More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4758 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_5365  extracellular solute-binding protein family 1  90.59 
 
 
418 aa  731    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.559287 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4758  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
417 aa  839    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1088  extracellular solute-binding protein family 1  37.03 
 
 
414 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00683834  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  27.01 
 
 
415 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  28.25 
 
 
412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  27.32 
 
 
412 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  26.78 
 
 
412 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3348  extracellular solute-binding protein family 1  26.11 
 
 
443 aa  97.4  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  27.95 
 
 
416 aa  92.8  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  27.22 
 
 
437 aa  90.5  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  29.12 
 
 
424 aa  90.1  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  26.09 
 
 
411 aa  89  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3752  extracellular solute-binding protein family 1  26.91 
 
 
436 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0080  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.45 
 
 
442 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0490  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 
440 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000283806  hitchhiker  0.00214005 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  27.18 
 
 
444 aa  87.8  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3450  extracellular solute-binding protein family 1  26.41 
 
 
436 aa  87  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.18 
 
 
366 aa  87  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0361  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 
444 aa  86.7  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.678366  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  27.01 
 
 
449 aa  86.3  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 
411 aa  85.1  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  27.54 
 
 
422 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  27.78 
 
 
439 aa  85.5  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  26.65 
 
 
426 aa  84.3  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 
428 aa  84.3  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0271  extracellular solute-binding protein family 1  25.95 
 
 
387 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3854  extracellular solute-binding protein  28.84 
 
 
439 aa  84.3  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1756  ABC transporter substrate-binding protein  26.96 
 
 
439 aa  84.3  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  0.574192 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4845  extracellular solute-binding protein  26.93 
 
 
434 aa  83.6  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.834917  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  27.22 
 
 
410 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  27.25 
 
 
422 aa  83.2  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 
422 aa  83.2  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2358  extracellular solute-binding protein  25.77 
 
 
441 aa  82.4  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3246  extracellular solute-binding protein family 1  25.85 
 
 
440 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00178427  normal  0.716937 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 
437 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.92 
 
 
410 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3775  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 
441 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.577316  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0720  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.08 
 
 
440 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000241977  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2440  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 
440 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0811647  decreased coverage  0.000336324 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  25.26 
 
 
391 aa  79.3  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  24.04 
 
 
436 aa  79  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0633  extracellular solute-binding protein  26.04 
 
 
436 aa  78.6  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  26.02 
 
 
466 aa  79  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2870  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 
447 aa  79  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2603  extracellular solute-binding protein family 1  28.83 
 
 
445 aa  78.2  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0144502  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 
410 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2364  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.36 
 
 
416 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128582  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1438  extracellular solute-binding protein  25.39 
 
 
400 aa  78.2  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000172655  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2707  mannitol ABC transporter, periplasmic mannitol-binding protein  26.02 
 
 
440 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.069342  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
391 aa  77.8  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0333  maltose/mannitol ABC transporter, periplasmic maltose/mannitol-binding protein, putative  27.3 
 
 
442 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00410857  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1034  extracellular solute-binding protein  27.3 
 
 
442 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0695  mannitol ABC transporter, periplasmic mannitol-binding protein  26.62 
 
 
441 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  28.07 
 
 
433 aa  77  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0631  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  27.3 
 
 
442 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2465  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  27.3 
 
 
442 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0872  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  27.3 
 
 
442 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0876  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  27.3 
 
 
442 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0755942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0079  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  27.3 
 
 
442 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2640  extracellular solute-binding protein  28.09 
 
 
436 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.932575  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 
424 aa  76.6  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3399  extracellular solute-binding protein  27.02 
 
 
440 aa  76.6  0.0000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0250918  normal  0.750741 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  23.99 
 
 
411 aa  76.6  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  25.19 
 
 
432 aa  76.3  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2420  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 
443 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.783182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2465  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 
443 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.270585  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2624  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 
444 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2459  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 
443 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.924766  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 
466 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1390  extracellular solute-binding protein  25.17 
 
 
444 aa  75.1  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00129811  normal  0.103249 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4979  extracellular solute-binding protein  30 
 
 
439 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.060129 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  26.59 
 
 
439 aa  75.1  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27400  periplasmic mannitol-binding protein of mannitol ABC transporter  26.22 
 
 
438 aa  75.5  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3999  extracellular solute-binding protein family 1  25.89 
 
 
452 aa  75.1  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220113  normal  0.250177 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  27.44 
 
 
430 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  28.01 
 
 
431 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0228  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.61 
 
 
439 aa  74.7  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0459  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 
436 aa  74.7  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.420805  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2511  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 
441 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0464819  normal  0.359234 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5926  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.07 
 
 
441 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517551  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2643  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 
441 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0222782  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  23.33 
 
 
455 aa  73.9  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3777  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 
436 aa  73.9  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.253936  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3793  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 
437 aa  73.6  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.742912 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  26.1 
 
 
464 aa  73.6  0.000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1711  extracellular solute-binding protein family 1  26.27 
 
 
450 aa  73.6  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.827618 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2041  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 
436 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 
425 aa  73.2  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2144  sugar-binding periplasmic signal peptide protein  27.62 
 
 
441 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000125903  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0235  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  28.63 
 
 
439 aa  72.8  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3459  extracellular solute-binding protein family 1  25.14 
 
 
458 aa  72.8  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.725469  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1985  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 
441 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0378619  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0547  ABC-type sugar / sn-glycerol 3-phosphate transport protein  25.56 
 
 
447 aa  72.4  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2619  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 
441 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.925096  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2595  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 
441 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13364  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0848  extracellular solute-binding protein family 1  27.8 
 
 
453 aa  72  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0413942  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4940  extracellular solute-binding protein family 1  26.8 
 
 
484 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  24.92 
 
 
446 aa  71.6  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1727  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 
436 aa  72.4  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0915  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  26.9 
 
 
443 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.779259 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>