More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1708 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1708  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 458 aa  929    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1711  extracellular solute-binding protein family 1  49.89 
 
 		 454 aa  412  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.795485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 		 455 aa  103  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  27.92 
 
 		 416 aa  102  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  26.19 
 
 		 456 aa  100  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0063  extracellular solute-binding protein family 1  29.24 
 
 		 475 aa  94  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 		 420 aa  89.4  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 		 420 aa  89  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  31.68 
 
 		 441 aa  87.4  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  24.16 
 
 		 415 aa  87  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 		 457 aa  86.3  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0910  extracellular solute-binding protein family 1  25.86 
 
 		 466 aa  83.2  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.764586  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4059  extracellular solute-binding protein family 1  28.49 
 
 		 440 aa  83.6  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  28.31 
 
 		 414 aa  80.5  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2146  extracellular solute-binding protein  25.3 
 
 		 414 aa  80.1  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 		 410 aa  80.1  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1698  extracellular solute-binding protein family 1  24.8 
 
 		 447 aa  79.3  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  24.37 
 
 		 445 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  26.19 
 
 		 427 aa  79  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15560  extracellular solute-binding protein family 1  23.45 
 
 		 418 aa  78.2  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2114  extracellular solute-binding protein family 1  28.38 
 
 		 428 aa  77.4  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5002  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.12 
 
 		 426 aa  77.4  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.287585  normal  0.158884 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  23.9 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1380  extracellular solute-binding protein family 1  26.14 
 
 		 453 aa  76.6  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2832  extracellular solute-binding protein family 1  24.57 
 
 		 417 aa  76.6  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  21.85 
 
 		 412 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  29.94 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  22.84 
 
 		 427 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  25.74 
 
 		 403 aa  73.9  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  22.46 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 		 424 aa  73.2  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  24.42 
 
 		 410 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0310  extracellular solute-binding protein family 1  25.34 
 
 		 440 aa  72  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0877495  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14790  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.76 
 
 		 424 aa  72  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.0502834 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1187  extracellular solute-binding protein  23.38 
 
 		 426 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.118326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  24.41 
 
 		 402 aa  71.2  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0687  extracellular solute-binding protein  23.3 
 
 		 407 aa  71.2  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.376534  normal  0.15795 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  24.1 
 
 		 421 aa  70.1  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  25.56 
 
 		 437 aa  69.7  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4148  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 		 426 aa  69.7  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0472509  normal  0.106363 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2526  extracellular solute-binding protein family 1  24.47 
 
 		 520 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430481  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  28.4 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  23.91 
 
 		 410 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4147  extracellular solute-binding protein family 1  28.05 
 
 		 441 aa  68.6  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.892231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4241  extracellular solute-binding protein family 1  26.13 
 
 		 422 aa  68.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  25.61 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  25.9 
 
 		 429 aa  67.8  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1548  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.45 
 
 		 438 aa  67.4  0.0000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000392798  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  23.63 
 
 		 444 aa  67  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  27 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  28.7 
 
 		 444 aa  66.6  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1080  extracellular solute-binding protein  23.82 
 
 		 426 aa  66.6  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103993 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  28.82 
 
 		 433 aa  66.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.36 
 
 		 407 aa  66.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  24.1 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  27.53 
 
 		 435 aa  65.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0374  extracellular solute-binding protein family 1  30.29 
 
 		 458 aa  65.1  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0240532 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3246  extracellular solute-binding protein family 1  24.05 
 
 		 440 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00178427  normal  0.716937 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15380  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.54 
 
 		 465 aa  65.1  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.479356  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1371  extracellular solute-binding protein family 1  31.4 
 
 		 438 aa  65.1  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0508  extracellular solute-binding protein family 1  29.38 
 
 		 514 aa  64.7  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  24.5 
 
 		 459 aa  64.7  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1485  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  22.99 
 
 		 429 aa  64.3  0.000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0431  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 435 aa  63.9  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3075  sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  21.79 
 
 		 431 aa  63.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.111769 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  26.78 
 
 		 434 aa  63.2  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2144  sugar-binding periplasmic signal peptide protein  25.35 
 
 		 441 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000125903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0720  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.98 
 
 		 440 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000241977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  24.09 
 
 		 439 aa  62.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5409  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.47 
 
 		 457 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4883  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.92 
 
 		 417 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134037  normal  0.0630481 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  27.93 
 
 		 430 aa  62  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4693  extracellular solute-binding protein family 1  29.08 
 
 		 457 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.363745 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.83 
 
 		 438 aa  61.6  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 		 424 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0048  extracellular solute-binding protein family 1  24.42 
 
 		 434 aa  61.6  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1269  extracellular solute-binding protein family 1  25.87 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  24.28 
 
 		 443 aa  60.8  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17020  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.14 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00301962  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04070  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.65 
 
 		 444 aa  60.8  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04930  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.99 
 
 		 442 aa  60.8  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  22.19 
 
 		 452 aa  60.8  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2274  extracellular solute-binding protein family 1  26.13 
 
 		 428 aa  60.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0192  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  21.47 
 
 		 463 aa  60.8  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  27.74 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  22.58 
 
 		 439 aa  60.5  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0714  ABC transporter substrate-binding protein  35.51 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0490  extracellular solute-binding protein  26.28 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000283806  hitchhiker  0.00214005 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0289  extracellular solute-binding protein  30.89 
 
 		 437 aa  60.1  0.00000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000019091  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1150  extracellular solute-binding protein  23.04 
 
 		 441 aa  60.1  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.344094  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4993  extracellular solute-binding protein family 1  23.65 
 
 		 432 aa  60.1  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0450999  normal  0.012477 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3944  extracellular solute-binding protein  24.21 
 
 		 464 aa  60.1  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.920276  normal  0.0416082 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0721  extracellular solute-binding protein  30.65 
 
 		 437 aa  60.1  0.00000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540981  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2358  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 441 aa  60.1  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5274  extracellular solute-binding protein family 1  32.12 
 
 		 442 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3623  extracellular solute-binding protein family 1  26.91 
 
 		 442 aa  59.3  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00170169  normal  0.0768086 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3988  extracellular solute-binding protein family 1  26.96 
 
 		 422 aa  59.7  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6528  extracellular solute-binding protein family 1  22.75 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2254  extracellular solute-binding protein family 1  23 
 
 		 432 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534892  hitchhiker  0.00235651 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4488  extracellular solute-binding protein family 1  24.28 
 
 		 434 aa  59.3  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.395657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>