More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2936 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2936  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
447 aa  896    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2151  extracellular solute-binding protein family 1  46.87 
 
 
466 aa  371  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0869  extracellular solute-binding protein family 1  46.48 
 
 
436 aa  362  1e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.293785 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2325  extracellular solute-binding protein family 1  48.12 
 
 
444 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032194  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1625  alpha-glucoside ABC transporter periplasmic- binding protein  44.22 
 
 
442 aa  343  2.9999999999999997e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.234885  normal  0.190993 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2626  extracellular solute-binding protein family 1  44.32 
 
 
455 aa  342  7e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0491272  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1180  extracellular solute-binding protein  34.8 
 
 
485 aa  213  5.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14550  extracellular solute-binding protein family 1  32.51 
 
 
432 aa  209  7e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000299418  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13200  extracellular solute-binding protein family 1  30.69 
 
 
424 aa  204  3e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3716  extracellular solute-binding protein family 1  31.97 
 
 
440 aa  188  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1147  extracellular solute-binding protein  34.15 
 
 
544 aa  187  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2873  ABC alpha-glucoside transporter, perplasmic substrate-binding protein  34.03 
 
 
450 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182804  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26130  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  31.91 
 
 
448 aa  179  5.999999999999999e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0719829  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1519  extracellular solute-binding protein  33.51 
 
 
450 aa  179  9e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  0.200847 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0355  extracellular solute-binding protein family 1  30.87 
 
 
453 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0387  extracellular solute-binding protein family 1  30.61 
 
 
453 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0292  extracellular solute-binding protein  31.58 
 
 
452 aa  172  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2855  extracellular solute-binding protein  30.42 
 
 
451 aa  169  7e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0785  ABC transporter substrate binding protein (alpha-glucoside)  28.31 
 
 
452 aa  167  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3307  extracellular solute-binding protein  29.13 
 
 
449 aa  160  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1946  extracellular solute-binding protein  31.51 
 
 
449 aa  160  6e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7166  alpha-glucoside ABC transporter  28.54 
 
 
451 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2910  ABC alpha-glucoside transporter extracellular solute-binding protein, family 1  28.76 
 
 
452 aa  149  7e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.320115 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3967  extracellular solute-binding protein  29.23 
 
 
448 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182057  normal  0.154584 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1652  putative solute-binding protein 1 family  29.66 
 
 
452 aa  145  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182094  hitchhiker  0.00000465499 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4345  extracellular solute-binding protein  27.15 
 
 
450 aa  143  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3587  extracellular solute-binding protein  29.8 
 
 
447 aa  143  6e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.69287  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5758  extracellular solute-binding protein family 1  29.26 
 
 
498 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal  0.192043 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0267  extracellular solute-binding protein family 1  28.3 
 
 
462 aa  137  4e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.39283  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5673  extracellular solute-binding protein family 1  28.1 
 
 
435 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0285739  normal  0.0925972 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5137  extracellular solute-binding protein  29.23 
 
 
433 aa  135  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.319423  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2337  ABC-type glucosylglycerol transport system substrate-binding protein  28.15 
 
 
448 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176838  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5152  extracellular solute-binding protein family 1  29.72 
 
 
482 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3914  extracellular solute-binding protein  29.16 
 
 
457 aa  127  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3182  extracellular solute-binding protein family 1  31.89 
 
 
464 aa  124  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.145583 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3237  extracellular solute-binding protein family 1  27.81 
 
 
464 aa  123  7e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2534  extracellular solute-binding protein family 1  29.25 
 
 
404 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.478006  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4648  extracellular solute-binding protein family 1  25.78 
 
 
448 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000260895 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01750  carbohydrate-binding protein  28.48 
 
 
457 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110954  normal  0.899537 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0402  extracellular solute-binding protein family 1  27.23 
 
 
447 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  30.47 
 
 
415 aa  101  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  22.97 
 
 
431 aa  99.8  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  24.43 
 
 
434 aa  98.2  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  24.25 
 
 
412 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  24.25 
 
 
412 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  23.92 
 
 
412 aa  95.5  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  24.06 
 
 
412 aa  94.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3657  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  28.64 
 
 
423 aa  92.8  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  25.26 
 
 
417 aa  92.4  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2234  extracellular solute-binding protein family 1  28.16 
 
 
419 aa  91.3  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  23.49 
 
 
455 aa  90.9  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0168  extracellular solute-binding protein family 1  28.04 
 
 
412 aa  90.1  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  22.71 
 
 
421 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  23.9 
 
 
419 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  24.4 
 
 
444 aa  87.8  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 
419 aa  87.8  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 
419 aa  87  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 
420 aa  86.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 
420 aa  86.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  24.56 
 
 
422 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1588  extracellular solute-binding protein  24.08 
 
 
452 aa  85.5  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2380  extracellular solute-binding protein family 1  25.93 
 
 
415 aa  85.5  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  26.39 
 
 
414 aa  84.7  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 
419 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  23.65 
 
 
417 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 
422 aa  82.4  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  22.66 
 
 
495 aa  82  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  26.06 
 
 
454 aa  81.6  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.85 
 
 
438 aa  80.5  0.00000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  22.49 
 
 
435 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  24.42 
 
 
432 aa  79  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  25.22 
 
 
415 aa  78.6  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1248  extracellular solute-binding protein family 1  24.16 
 
 
414 aa  79  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.494424  normal  0.639356 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  22.82 
 
 
408 aa  78.2  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  24.61 
 
 
423 aa  77.4  0.0000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  22.75 
 
 
410 aa  76.3  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  23.85 
 
 
428 aa  74.7  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0905  extracellular solute-binding protein  24.26 
 
 
412 aa  73.9  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7939  ABC transporter (substrate-binding protein)  25.29 
 
 
428 aa  73.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  0.560439 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  26.17 
 
 
424 aa  73.6  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1303  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 
432 aa  73.2  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313179  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  26.43 
 
 
468 aa  71.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  23.48 
 
 
408 aa  70.9  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  27.88 
 
 
429 aa  70.5  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2342  extracellular solute-binding protein  21.31 
 
 
477 aa  70.5  0.00000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.936887  normal  0.0125511 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  24.51 
 
 
441 aa  70.5  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26610  carbohydrate-binding protein  27.44 
 
 
425 aa  70.1  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  27.84 
 
 
445 aa  69.7  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.13 
 
 
427 aa  69.7  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  22.03 
 
 
423 aa  68.6  0.0000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2112  extracellular solute-binding protein  20.21 
 
 
473 aa  68.9  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  22.54 
 
 
408 aa  68.2  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  23.04 
 
 
448 aa  67.4  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  25.47 
 
 
479 aa  66.6  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3483  extracellular solute-binding protein  20.61 
 
 
417 aa  66.2  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  23.68 
 
 
427 aa  65.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  21.85 
 
 
422 aa  64.3  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  23.56 
 
 
442 aa  64.3  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3838  extracellular solute-binding protein  25.85 
 
 
420 aa  63.9  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754768  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  22.69 
 
 
435 aa  63.5  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>