146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0267 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3182  extracellular solute-binding protein family 1  74.67 
 
 		 464 aa  700    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.145583 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0267  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 462 aa  935    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.39283  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3914  extracellular solute-binding protein  60.78 
 
 		 457 aa  543  1e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01750  carbohydrate-binding protein  57.14 
 
 		 457 aa  518  1e-146  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110954  normal  0.899537 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3237  extracellular solute-binding protein family 1  54.88 
 
 		 464 aa  496  1e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3967  extracellular solute-binding protein  53.59 
 
 		 448 aa  465  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182057  normal  0.154584 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5758  extracellular solute-binding protein family 1  55.13 
 
 		 498 aa  461  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal  0.192043 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7166  alpha-glucoside ABC transporter  52.38 
 
 		 451 aa  457  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3587  extracellular solute-binding protein  52.07 
 
 		 447 aa  455  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.69287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4648  extracellular solute-binding protein family 1  48.91 
 
 		 448 aa  431  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000260895 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2337  ABC-type glucosylglycerol transport system substrate-binding protein  47.68 
 
 		 448 aa  397  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176838  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5152  extracellular solute-binding protein family 1  50.36 
 
 		 482 aa  380  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1180  extracellular solute-binding protein  41.16 
 
 		 485 aa  286  4e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2855  extracellular solute-binding protein  39.36 
 
 		 451 aa  278  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0387  extracellular solute-binding protein family 1  37.64 
 
 		 453 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4345  extracellular solute-binding protein  37.42 
 
 		 450 aa  264  3e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0355  extracellular solute-binding protein family 1  37.41 
 
 		 453 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1652  putative solute-binding protein 1 family  39.24 
 
 		 452 aa  262  8e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182094  hitchhiker  0.00000465499 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3307  extracellular solute-binding protein  39.49 
 
 		 449 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2910  ABC alpha-glucoside transporter extracellular solute-binding protein, family 1  36.41 
 
 		 452 aa  252  1e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.320115 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2873  ABC alpha-glucoside transporter, perplasmic substrate-binding protein  37.5 
 
 		 450 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182804  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1519  extracellular solute-binding protein  37.5 
 
 		 450 aa  249  7e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  0.200847 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1946  extracellular solute-binding protein  38.66 
 
 		 449 aa  247  3e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0292  extracellular solute-binding protein  37.19 
 
 		 452 aa  247  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1147  extracellular solute-binding protein  36.52 
 
 		 544 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0785  ABC transporter substrate binding protein (alpha-glucoside)  33.49 
 
 		 452 aa  237  4e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14550  extracellular solute-binding protein family 1  35.7 
 
 		 432 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000299418  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3716  extracellular solute-binding protein family 1  34.39 
 
 		 440 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13200  extracellular solute-binding protein family 1  34.73 
 
 		 424 aa  213  9e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26130  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  31.24 
 
 		 448 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0719829  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0869  extracellular solute-binding protein family 1  31.85 
 
 		 436 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.293785 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2626  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 		 455 aa  172  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0491272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2325  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 		 444 aa  159  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032194  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1625  alpha-glucoside ABC transporter periplasmic- binding protein  31.69 
 
 		 442 aa  156  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.234885  normal  0.190993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2151  extracellular solute-binding protein family 1  29.43 
 
 		 466 aa  144  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2936  extracellular solute-binding protein family 1  29.7 
 
 		 447 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2534  extracellular solute-binding protein family 1  27.32 
 
 		 404 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.478006  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0402  extracellular solute-binding protein family 1  26.34 
 
 		 447 aa  110  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2914  extracellular solute-binding protein family 1  28.24 
 
 		 440 aa  79.7  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  34.15 
 
 		 431 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  26.8 
 
 		 422 aa  74.3  0.000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  32.58 
 
 		 434 aa  73.9  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.38 
 
 		 435 aa  70.5  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  26.3 
 
 		 434 aa  70.1  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5673  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 		 435 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0285739  normal  0.0925972 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  24.8 
 
 		 448 aa  66.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2234  extracellular solute-binding protein family 1  31.07 
 
 		 419 aa  65.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  26.51 
 
 		 442 aa  65.1  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  26.02 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  26.39 
 
 		 424 aa  62.4  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  27.19 
 
 		 441 aa  60.8  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  23.81 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  32.23 
 
 		 445 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.48 
 
 		 438 aa  58.5  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  32.26 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0540  ABC transporter, substrate-binding protein  27.34 
 
 		 461 aa  58.2  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 		 435 aa  58.2  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.61 
 
 		 427 aa  57.4  0.0000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  27.03 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  26.21 
 
 		 427 aa  57  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  23.99 
 
 		 421 aa  57  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  23.6 
 
 		 442 aa  55.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3469  extracellular solute-binding protein family 1  26.44 
 
 		 446 aa  55.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  28.46 
 
 		 414 aa  55.5  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0556  ABC transporter, solute-binding protein  26.95 
 
 		 461 aa  55.1  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1862  extracellular solute-binding protein  25.36 
 
 		 430 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144249  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5137  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 		 433 aa  54.7  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.319423  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 		 451 aa  54.7  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  26.71 
 
 		 441 aa  53.9  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  26.82 
 
 		 434 aa  53.5  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.49 
 
 		 453 aa  53.5  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0434  extracellular solute-binding protein family 1  29.13 
 
 		 444 aa  53.5  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0998  extracellular solute-binding protein family 1  22.78 
 
 		 451 aa  53.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  26.44 
 
 		 459 aa  52.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5027  extracellular solute-binding protein family 1  25.08 
 
 		 434 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0894368  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  30.3 
 
 		 413 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3657  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  26.45 
 
 		 423 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1588  extracellular solute-binding protein  27.52 
 
 		 452 aa  51.2  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  30.3 
 
 		 399 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  27.86 
 
 		 441 aa  51.2  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  28.04 
 
 		 432 aa  51.6  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3838  extracellular solute-binding protein  34.09 
 
 		 420 aa  51.2  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  24.05 
 
 		 495 aa  50.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3169  extracellular solute-binding protein family 1  25.65 
 
 		 445 aa  50.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187022 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4906  extracellular solute-binding protein family 1  27.16 
 
 		 438 aa  50.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.507884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  24.49 
 
 		 415 aa  50.4  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3379  extracellular solute-binding protein  23.91 
 
 		 445 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 		 408 aa  49.7  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2327  extracellular solute-binding protein family 1  25.98 
 
 		 424 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  24.11 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  27.41 
 
 		 441 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  27.1 
 
 		 424 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17020  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.81 
 
 		 431 aa  48.1  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00301962  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  22.89 
 
 		 455 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0654  extracellular solute-binding protein family 1  24.06 
 
 		 554 aa  47.4  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  22.43 
 
 		 412 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  22.43 
 
 		 412 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1371  extracellular solute-binding protein family 1  25.21 
 
 		 438 aa  47.4  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  25.79 
 
 		 435 aa  46.6  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6265  extracellular solute-binding protein family 1  24.88 
 
 		 443 aa  47  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>