More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3350 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_3350  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
461 aa  944    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09490  extracellular solute-binding protein family 1  24.72 
 
 
424 aa  124  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.48456e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.9 
 
 
458 aa  97.8  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197851  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 
423 aa  94  6e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  23.84 
 
 
419 aa  92.8  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1091  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 
433 aa  91.3  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  26.63 
 
 
422 aa  90.5  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 
439 aa  87.8  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3041  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 
429 aa  83.6  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887996  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.75 
 
 
441 aa  82.4  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1485  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.11 
 
 
429 aa  81.6  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  25.22 
 
 
433 aa  80.9  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
441 aa  80.1  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  32.7 
 
 
451 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  27.61 
 
 
454 aa  79  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  26.69 
 
 
428 aa  76.6  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 
420 aa  76.6  0.0000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  28.5 
 
 
427 aa  75.9  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1115  extracellular solute-binding protein  25.05 
 
 
439 aa  73.9  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000327347  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  24.37 
 
 
468 aa  73.6  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  24.07 
 
 
434 aa  72.4  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  26.22 
 
 
444 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0548  extracellular solute-binding protein family 1  24.23 
 
 
426 aa  71.6  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0032157  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  26.67 
 
 
410 aa  71.2  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0115  extracellular solute-binding protein family 1  24.91 
 
 
478 aa  71.6  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132691  normal  0.193469 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3317  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 
492 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000142443  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  25.89 
 
 
452 aa  70.9  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2999  extracellular solute-binding protein  30.63 
 
 
419 aa  70.1  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.662901  hitchhiker  0.0000395876 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  24.7 
 
 
424 aa  69.3  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 
455 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  27.4 
 
 
417 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1866  extracellular solute-binding protein family 1  24.79 
 
 
434 aa  68.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  25.77 
 
 
431 aa  68.2  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000238529  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  25.35 
 
 
435 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  28.95 
 
 
441 aa  68.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4889  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.78 
 
 
429 aa  67.8  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  30.87 
 
 
495 aa  67.8  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  23.77 
 
 
421 aa  67.8  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  32.87 
 
 
414 aa  67.8  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  24.61 
 
 
451 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2404  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 
424 aa  67.4  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4425  extracellular solute-binding protein family 1  26.75 
 
 
446 aa  67  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.446855  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1685  extracellular solute-binding protein family 1  26.03 
 
 
434 aa  67  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2997  extracellular solute-binding protein family 1  29.68 
 
 
462 aa  66.6  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000366828  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0477  extracellular solute-binding protein family 1  26.46 
 
 
432 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838392  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0434  extracellular solute-binding protein family 1  24.23 
 
 
444 aa  65.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
470 aa  64.7  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  27.98 
 
 
417 aa  64.3  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  20.74 
 
 
427 aa  63.9  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  26.8 
 
 
457 aa  64.3  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2308  extracellular solute-binding protein  21.88 
 
 
440 aa  64.3  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000253431  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  25.73 
 
 
412 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0998  extracellular solute-binding protein family 1  26.03 
 
 
451 aa  63.5  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3941  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  28.8 
 
 
436 aa  63.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3815  extracellular solute-binding protein  30.34 
 
 
440 aa  63.2  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.725217  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.84 
 
 
428 aa  62.4  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.92 
 
 
427 aa  62.8  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  25.74 
 
 
414 aa  62.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3623  extracellular solute-binding protein family 1  23.15 
 
 
442 aa  62.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00170169  normal  0.0768086 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2914  extracellular solute-binding protein family 1  24.91 
 
 
440 aa  62.4  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1505  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.98 
 
 
442 aa  62  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 
434 aa  62.4  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  28.3 
 
 
435 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  26.51 
 
 
441 aa  62.4  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2762  extracellular solute-binding protein  23.25 
 
 
431 aa  62  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6933  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.43 
 
 
412 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0038808  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 
420 aa  61.2  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 
412 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 
412 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 
412 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  28.11 
 
 
427 aa  61.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  29.79 
 
 
429 aa  61.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  27.64 
 
 
419 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  27.64 
 
 
419 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5608  extracellular solute-binding protein family 1  23.9 
 
 
427 aa  60.5  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.959607  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2783  extracellular solute-binding protein family 1  28.05 
 
 
431 aa  60.1  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185157  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1708  extracellular solute-binding protein  26.58 
 
 
518 aa  60.1  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  30.72 
 
 
421 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0751  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 
411 aa  59.3  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0314212  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  30.99 
 
 
420 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3613  extracellular solute-binding protein family 1  27.89 
 
 
429 aa  59.7  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.249837  normal  0.747368 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  30.99 
 
 
420 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  29.28 
 
 
408 aa  59.3  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  30.99 
 
 
419 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4547  extracellular solute-binding protein  29.8 
 
 
423 aa  59.3  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.909678  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3651  hypothetical protein  27.75 
 
 
437 aa  59.7  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  0.0762923 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1243  extracellular solute-binding protein  24.66 
 
 
444 aa  59.7  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2576  extracellular solute-binding protein family 1  22.48 
 
 
614 aa  59.3  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 
419 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  25.11 
 
 
431 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  25.96 
 
 
448 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2327  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 
424 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169538  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  24.39 
 
 
422 aa  59.3  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3716  extracellular solute-binding protein family 1  24.52 
 
 
440 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27700  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.42 
 
 
426 aa  58.9  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0598  extracellular solute-binding protein family 1  25.08 
 
 
446 aa  58.9  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.764573  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1262  extracellular solute-binding protein  30 
 
 
408 aa  58.9  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.953049  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3719  extracellular solute-binding protein family 1  27.17 
 
 
441 aa  58.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.0540576 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  26.14 
 
 
460 aa  58.2  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2265  extracellular solute-binding protein family 1  22.75 
 
 
418 aa  58.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>