More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0633 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0633  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 436 aa  895    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0158  extracellular solute-binding protein family 1  64.52 
 
 		 435 aa  596  1e-169  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.317406 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2058  extracellular solute-binding protein family 1  63.82 
 
 		 435 aa  588  1e-167  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.617385 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3246  extracellular solute-binding protein family 1  63.06 
 
 		 440 aa  580  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00178427  normal  0.716937 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0720  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  63.06 
 
 		 440 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000241977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0490  extracellular solute-binding protein  64.23 
 
 		 440 aa  567  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000283806  hitchhiker  0.00214005 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27400  periplasmic mannitol-binding protein of mannitol ABC transporter  61.21 
 
 		 438 aa  563  1.0000000000000001e-159  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3854  extracellular solute-binding protein  63.46 
 
 		 439 aa  558  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0915  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  62.62 
 
 		 443 aa  559  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4116  extracellular solute-binding protein  59.91 
 
 		 447 aa  559  1e-158  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000719407  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3777  extracellular solute-binding protein  61.15 
 
 		 436 aa  558  1e-158  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.253936  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2358  extracellular solute-binding protein  61.61 
 
 		 441 aa  556  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2144  sugar-binding periplasmic signal peptide protein  63.24 
 
 		 441 aa  556  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000125903  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0333  maltose/mannitol ABC transporter, periplasmic maltose/mannitol-binding protein, putative  63.02 
 
 		 442 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00410857  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1034  extracellular solute-binding protein  63.02 
 
 		 442 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4845  extracellular solute-binding protein  61.52 
 
 		 434 aa  555  1e-157  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.834917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0631  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  63.02 
 
 		 442 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2465  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  63.02 
 
 		 442 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0872  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  63.02 
 
 		 442 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0876  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  63.02 
 
 		 442 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0755942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0079  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  63.02 
 
 		 442 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1094  extracellular solute-binding protein  60.51 
 
 		 439 aa  553  1e-156  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.962008  normal  0.028756 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3752  extracellular solute-binding protein family 1  60.83 
 
 		 436 aa  553  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0702  extracellular solute-binding protein  63.02 
 
 		 440 aa  550  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.812706  normal  0.378032 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0695  mannitol ABC transporter, periplasmic mannitol-binding protein  62.99 
 
 		 441 aa  549  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3450  extracellular solute-binding protein family 1  60.14 
 
 		 436 aa  549  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2511  extracellular solute-binding protein  62.77 
 
 		 441 aa  549  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0464819  normal  0.359234 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2643  extracellular solute-binding protein  62.77 
 
 		 441 aa  549  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0222782  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5926  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  62.84 
 
 		 441 aa  545  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4978  extracellular solute-binding protein family 1  60.1 
 
 		 437 aa  545  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.346425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1985  extracellular solute-binding protein  62.77 
 
 		 441 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0378619  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2619  extracellular solute-binding protein  62.77 
 
 		 441 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.925096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2595  extracellular solute-binding protein  62.77 
 
 		 441 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13364  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  59.63 
 
 		 439 aa  545  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0364  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  57.89 
 
 		 438 aa  542  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0431  extracellular solute-binding protein  60.55 
 
 		 435 aa  543  1e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0459  extracellular solute-binding protein  59.24 
 
 		 436 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.420805  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0091  ABC sorbitol/mannitol transporter, periplasmic binding protein  61.45 
 
 		 436 aa  535  1e-151  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.126585  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0138  extracellular solute-binding protein  57.93 
 
 		 434 aa  536  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34420  putative binding protein component of ABC maltose/mannitol transporter  61.5 
 
 		 436 aa  536  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000870468  normal  0.425479 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1727  extracellular solute-binding protein  61.45 
 
 		 436 aa  535  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2640  extracellular solute-binding protein  59.14 
 
 		 436 aa  533  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.932575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3793  extracellular solute-binding protein  58.85 
 
 		 437 aa  532  1e-150  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.742912 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1108  extracellular solute-binding protein family 1  59.45 
 
 		 436 aa  532  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.633554  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2041  extracellular solute-binding protein  58.82 
 
 		 436 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3171  extracellular solute-binding protein  59.24 
 
 		 443 aa  532  1e-150  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0465993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1681  extracellular solute-binding protein  60.98 
 
 		 436 aa  534  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.901925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0848  extracellular solute-binding protein family 1  58.81 
 
 		 453 aa  530  1e-149  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0413942  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4812  extracellular solute-binding protein  56.55 
 
 		 438 aa  531  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2870  extracellular solute-binding protein  58.47 
 
 		 447 aa  531  1e-149  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4325  extracellular solute-binding protein family 1  58.84 
 
 		 454 aa  529  1e-149  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4181  extracellular solute-binding protein  59.81 
 
 		 435 aa  525  1e-148  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000770865  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2925  putative maltose/mannitol ABC transporter binding protein subunit  60.24 
 
 		 436 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.732093  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2440  extracellular solute-binding protein  56.45 
 
 		 440 aa  524  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0811647  decreased coverage  0.000336324 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5596  extracellular solute-binding protein  58.98 
 
 		 436 aa  523  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.198436  normal  0.412169 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3415  extracellular solute-binding protein  57.01 
 
 		 438 aa  523  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.136491  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2707  mannitol ABC transporter, periplasmic mannitol-binding protein  55.81 
 
 		 440 aa  518  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.069342  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4468  extracellular solute-binding protein  58.28 
 
 		 436 aa  520  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2463  extracellular solute-binding protein  57.24 
 
 		 437 aa  514  1e-144  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0974  extracellular solute-binding protein family 1  55.94 
 
 		 435 aa  493  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606433  normal  0.163223 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0889  extracellular solute-binding protein  53.49 
 
 		 435 aa  480  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2902  extracellular solute-binding protein  53.92 
 
 		 439 aa  478  1e-133  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.489617 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4357  extracellular solute-binding protein  45.94 
 
 		 455 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4443  extracellular solute-binding protein  45.94 
 
 		 455 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0226595 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4737  extracellular solute-binding protein  46.17 
 
 		 455 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3999  extracellular solute-binding protein family 1  45.26 
 
 		 452 aa  374  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220113  normal  0.250177 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0303  extracellular solute-binding protein family 1  45.07 
 
 		 478 aa  350  2e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5309  extracellular solute-binding protein family 1  46.42 
 
 		 447 aa  351  2e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574903  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2796  extracellular solute-binding protein family 1  44.09 
 
 		 468 aa  349  6e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1711  extracellular solute-binding protein family 1  42.89 
 
 		 450 aa  347  2e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.827618 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03697  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  36.47 
 
 		 675 aa  293  6e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  29.95 
 
 		 422 aa  161  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  29.72 
 
 		 422 aa  160  6e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  29.72 
 
 		 422 aa  159  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2821  extracellular solute-binding protein  27.16 
 
 		 428 aa  126  8.000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.858803  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1390  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 		 444 aa  125  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00129811  normal  0.103249 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0572  extracellular solute-binding protein family 1  29.02 
 
 		 470 aa  124  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0954  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 397 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.233769  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  25.85 
 
 		 449 aa  119  7.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3065  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  29.52 
 
 		 421 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 		 412 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  28.61 
 
 		 432 aa  113  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6665  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 		 423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1739  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.76 
 
 		 426 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1179  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  28.76 
 
 		 423 aa  110  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0916647  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1073  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.48 
 
 		 399 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0230  putative transporter periplasmic binding protein  28.43 
 
 		 426 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0065  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  28.43 
 
 		 426 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0354  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  28.43 
 
 		 426 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.824168  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1650  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  28.43 
 
 		 426 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.572617  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1232  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  28.43 
 
 		 426 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715088  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1262  extracellular solute-binding protein  29.86 
 
 		 424 aa  108  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00529057  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5060  extracellular solute-binding protein  26.28 
 
 		 421 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.299118  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5800  extracellular solute-binding protein  26.28 
 
 		 421 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4379  extracellular solute-binding protein  28.31 
 
 		 421 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4400  extracellular solute-binding protein family 1  28.15 
 
 		 433 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.79 
 
 		 496 aa  106  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 		 446 aa  106  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 		 439 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 		 412 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>