More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0127 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0127  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 442 aa  880    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1963  extracellular solute-binding protein family 1  27.03 
 
 		 449 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.734467  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 		 452 aa  136  7.000000000000001e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  26.24 
 
 		 495 aa  95.9  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  23.79 
 
 		 468 aa  94.4  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4425  extracellular solute-binding protein family 1  23.9 
 
 		 446 aa  93.6  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.446855  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0374  extracellular solute-binding protein family 1  23.54 
 
 		 458 aa  87  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0240532 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20470  extracellular solute-binding protein family 1  23.41 
 
 		 406 aa  85.5  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000403753  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 		 420 aa  84.3  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  27.65 
 
 		 427 aa  84.3  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  25.28 
 
 		 424 aa  83.6  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0434  extracellular solute-binding protein family 1  26.34 
 
 		 444 aa  82  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  25.27 
 
 		 434 aa  80.9  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  22.25 
 
 		 424 aa  78.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 		 363 aa  79  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  22.67 
 
 		 441 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.11 
 
 		 427 aa  78.6  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1262  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.953049  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  25.92 
 
 		 457 aa  78.6  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  22.97 
 
 		 454 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  26.26 
 
 		 434 aa  77  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  24.24 
 
 		 427 aa  75.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  26.8 
 
 		 427 aa  75.1  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  24.52 
 
 		 441 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 		 435 aa  74.3  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  25.15 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  22.22 
 
 		 417 aa  73.6  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4090  twin-arginine translocation pathway signal  28.9 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.25614 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  26.23 
 
 		 424 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.63 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  22.19 
 
 		 445 aa  71.6  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  22.22 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27350  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.32 
 
 		 444 aa  71.2  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.404715  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  25.42 
 
 		 470 aa  70.9  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  24.68 
 
 		 412 aa  70.5  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3144  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  27.1 
 
 		 460 aa  69.7  0.00000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  23.93 
 
 		 413 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  23.1 
 
 		 420 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2274  extracellular solute-binding protein family 1  29.03 
 
 		 428 aa  68.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  23.1 
 
 		 420 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1698  extracellular solute-binding protein family 1  28.16 
 
 		 447 aa  68.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3285  hypothetical protein  30.96 
 
 		 431 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04930  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.64 
 
 		 442 aa  68.9  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  23.1 
 
 		 419 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  23.1 
 
 		 419 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  22.75 
 
 		 431 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2958  extracellular solute-binding protein family 1  26.41 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.347864  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4547  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.909678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  23.93 
 
 		 399 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  22.82 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0069  twin-arginine translocation pathway signal  25.23 
 
 		 432 aa  67  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4033  extracellular solute-binding protein  23.99 
 
 		 429 aa  67  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.15 
 
 		 407 aa  67  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.06 
 
 		 438 aa  66.6  0.0000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  23.38 
 
 		 417 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2845  extracellular solute-binding protein family 1  24.5 
 
 		 439 aa  66.6  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3559  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 		 421 aa  66.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.725882  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  25.76 
 
 		 433 aa  65.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2846  extracellular solute-binding protein family 1  27.06 
 
 		 435 aa  65.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26 
 
 		 426 aa  65.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  20 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1248  extracellular solute-binding protein family 1  24.72 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.494424  normal  0.639356 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  23.01 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3600  extracellular solute-binding protein family 1  25.58 
 
 		 425 aa  64.3  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0068  extracellular solute-binding protein family 1  23.06 
 
 		 486 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1321  extracellular solute-binding protein family 1  25.82 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4993  extracellular solute-binding protein family 1  28.09 
 
 		 432 aa  63.9  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0450999  normal  0.012477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4693  extracellular solute-binding protein family 1  25.53 
 
 		 457 aa  63.5  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.363745 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01480  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.06 
 
 		 435 aa  63.5  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  23.94 
 
 		 441 aa  63.2  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  24.09 
 
 		 441 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  22.98 
 
 		 421 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  24.56 
 
 		 425 aa  63.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  21.77 
 
 		 411 aa  62.8  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24620  carbohydrate-binding protein  26.98 
 
 		 424 aa  62.4  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1711  extracellular solute-binding protein family 1  25.8 
 
 		 454 aa  62.4  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.795485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  25.43 
 
 		 459 aa  62  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  21.77 
 
 		 411 aa  62.4  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 		 410 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  23.38 
 
 		 451 aa  61.6  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03302  glycerol-3-phosphate transporter subunit  26.25 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0262  extracellular solute-binding protein family 1  26.25 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4767  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  26.25 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.552805 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03255  hypothetical protein  26.25 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2626  extracellular solute-binding protein family 1  25.22 
 
 		 455 aa  61.6  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0491272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0263  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  26.25 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 		 420 aa  61.2  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4758  extracellular solute-binding protein family 1  27.04 
 
 		 417 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3650  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  26.25 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0694  extracellular solute-binding protein family 1  26.76 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.333505 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  26.42 
 
 		 428 aa  60.8  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0894  extracellular solute-binding protein family 1  25.25 
 
 		 470 aa  61.2  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.444762  normal  0.144357 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3931  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  26.25 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>