247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4547 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4547  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 423 aa  843    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.909678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5027  extracellular solute-binding protein family 1  55.38 
 
 		 434 aa  432  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0894368  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0434  extracellular solute-binding protein family 1  26.18 
 
 		 444 aa  93.2  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0998  extracellular solute-binding protein family 1  25.56 
 
 		 451 aa  93.2  9e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2415  extracellular solute-binding protein family 1  35.52 
 
 		 433 aa  87.8  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2783  extracellular solute-binding protein family 1  26.92 
 
 		 431 aa  84.7  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  32.32 
 
 		 431 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.88 
 
 		 434 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2703  extracellular solute-binding protein family 1  31.1 
 
 		 423 aa  82.4  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.830349  normal  0.531916 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  25.73 
 
 		 424 aa  82  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  28.82 
 
 		 434 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  27.82 
 
 		 441 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2999  extracellular solute-binding protein  28.77 
 
 		 419 aa  80.5  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.662901  hitchhiker  0.0000395876 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  25.47 
 
 		 441 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3041  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 		 429 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887996  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  29.12 
 
 		 448 aa  79  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0996  extracellular solute-binding protein family 1  25.45 
 
 		 455 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  29.35 
 
 		 427 aa  78.2  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  26.79 
 
 		 444 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  30.2 
 
 		 451 aa  77  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.22 
 
 		 438 aa  77  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  29.47 
 
 		 442 aa  76.6  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  26.35 
 
 		 435 aa  75.1  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  26.49 
 
 		 424 aa  75.1  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  30.39 
 
 		 420 aa  74.3  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2914  extracellular solute-binding protein family 1  27.91 
 
 		 440 aa  73.9  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.09 
 
 		 441 aa  72.4  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  27.97 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6971  extracellular solute-binding protein family 1  29.52 
 
 		 431 aa  72.4  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.487837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 		 424 aa  72  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3600  extracellular solute-binding protein family 1  26.44 
 
 		 425 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  29.55 
 
 		 439 aa  72  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  28.28 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.64 
 
 		 435 aa  71.2  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  28.11 
 
 		 422 aa  70.9  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  30.19 
 
 		 452 aa  70.5  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  24.57 
 
 		 470 aa  70.1  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1136  extracellular solute-binding protein family 1  27.65 
 
 		 431 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  26.28 
 
 		 417 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  30.2 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0127  extracellular solute-binding protein family 1  24.62 
 
 		 442 aa  68.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1485  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.36 
 
 		 429 aa  67.4  0.0000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0115  extracellular solute-binding protein family 1  27.16 
 
 		 478 aa  67  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132691  normal  0.193469 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  31.85 
 
 		 428 aa  67  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.87 
 
 		 458 aa  66.6  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  32.69 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3815  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 		 440 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.725217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0208  putative extracellular solute-binding protein  33.56 
 
 		 458 aa  64.3  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0085185  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  31.07 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  31.07 
 
 		 420 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  28.35 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6265  extracellular solute-binding protein family 1  26.56 
 
 		 443 aa  63.9  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  31.07 
 
 		 420 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  30.51 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09490  extracellular solute-binding protein family 1  27.21 
 
 		 424 aa  63.9  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.48456e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4984  extracellular solute-binding protein family 1  27.14 
 
 		 428 aa  63.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  30.51 
 
 		 419 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2983  extracellular solute-binding protein family 1  29.24 
 
 		 425 aa  62.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4033  extracellular solute-binding protein  31.33 
 
 		 429 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  30.82 
 
 		 415 aa  62.4  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7218  extracellular solute-binding protein  28.34 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5331  extracellular solute-binding protein family 1  29.17 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  29.23 
 
 		 412 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7341  sugar ABC transporter sugar-binding protein  28.77 
 
 		 426 aa  61.6  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  30.39 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2762  extracellular solute-binding protein  31.75 
 
 		 431 aa  61.2  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  28.02 
 
 		 495 aa  61.6  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2646  extracellular solute-binding protein family 1  30.19 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  27.34 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  31.85 
 
 		 441 aa  60.8  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  29.94 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2265  extracellular solute-binding protein family 1  30.54 
 
 		 418 aa  60.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  28.03 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3246  extracellular solute-binding protein family 1  30.13 
 
 		 443 aa  60.5  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 442 aa  60.5  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  28.03 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4936  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 		 463 aa  59.7  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.105521 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3860  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 		 463 aa  59.7  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.952749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3350  extracellular solute-binding protein family 1  29.8 
 
 		 461 aa  59.3  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0184  extracellular solute-binding protein family 1  28.12 
 
 		 450 aa  58.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  32.65 
 
 		 445 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3651  hypothetical protein  28.71 
 
 		 437 aa  58.9  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  0.0762923 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4349  extracellular solute-binding protein  24.73 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000381076  hitchhiker  0.000997313 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1243  extracellular solute-binding protein  23.96 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2327  extracellular solute-binding protein family 1  24.51 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4751  extracellular solute-binding protein family 1  30.18 
 
 		 417 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137656  normal  0.378465 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  26.55 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  24.17 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4662  extracellular solute-binding protein family 1  30.55 
 
 		 417 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.917353 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0882  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.297168  normal  0.673205 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  32.08 
 
 		 422 aa  58.2  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  24.45 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3534  extracellular solute-binding protein family 1  24.11 
 
 		 445 aa  57  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.582574 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01480  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  31.87 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2906  extracellular solute-binding protein family 1  29.22 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5048  extracellular solute-binding protein family 1  29.17 
 
 		 424 aa  57  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 		 435 aa  57  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>