 
 
445 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6261  extracellular solute-binding protein family 1  25.4 
 
 
428 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.689417 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 
427 aa  45.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0061  extracellular solute-binding protein family 1  25.23 
 
 
462 aa  45.8  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  26.06 
 
 
414 aa  45.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2042  extracellular solute-binding protein family 1  25.27 
 
 
483 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000305417  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  23.44 
 
 
424 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  31.01 
 
 
451 aa  44.7  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  23.15 
 
 
408 aa  44.3  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5137  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 
433 aa  44.7  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.319423  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3386  extracellular solute-binding protein family 1  20.57 
 
 
440 aa  44.3  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1317  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 
426 aa  43.9  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5027  extracellular solute-binding protein family 1  28.93 
 
 
434 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0894368  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4190  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
431 aa  43.9  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4059  extracellular solute-binding protein family 1  31.13 
 
 
440 aa  43.9  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  25.42 
 
 
417 aa  43.9  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17020  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.45 
 
 
431 aa  43.9  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00301962  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1371  extracellular solute-binding protein family 1  29.65 
 
 
438 aa  43.5  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  25.22 
 
 
434 aa  43.9  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  21.27 
 
 
424 aa  43.5  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3270  extracellular solute-binding protein family 1  20.4 
 
 
435 aa  43.5  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.543416  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2265  extracellular solute-binding protein family 1  22.62 
 
 
418 aa  43.1  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3469  extracellular solute-binding protein family 1  23.79 
 
 
446 aa  43.5  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>