More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2726 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 437 aa  897    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  31.18 
 
 		 441 aa  187  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  27.39 
 
 		 414 aa  163  5.0000000000000005e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0648  extracellular solute-binding protein family 1  27.49 
 
 		 447 aa  162  8.000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.38 
 
 		 407 aa  149  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0427  extracellular solute-binding protein family 1  26.75 
 
 		 497 aa  145  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2209  extracellular solute-binding protein family 1  27.12 
 
 		 487 aa  123  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  27.76 
 
 		 460 aa  123  6e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  28.18 
 
 		 410 aa  120  7e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  28.18 
 
 		 410 aa  120  7e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  28.93 
 
 		 415 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  30.17 
 
 		 449 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  30.43 
 
 		 425 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 		 429 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0137  extracellular solute-binding protein family 1  28.19 
 
 		 453 aa  113  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0224  extracellular solute-binding protein  25.9 
 
 		 431 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 		 423 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  27.03 
 
 		 422 aa  110  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4733  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  25.71 
 
 		 458 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6751  extracellular solute-binding protein family 1  27.45 
 
 		 441 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0606  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  25.48 
 
 		 458 aa  107  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1696  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 		 436 aa  107  6e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00506774  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  24.79 
 
 		 421 aa  106  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0480  glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  25.24 
 
 		 458 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0625  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  25.24 
 
 		 458 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.24 
 
 		 410 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 		 457 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0632  glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein, putative  25.24 
 
 		 458 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0482  glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  25 
 
 		 458 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  23.99 
 
 		 479 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0538  glycerol-3-phosphate ABC transporter glycerol-3-phosphate-binding protein  25 
 
 		 458 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406699  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0569  glycerol-3-phosphate ABC transporter glycerol-3-phosphate-binding protein  25 
 
 		 458 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 		 444 aa  104  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0656  extracellular solute-binding protein family 1  25.53 
 
 		 431 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31335 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0700  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  25.24 
 
 		 458 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 417 aa  100  4e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0483  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 		 458 aa  100  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3306  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 431 aa  100  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6664  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 		 452 aa  99.8  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2513  extracellular solute-binding protein family 1  25.52 
 
 		 441 aa  99.4  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  22.37 
 
 		 399 aa  99.4  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2511  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  25 
 
 		 425 aa  99  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.98381  normal  0.711564 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4488  extracellular solute-binding protein family 1  23.62 
 
 		 434 aa  97.4  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.395657  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0289  extracellular solute-binding protein  23.43 
 
 		 437 aa  97.8  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000019091  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  23.78 
 
 		 427 aa  97.8  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  24.33 
 
 		 410 aa  97.1  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  24.39 
 
 		 421 aa  97.1  6e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  25.94 
 
 		 410 aa  96.7  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  25.8 
 
 		 420 aa  96.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2659  extracellular solute-binding protein family 1  26.17 
 
 		 431 aa  96.7  8e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00136924  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2263  extracellular solute-binding protein family 1  22.22 
 
 		 441 aa  96.7  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.431886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0687  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 		 407 aa  96.3  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.376534  normal  0.15795 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0721  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 		 437 aa  95.9  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540981  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1732  extracellular solute-binding protein family 1  23.75 
 
 		 415 aa  95.1  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000368486  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  24.56 
 
 		 432 aa  94.4  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 		 433 aa  94.7  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07110  carbohydrate-binding protein  25 
 
 		 462 aa  94.7  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.666821 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 		 433 aa  94  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  24.77 
 
 		 504 aa  93.6  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 		 415 aa  93.2  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  25.19 
 
 		 432 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  23.91 
 
 		 415 aa  92.8  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 		 427 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  25.08 
 
 		 454 aa  92.8  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  23.98 
 
 		 419 aa  92.8  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  23.98 
 
 		 419 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3674  ABC sugar transporter, periplasmic binding protein  26.43 
 
 		 404 aa  92  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5306  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 		 431 aa  92  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  27.47 
 
 		 442 aa  91.3  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  25.74 
 
 		 421 aa  91.7  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2418  extracellular solute-binding protein family 1  25.85 
 
 		 447 aa  90.9  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  24.71 
 
 		 445 aa  90.9  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3409  extracellular solute-binding protein  28.23 
 
 		 404 aa  90.9  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.280364  normal  0.614723 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0753  extracellular solute-binding protein  22.81 
 
 		 437 aa  90.9  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 		 417 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  25.19 
 
 		 428 aa  90.5  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  22.49 
 
 		 424 aa  90.9  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  24.77 
 
 		 411 aa  90.9  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  24.11 
 
 		 420 aa  90.5  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.228974 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  28.22 
 
 		 414 aa  90.1  6e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12341  periplasmic sugar-binding lipoprotein uspC  27.65 
 
 		 440 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0117  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.43 
 
 		 444 aa  90.1  7e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5582  extracellular solute-binding protein  23.3 
 
 		 424 aa  90.1  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152115  normal  0.231128 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  25.41 
 
 		 410 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  26.58 
 
 		 446 aa  89.4  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  23.57 
 
 		 432 aa  89  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1085  extracellular solute-binding protein family 1  24.27 
 
 		 451 aa  89.4  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.474529 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  27.42 
 
 		 403 aa  89.4  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 		 410 aa  89.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0178  extracellular solute-binding protein family 1  23.46 
 
 		 449 aa  88.2  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6631  extracellular solute-binding protein family 1  23.83 
 
 		 410 aa  89  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  25.41 
 
 		 410 aa  88.2  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.61 
 
 		 419 aa  87.8  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0075  extracellular solute-binding protein family 1  25.35 
 
 		 441 aa  87.8  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1895  extracellular solute-binding protein  26.87 
 
 		 445 aa  87  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.854658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2252  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 469 aa  87  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00844632  hitchhiker  0.0063434 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4045  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  24.49 
 
 		 439 aa  86.7  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.661181  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2845  extracellular solute-binding protein family 1  26.44 
 
 		 439 aa  86.7  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0965  extracellular solute-binding protein family 1  25.21 
 
 		 455 aa  86.7  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0052659 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  25.6 
 
 		 435 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>