More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3534 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3534  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 445 aa  901    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.582574 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  30.26 
 
 		 434 aa  159  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3675  extracellular solute-binding protein family 1  31.65 
 
 		 447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1091  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 		 433 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  23.87 
 
 		 419 aa  90.5  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27700  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.02 
 
 		 426 aa  82.4  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.2 
 
 		 427 aa  81.6  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2983  extracellular solute-binding protein family 1  25.53 
 
 		 425 aa  81.3  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  26.14 
 
 		 441 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  24.23 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  30.84 
 
 		 427 aa  77.8  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0556  ABC transporter, solute-binding protein  25.26 
 
 		 461 aa  77  0.0000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  22.08 
 
 		 424 aa  76.6  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0540  ABC transporter, substrate-binding protein  24.35 
 
 		 461 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  26.63 
 
 		 422 aa  74.3  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  21.9 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1492  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.35 
 
 		 441 aa  74.3  0.000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2415  extracellular solute-binding protein family 1  23.59 
 
 		 433 aa  73.6  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  25.7 
 
 		 427 aa  73.2  0.000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3651  hypothetical protein  23.42 
 
 		 437 aa  72.4  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  0.0762923 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6548  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.46 
 
 		 490 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225542 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  28.77 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3451  extracellular solute-binding protein  24.64 
 
 		 418 aa  69.7  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.772574  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  26.32 
 
 		 433 aa  68.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1762  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  29.76 
 
 		 438 aa  67.8  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000740157  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.43 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  27.18 
 
 		 431 aa  67.8  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4612  extracellular solute-binding protein family 1  23.45 
 
 		 437 aa  67.4  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  21.34 
 
 		 468 aa  67  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0374  extracellular solute-binding protein family 1  23.15 
 
 		 458 aa  66.6  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0240532 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3623  extracellular solute-binding protein family 1  26.74 
 
 		 442 aa  66.6  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00170169  normal  0.0768086 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 		 419 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1371  extracellular solute-binding protein family 1  25.13 
 
 		 438 aa  65.9  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3613  extracellular solute-binding protein family 1  24.28 
 
 		 429 aa  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.249837  normal  0.747368 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  26.46 
 
 		 445 aa  65.9  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  25.3 
 
 		 417 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.66 
 
 		 441 aa  65.9  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5667  extracellular solute-binding protein family 1  25.15 
 
 		 410 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.37 
 
 		 426 aa  65.5  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.66 
 
 		 435 aa  65.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0184  extracellular solute-binding protein family 1  22.76 
 
 		 450 aa  65.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6971  extracellular solute-binding protein family 1  22.08 
 
 		 431 aa  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.487837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  25.3 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  25.3 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3941  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  22.19 
 
 		 436 aa  64.3  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5698  extracellular solute-binding protein family 1  25.82 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.145305  normal  0.141272 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  24.35 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4547  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 423 aa  63.2  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.909678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  23.47 
 
 		 437 aa  63.2  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1485  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.92 
 
 		 429 aa  63.2  0.000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  22.22 
 
 		 454 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3483  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 		 417 aa  62  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 		 420 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 		 420 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  29.33 
 
 		 442 aa  62  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  23.02 
 
 		 434 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.24 
 
 		 438 aa  62  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3153  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 		 417 aa  61.6  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000182033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  23.54 
 
 		 495 aa  61.2  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3985  putative ABC sugar transporter (substrate binding protein)  25.94 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2102  periplasmic protein  22.65 
 
 		 447 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.502645  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  24.64 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0192  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.62 
 
 		 463 aa  61.2  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2036  extracellular solute-binding protein family 1  26.6 
 
 		 439 aa  60.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.182591  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  30.61 
 
 		 441 aa  60.8  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 		 455 aa  60.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 438 aa  60.1  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2627  extracellular solute-binding protein family 1  28.72 
 
 		 434 aa  59.7  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00662506  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0499  extracellular solute-binding protein family 1  22.54 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000057577 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0059  extracellular solute-binding protein  22.78 
 
 		 439 aa  59.7  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  24.38 
 
 		 410 aa  59.7  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2646  extracellular solute-binding protein family 1  26.69 
 
 		 419 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628324  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2365  extracellular solute-binding protein family 1  24.41 
 
 		 416 aa  59.3  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04070  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.17 
 
 		 444 aa  59.7  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2950  extracellular solute-binding protein  24.28 
 
 		 435 aa  59.3  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110397  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  25.16 
 
 		 414 aa  59.3  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4033  extracellular solute-binding protein  24.4 
 
 		 429 aa  59.7  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0034  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  31.76 
 
 		 438 aa  58.9  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3838  extracellular solute-binding protein  22.58 
 
 		 420 aa  58.9  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3941  extracellular solute-binding protein family 1  24.71 
 
 		 490 aa  58.9  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.486977 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  30.67 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0171  extracellular solute-binding protein family 1  29.41 
 
 		 468 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3860  extracellular solute-binding protein family 1  21.34 
 
 		 463 aa  59.3  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.952749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.75 
 
 		 458 aa  58.9  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  22.92 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0208  putative extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 		 458 aa  58.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0085185  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3369  extracellular solute-binding protein family 1  31.25 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4936  extracellular solute-binding protein family 1  21.34 
 
 		 463 aa  59.3  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.105521 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 		 421 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6933  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  22.74 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0038808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3472  extracellular solute-binding protein family 1  22.86 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.09 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  26.79 
 
 		 435 aa  58.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3546  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 		 419 aa  58.5  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000421461  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  22.06 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2418  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7218  extracellular solute-binding protein  21.72 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  25.62 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0998  extracellular solute-binding protein family 1  23.46 
 
 		 451 aa  57.4  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>