More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2451 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
449 aa  924    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  32.77 
 
 
427 aa  186  7e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  29.93 
 
 
479 aa  168  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  32.9 
 
 
420 aa  147  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2552  extracellular solute-binding protein  27.72 
 
 
443 aa  140  6e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000382941 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 
442 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2403  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 
441 aa  129  8.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  24.41 
 
 
454 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  28.48 
 
 
460 aa  127  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  26.27 
 
 
483 aa  126  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  28.2 
 
 
422 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  26.98 
 
 
443 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  25.9 
 
 
447 aa  123  5e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  30.55 
 
 
414 aa  123  6e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  27.65 
 
 
408 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  30 
 
 
437 aa  119  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 
504 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  25.15 
 
 
411 aa  114  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2315  extracellular solute-binding protein family 1  24.52 
 
 
503 aa  113  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0592  extracellular solute-binding protein  24.26 
 
 
456 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000165278  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0274  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 
439 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.285114  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  26.61 
 
 
427 aa  111  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29320  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.19 
 
 
443 aa  110  7.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.49 
 
 
407 aa  109  9.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.67 
 
 
431 aa  109  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 
488 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0508  extracellular solute-binding protein family 1  25.59 
 
 
514 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  27.54 
 
 
422 aa  108  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0375  extracellular solute-binding protein family 1  26.26 
 
 
421 aa  107  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0378  extracellular solute-binding protein family 1  26.26 
 
 
420 aa  107  5e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12078  sugar-binding lipoprotein  26.55 
 
 
439 aa  105  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0427  extracellular solute-binding protein family 1  29.62 
 
 
497 aa  103  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 
488 aa  103  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  25.8 
 
 
445 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  25.51 
 
 
420 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2137  extracellular solute-binding protein family 1  22.15 
 
 
467 aa  101  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3240  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 
434 aa  99  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  27.14 
 
 
413 aa  99  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  22.59 
 
 
417 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12341  periplasmic sugar-binding lipoprotein uspC  24.72 
 
 
440 aa  97.4  5e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  27.24 
 
 
415 aa  97.1  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 
399 aa  96.7  8e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 
416 aa  95.9  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  27.35 
 
 
410 aa  95.5  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 
424 aa  95.1  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  27.35 
 
 
410 aa  95.5  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0263  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 
439 aa  94.4  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.962251  hitchhiker  0.00117926 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.18 
 
 
426 aa  93.6  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 
466 aa  92.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2513  extracellular solute-binding protein family 1  24.2 
 
 
441 aa  92.8  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  29.27 
 
 
450 aa  92.8  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 
461 aa  92  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
424 aa  91.7  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3566  extracellular solute-binding protein  23.12 
 
 
454 aa  92  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.42847  normal  0.297516 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  24.08 
 
 
429 aa  91.3  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  24.77 
 
 
410 aa  90.5  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 
428 aa  90.5  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  32.09 
 
 
457 aa  88.6  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0224  extracellular solute-binding protein  27.57 
 
 
431 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 
435 aa  89  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3575  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  24.57 
 
 
437 aa  88.2  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  24.78 
 
 
408 aa  88.2  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4016  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  24.57 
 
 
437 aa  88.2  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3709  extracellular solute-binding protein  24.57 
 
 
437 aa  88.2  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 
411 aa  87.8  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  25.97 
 
 
411 aa  87  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  23.65 
 
 
410 aa  87  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0137  extracellular solute-binding protein family 1  25.98 
 
 
453 aa  87  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  26.93 
 
 
406 aa  87  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  25.46 
 
 
411 aa  86.7  9e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  24.21 
 
 
411 aa  86.3  9e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  27.97 
 
 
421 aa  86.7  9e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2303  extracellular solute-binding protein family 1  22.85 
 
 
480 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.316955  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  23.96 
 
 
411 aa  85.9  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  32.06 
 
 
420 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0656  extracellular solute-binding protein family 1  28.76 
 
 
431 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31335 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1359  extracellular solute-binding protein  23.38 
 
 
458 aa  85.9  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  23.65 
 
 
410 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  23.21 
 
 
415 aa  84.7  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  24.51 
 
 
431 aa  84.7  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 
415 aa  84.3  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0144  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
403 aa  84  0.000000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  23.99 
 
 
446 aa  83.6  0.000000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.39 
 
 
366 aa  83.6  0.000000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  26.04 
 
 
414 aa  83.2  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  22.54 
 
 
425 aa  82.8  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  26.84 
 
 
441 aa  82.8  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7695  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25 
 
 
435 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397837  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2209  extracellular solute-binding protein family 1  25.96 
 
 
487 aa  82  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.38 
 
 
464 aa  81.3  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2049  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 
438 aa  81.3  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.29 
 
 
452 aa  81.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 
420 aa  80.5  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  26.92 
 
 
421 aa  80.9  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  24.48 
 
 
437 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0751  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 
411 aa  80.5  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0314212  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 
420 aa  80.5  0.00000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  23.04 
 
 
444 aa  79.7  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0291  extracellular solute-binding protein  22.99 
 
 
449 aa  79.7  0.00000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7049  extracellular solute-binding protein  26.26 
 
 
439 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0982583  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>