More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1711 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1711  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 454 aa  905    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.795485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1708  extracellular solute-binding protein family 1  49.78 
 
 		 458 aa  426  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  29.66 
 
 		 457 aa  111  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  28.65 
 
 		 456 aa  109  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  29.13 
 
 		 416 aa  103  8e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4488  extracellular solute-binding protein family 1  27.42 
 
 		 434 aa  98.2  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.395657  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  29.24 
 
 		 421 aa  94  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4059  extracellular solute-binding protein family 1  29.69 
 
 		 440 aa  89.4  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  25.94 
 
 		 445 aa  89.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  29.97 
 
 		 427 aa  89  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  26.33 
 
 		 412 aa  87.4  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 421 aa  85.5  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 		 455 aa  85.5  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0910  extracellular solute-binding protein family 1  29.39 
 
 		 466 aa  84.3  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.764586  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3999  extracellular solute-binding protein family 1  29.25 
 
 		 452 aa  83.6  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220113  normal  0.250177 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  25.36 
 
 		 414 aa  83.6  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  27.74 
 
 		 412 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27350  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.35 
 
 		 444 aa  81.6  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.404715  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  26.93 
 
 		 441 aa  82  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 		 424 aa  80.1  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1698  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 		 447 aa  79.3  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  28.33 
 
 		 402 aa  79.3  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  24.65 
 
 		 423 aa  78.6  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3703  extracellular solute-binding protein family 1  27.59 
 
 		 466 aa  78.2  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0104923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6528  extracellular solute-binding protein family 1  25.18 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  28.08 
 
 		 425 aa  77.8  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2832  extracellular solute-binding protein family 1  25.53 
 
 		 417 aa  77  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04070  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.01 
 
 		 444 aa  76.6  0.0000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2358  extracellular solute-binding protein  26.9 
 
 		 441 aa  76.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  27.73 
 
 		 444 aa  75.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1296  extracellular solute-binding protein family 1  26.75 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2114  extracellular solute-binding protein family 1  28.48 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3771  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 		 421 aa  73.9  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 		 419 aa  73.9  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1080  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 		 426 aa  73.2  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103993 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4241  extracellular solute-binding protein family 1  26.83 
 
 		 422 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  26.67 
 
 		 426 aa  72  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0915  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  27.27 
 
 		 443 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  22.11 
 
 		 410 aa  72  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  23.65 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  31.61 
 
 		 415 aa  70.5  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2999  extracellular solute-binding protein  24.52 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.662901  hitchhiker  0.0000395876 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15560  extracellular solute-binding protein family 1  24.88 
 
 		 418 aa  70.5  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6732  extracellular solute-binding protein family 1  27.11 
 
 		 425 aa  70.5  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2146  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 		 414 aa  70.1  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8464  extracellular solute-binding protein family 1  24.24 
 
 		 481 aa  69.7  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.635867  normal  0.0842744 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  26.49 
 
 		 421 aa  69.7  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4883  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.44 
 
 		 417 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134037  normal  0.0630481 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0310  extracellular solute-binding protein family 1  27.08 
 
 		 440 aa  69.3  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0877495  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3450  extracellular solute-binding protein family 1  28 
 
 		 436 aa  69.7  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2013  extracellular solute-binding protein family 1  27.46 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.991542  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  23.5 
 
 		 424 aa  68.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3566  extracellular solute-binding protein family 1  26.46 
 
 		 426 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  27.21 
 
 		 449 aa  69.3  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0592  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 		 456 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000165278  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3752  extracellular solute-binding protein family 1  28.33 
 
 		 436 aa  68.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1681  extracellular solute-binding protein  27.12 
 
 		 436 aa  68.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.901925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 		 420 aa  67.8  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 		 420 aa  68.2  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3944  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 		 464 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.920276  normal  0.0416082 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0127  extracellular solute-binding protein family 1  26.06 
 
 		 442 aa  67.8  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5002  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.5 
 
 		 426 aa  67.8  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.287585  normal  0.158884 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0687  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 		 407 aa  67.4  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.376534  normal  0.15795 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 		 417 aa  67.4  0.0000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  29.21 
 
 		 445 aa  67.4  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3793  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 		 437 aa  67  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.742912 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2513  extracellular solute-binding protein family 1  24.16 
 
 		 441 aa  67.4  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3988  extracellular solute-binding protein family 1  24.68 
 
 		 422 aa  67.4  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  24.32 
 
 		 403 aa  67  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0974  extracellular solute-binding protein family 1  24.91 
 
 		 435 aa  66.6  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606433  normal  0.163223 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14790  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.16 
 
 		 424 aa  65.9  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.0502834 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  27.03 
 
 		 439 aa  66.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15380  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.64 
 
 		 465 aa  66.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.479356  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0633  extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 		 436 aa  66.2  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 		 421 aa  66.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2463  extracellular solute-binding protein  26.78 
 
 		 437 aa  66.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  21.36 
 
 		 427 aa  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  24.4 
 
 		 424 aa  66.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  23.63 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  28.34 
 
 		 428 aa  66.2  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1187  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 		 426 aa  66.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.118326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  23.29 
 
 		 410 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1963  extracellular solute-binding protein family 1  24.67 
 
 		 449 aa  65.9  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.734467  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  27.09 
 
 		 434 aa  64.7  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.86 
 
 		 407 aa  64.7  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3956  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.32 
 
 		 416 aa  65.1  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.282171  normal  0.0187852 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1895  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 		 445 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.854658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  24.59 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4148  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 426 aa  64.3  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0472509  normal  0.106363 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4134  extracellular solute-binding protein family 1  26.58 
 
 		 437 aa  63.9  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4357  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 		 455 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4443  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 		 455 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0226595 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0063  extracellular solute-binding protein family 1  29.25 
 
 		 475 aa  63.9  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4737  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 		 455 aa  63.9  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  22.91 
 
 		 429 aa  63.9  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0403  extracellular solute-binding protein family 1  27.11 
 
 		 426 aa  63.5  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512139  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  27.3 
 
 		 434 aa  63.2  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  23.93 
 
 		 464 aa  62.4  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 		 426 aa  63.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>