More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2218 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 479 aa  993    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1468  extracellular solute-binding protein family 1  29.87 
 
 		 457 aa  176  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0592  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 		 456 aa  173  5.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000165278  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  28.66 
 
 		 442 aa  166  8e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  30.23 
 
 		 454 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3793  extracellular solute-binding protein family 1  28.12 
 
 		 459 aa  155  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.46649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  29.68 
 
 		 449 aa  152  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  27.73 
 
 		 460 aa  152  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  30.1 
 
 		 422 aa  152  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  27.84 
 
 		 483 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  28.1 
 
 		 420 aa  130  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2513  extracellular solute-binding protein family 1  27.6 
 
 		 441 aa  130  6e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  28.02 
 
 		 427 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  28.85 
 
 		 447 aa  125  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  26.82 
 
 		 443 aa  125  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  28.15 
 
 		 416 aa  120  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  28.15 
 
 		 416 aa  120  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12341  periplasmic sugar-binding lipoprotein uspC  28.16 
 
 		 440 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  27.47 
 
 		 504 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  25 
 
 		 427 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  27.55 
 
 		 421 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12078  sugar-binding lipoprotein  26.82 
 
 		 439 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  27.53 
 
 		 420 aa  111  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0144  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 		 403 aa  106  8e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0378  extracellular solute-binding protein family 1  25.75 
 
 		 420 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29320  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.25 
 
 		 443 aa  105  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  25.78 
 
 		 413 aa  105  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  23.99 
 
 		 437 aa  104  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0375  extracellular solute-binding protein family 1  25.75 
 
 		 421 aa  104  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28390  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.87 
 
 		 453 aa  101  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  27.56 
 
 		 445 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0137  extracellular solute-binding protein family 1  24.02 
 
 		 453 aa  102  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3566  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 		 454 aa  101  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.42847  normal  0.297516 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 		 444 aa  99.8  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2474  extracellular solute-binding protein family 1  24.1 
 
 		 484 aa  99.4  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000108946  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  24.63 
 
 		 417 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3240  extracellular solute-binding protein  28.26 
 
 		 434 aa  99  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0427  extracellular solute-binding protein family 1  29.47 
 
 		 497 aa  99  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  27.52 
 
 		 488 aa  98.2  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  26.49 
 
 		 429 aa  98.2  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1359  extracellular solute-binding protein  24.95 
 
 		 458 aa  97.4  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  26.55 
 
 		 435 aa  95.1  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  25.82 
 
 		 408 aa  94.7  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 443 aa  94.7  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3619  extracellular solute-binding protein  28.02 
 
 		 488 aa  94  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1126  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 		 432 aa  94  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190587  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0516  extracellular solute-binding protein  28.32 
 
 		 488 aa  93.2  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  25.6 
 
 		 406 aa  92.8  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2552  extracellular solute-binding protein  24.05 
 
 		 443 aa  92.8  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000382941 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  24.18 
 
 		 406 aa  91.3  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  22.42 
 
 		 411 aa  91.7  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0265  extracellular solute-binding protein family 1  23.47 
 
 		 510 aa  90.9  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  23.5 
 
 		 414 aa  90.9  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4621  extracellular solute-binding protein family 1  27.53 
 
 		 413 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0751  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 411 aa  88.6  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0314212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 		 419 aa  89  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0656  extracellular solute-binding protein family 1  28.91 
 
 		 431 aa  87.8  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31335 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.73 
 
 		 407 aa  87.4  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  28.3 
 
 		 432 aa  87  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 		 424 aa  87  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0126  extracellular solute-binding protein family 1  26.09 
 
 		 477 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2403  extracellular solute-binding protein  23.51 
 
 		 441 aa  85.9  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0508  extracellular solute-binding protein family 1  25.39 
 
 		 514 aa  85.9  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.84 
 
 		 431 aa  85.9  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  23.1 
 
 		 450 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  21.01 
 
 		 405 aa  84.7  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.09 
 
 		 426 aa  84.3  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2545  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 		 442 aa  84  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  25.45 
 
 		 432 aa  84  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  23.84 
 
 		 425 aa  83.6  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 		 488 aa  83.6  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  27.76 
 
 		 457 aa  83.6  0.000000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1199  extracellular solute-binding protein family 1  24.1 
 
 		 432 aa  83.2  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000829014 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  25.46 
 
 		 410 aa  83.2  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  23.19 
 
 		 393 aa  82.8  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  24.47 
 
 		 414 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  25.46 
 
 		 410 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2315  extracellular solute-binding protein family 1  25.92 
 
 		 503 aa  82  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0291  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 449 aa  82  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  26.92 
 
 		 418 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  22.64 
 
 		 415 aa  81.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  25.6 
 
 		 425 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  27.04 
 
 		 432 aa  81.3  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2303  extracellular solute-binding protein family 1  24.2 
 
 		 480 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.316955  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04610  extracellular solute-binding protein family 1  25.66 
 
 		 431 aa  80.9  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0499  extracellular solute-binding protein family 1  26.97 
 
 		 434 aa  80.9  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000057577 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0224  extracellular solute-binding protein  28.07 
 
 		 431 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2537  extracellular solute-binding protein family 1  26.21 
 
 		 450 aa  80.9  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272028  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2603  extracellular solute-binding protein family 1  25.92 
 
 		 445 aa  80.5  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0144502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  24.26 
 
 		 436 aa  80.1  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0274  extracellular solute-binding protein  25.36 
 
 		 439 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.285114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  25.15 
 
 		 425 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  24.64 
 
 		 422 aa  78.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1060  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.76 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.065415  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2647  extracellular solute-binding protein family 1  29.13 
 
 		 446 aa  77.8  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.890591  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 420 aa  76.6  0.0000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2313  extracellular solute-binding protein  23.45 
 
 		 901 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  23.96 
 
 		 403 aa  76.3  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01900  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.05 
 
 		 442 aa  75.9  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.867357  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>