110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0654 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0654  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 554 aa  1110    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1029  sugar-binding periplasmic protein  50 
 
 		 491 aa  460  9.999999999999999e-129  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0247417 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0808  arabinose ABC transporter, arabinose binding protein  44.37 
 
 		 620 aa  365  1e-99  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1257  extracellular solute-binding protein  33.77 
 
 		 467 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2342  extracellular solute-binding protein  32.76 
 
 		 477 aa  249  1e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.936887  normal  0.0125511 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2112  extracellular solute-binding protein  33.12 
 
 		 473 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  30 
 
 		 432 aa  145  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  25.18 
 
 		 454 aa  125  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 434 aa  123  7e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  25.45 
 
 		 431 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2380  extracellular solute-binding protein family 1  24.23 
 
 		 415 aa  117  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0168  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 412 aa  116  8.999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0905  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 		 412 aa  115  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  24.66 
 
 		 455 aa  115  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  25.3 
 
 		 415 aa  110  9.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  23.02 
 
 		 435 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  23.41 
 
 		 415 aa  105  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1862  extracellular solute-binding protein  23.67 
 
 		 430 aa  103  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144249  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3657  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  25.68 
 
 		 423 aa  100  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3494  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 414 aa  97.4  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3264  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 		 416 aa  94.4  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.591163 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1303  extracellular solute-binding protein  23.03 
 
 		 432 aa  93.2  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313179  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7939  ABC transporter (substrate-binding protein)  23.65 
 
 		 428 aa  91.3  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  0.560439 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  24.69 
 
 		 414 aa  89.7  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26610  carbohydrate-binding protein  22.8 
 
 		 425 aa  84.7  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0882  extracellular solute-binding protein family 1  21.76 
 
 		 419 aa  83.2  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.632389 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1097  extracellular solute-binding protein  24.28 
 
 		 416 aa  79  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000486653  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3689  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 		 416 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1695  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 		 420 aa  79.3  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.157617 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0523  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 		 418 aa  78.6  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4349  extracellular solute-binding protein  21.28 
 
 		 415 aa  72  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000381076  hitchhiker  0.000997313 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0083  extracellular solute-binding protein family 1  22.83 
 
 		 429 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1378  extracellular solute-binding protein family 1  23.17 
 
 		 420 aa  68.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3491  extracellular solute-binding protein family 1  23.17 
 
 		 419 aa  67.8  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1482  extracellular solute-binding protein family 1  23 
 
 		 420 aa  67.4  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3786  extracellular solute-binding protein family 1  23 
 
 		 419 aa  67  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0092  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 		 425 aa  65.9  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1956  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  22.71 
 
 		 417 aa  63.9  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.318288  normal  0.222736 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22980  putative binding protein component of ABC sugar transporter  24.8 
 
 		 420 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.16871 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1939  putative sugar ABC transporter binding protein subunit  24.8 
 
 		 420 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3454  extracellular solute-binding protein  22.66 
 
 		 418 aa  62.8  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000480069  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1292  glucose ABC transporter, periplasmic glucose-binding protein, putative  21.45 
 
 		 428 aa  62  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.927491  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3404  extracellular solute-binding protein  22.73 
 
 		 413 aa  61.6  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3935  extracellular solute-binding protein  22.59 
 
 		 420 aa  61.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0774395  normal  0.611638 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001061  ABC-type sugar transport system component  23.74 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1515  extracellular solute-binding protein  20.83 
 
 		 425 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6314  extracellular solute-binding protein  20.83 
 
 		 425 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.619662 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6972  extracellular solute-binding protein  20.83 
 
 		 402 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.780279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1113  extracellular solute-binding protein  21.05 
 
 		 431 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1013  extracellular solute-binding protein  21.84 
 
 		 428 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7166  alpha-glucoside ABC transporter  24.52 
 
 		 451 aa  58.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9200  ABC-type sugar transport system periplasmic component  24.66 
 
 		 374 aa  57  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3573  extracellular solute-binding protein  21.15 
 
 		 414 aa  55.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0138682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29280  sugar ABC transport system, periplasmic substrate-binding protein  21.73 
 
 		 388 aa  55.5  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3817  extracellular solute-binding protein  23.05 
 
 		 421 aa  54.3  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284829  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1053  extracellular solute-binding protein  20.67 
 
 		 428 aa  53.9  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00219882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3170  extracellular solute-binding protein  20.8 
 
 		 414 aa  53.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4321  extracellular solute-binding protein  21.6 
 
 		 409 aa  53.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.739189 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2399  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  22.44 
 
 		 411 aa  53.5  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.791953  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1015  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  20.54 
 
 		 428 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0693  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  21.35 
 
 		 421 aa  52.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0998966  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01750  carbohydrate-binding protein  24.35 
 
 		 457 aa  52.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110954  normal  0.899537 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2284  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  23.02 
 
 		 410 aa  51.6  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.61221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1813  extracellular solute-binding protein family 1  21.19 
 
 		 411 aa  51.2  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0840  extracellular solute-binding protein  21.52 
 
 		 415 aa  51.2  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.961003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2520  extracellular solute-binding protein family 1  22.62 
 
 		 452 aa  50.8  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2098  extracellular solute-binding protein family 1  20.4 
 
 		 411 aa  50.8  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.072788 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5435  extracellular solute-binding protein  21.57 
 
 		 414 aa  50.4  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.207139 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2337  extracellular solute-binding protein family 1  20.4 
 
 		 411 aa  50.4  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.836128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4071  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  21.52 
 
 		 415 aa  50.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00185695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  21.89 
 
 		 468 aa  49.7  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4278  extracellular solute-binding protein  21.21 
 
 		 442 aa  48.9  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1150  extracellular solute-binding protein  22.42 
 
 		 417 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0392592  normal  0.752071 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0929  extracellular solute-binding protein  21.52 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5887  extracellular solute-binding protein family 1  20.23 
 
 		 412 aa  49.7  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0489  extracellular solute-binding protein  21.19 
 
 		 415 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0816838  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0968  extracellular solute-binding protein  21.19 
 
 		 415 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278189  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0434  extracellular solute-binding protein family 1  22.98 
 
 		 444 aa  48.9  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4370  extracellular solute-binding protein  19.95 
 
 		 433 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.878399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4648  extracellular solute-binding protein family 1  22.37 
 
 		 448 aa  47.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000260895 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0828  extracellular solute-binding protein  22.57 
 
 		 415 aa  47.8  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00532301  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0267  extracellular solute-binding protein family 1  24.06 
 
 		 462 aa  47.8  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.39283  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0869  extracellular solute-binding protein family 1  24.81 
 
 		 436 aa  47.4  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.293785 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1090  extracellular solute-binding protein  24.39 
 
 		 417 aa  47.4  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4209  extracellular solute-binding protein  21.46 
 
 		 428 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1553  maltose ABC transporter, periplasmic maltose-binding protein  22.11 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0365178  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2430  extracellular solute-binding protein  20.86 
 
 		 415 aa  46.6  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.682399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0628  extracellular solute-binding protein  20.9 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2151  extracellular solute-binding protein family 1  24.11 
 
 		 466 aa  47  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2574  extracellular solute-binding protein family 1  19.78 
 
 		 395 aa  47  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.577743 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3914  extracellular solute-binding protein  20.87 
 
 		 457 aa  45.8  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3182  extracellular solute-binding protein family 1  23.08 
 
 		 464 aa  45.8  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.145583 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13200  extracellular solute-binding protein family 1  20.55 
 
 		 424 aa  46.2  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  27.5 
 
 		 441 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2325  extracellular solute-binding protein family 1  20.39 
 
 		 444 aa  46.2  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032194  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2821  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 		 428 aa  45.4  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.858803  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2615  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  21.67 
 
 		 415 aa  44.7  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.813067  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2998  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  21.67 
 
 		 415 aa  44.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3052  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  21.67 
 
 		 415 aa  44.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1998  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  21.67 
 
 		 415 aa  44.7  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>