More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3075 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3075  sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  100 
 
 
431 aa  879    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.111769 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  32.07 
 
 
432 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0687  extracellular solute-binding protein  31.49 
 
 
407 aa  171  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.376534  normal  0.15795 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  30.05 
 
 
420 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  29.8 
 
 
420 aa  162  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  29.74 
 
 
432 aa  162  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14790  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.25 
 
 
424 aa  157  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.0502834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5002  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  30.28 
 
 
426 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.287585  normal  0.158884 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  32.92 
 
 
416 aa  152  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  28.5 
 
 
432 aa  151  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4174  extracellular solute-binding protein family 1  27.93 
 
 
426 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4213  extracellular solute-binding protein family 1  27.93 
 
 
426 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.215316  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0192  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  28.25 
 
 
463 aa  150  3e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2114  extracellular solute-binding protein family 1  29.84 
 
 
428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  26.93 
 
 
421 aa  143  7e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0284  extracellular solute-binding protein family 1  29.67 
 
 
414 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1080  extracellular solute-binding protein  28.6 
 
 
426 aa  138  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2254  extracellular solute-binding protein family 1  26.82 
 
 
432 aa  137  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534892  hitchhiker  0.00235651 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1187  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 
426 aa  133  6.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.118326  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1604  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 
425 aa  128  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01821  solute-binding family 1 protein  25.78 
 
 
434 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0108  twin-arginine translocation pathway signal  26.42 
 
 
435 aa  112  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.77402 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2013  extracellular solute-binding protein family 1  26.28 
 
 
423 aa  111  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.991542  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0152  putative sugar-binding protein  30 
 
 
436 aa  108  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10950  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.25 
 
 
423 aa  92.8  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.575293  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  28.34 
 
 
457 aa  84  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.44 
 
 
422 aa  83.6  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  27.75 
 
 
434 aa  83.6  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 
444 aa  83.2  0.000000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  23.91 
 
 
424 aa  82.4  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 
423 aa  81.6  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  22.69 
 
 
402 aa  81.3  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3999  extracellular solute-binding protein family 1  25.49 
 
 
452 aa  80.1  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220113  normal  0.250177 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  20.97 
 
 
411 aa  78.2  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  24.5 
 
 
427 aa  77.8  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  22.16 
 
 
434 aa  76.6  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  24.89 
 
 
442 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  29.06 
 
 
410 aa  73.9  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  29.06 
 
 
410 aa  73.9  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  24.28 
 
 
430 aa  74.3  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  24.14 
 
 
415 aa  73.6  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0224  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 
431 aa  73.6  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  25.44 
 
 
440 aa  73.6  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  25.88 
 
 
414 aa  73.6  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3216  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 
425 aa  73.2  0.000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.949389 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  23.99 
 
 
430 aa  72.8  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  28.08 
 
 
426 aa  72.4  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15040  extracellular solute-binding protein family 1  33.56 
 
 
458 aa  72.4  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.751229  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 
417 aa  71.6  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1708  extracellular solute-binding protein family 1  21.87 
 
 
458 aa  71.2  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  26.76 
 
 
459 aa  70.5  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  23.91 
 
 
432 aa  70.5  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1963  extracellular solute-binding protein family 1  26.77 
 
 
449 aa  70.1  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.734467  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  23.35 
 
 
446 aa  69.3  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.91 
 
 
438 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  28.16 
 
 
412 aa  68.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  22.58 
 
 
424 aa  67.8  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  25.09 
 
 
436 aa  67.8  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20470  extracellular solute-binding protein family 1  24.06 
 
 
406 aa  68.2  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000403753  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 
488 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  23.72 
 
 
430 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0656  extracellular solute-binding protein family 1  23.66 
 
 
431 aa  68.2  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31335 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  22.92 
 
 
410 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6732  extracellular solute-binding protein family 1  25.35 
 
 
425 aa  67.8  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255639  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2627  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
434 aa  67.4  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00662506  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  25.99 
 
 
411 aa  67.4  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  25.99 
 
 
411 aa  67.4  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  27.83 
 
 
412 aa  67  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  22.72 
 
 
426 aa  67  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0289  extracellular solute-binding protein  20.88 
 
 
437 aa  66.6  0.0000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000019091  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  21.73 
 
 
429 aa  66.2  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1494  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.71 
 
 
438 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  28.38 
 
 
488 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25.12 
 
 
431 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  24.54 
 
 
410 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 
456 aa  64.3  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  33.59 
 
 
420 aa  64.3  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  26.55 
 
 
443 aa  64.3  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0127  extracellular solute-binding protein family 1  29 
 
 
442 aa  63.9  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2119  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 
382 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  21 
 
 
459 aa  63.5  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0721  extracellular solute-binding protein  21.75 
 
 
437 aa  63.5  0.000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540981  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.06 
 
 
426 aa  63.2  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5409  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.06 
 
 
457 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2294  extracellular solute-binding protein family 1  24.87 
 
 
448 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4737  extracellular solute-binding protein  22.92 
 
 
455 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  24.59 
 
 
435 aa  62.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0942  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 
418 aa  62.8  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.254009  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2796  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
468 aa  63.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 
412 aa  62.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  23.73 
 
 
450 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2197  extracellular solute-binding protein family 1  25.29 
 
 
429 aa  62  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.700843  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4357  extracellular solute-binding protein  23.37 
 
 
455 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200959  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  23.23 
 
 
399 aa  62.4  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  27.95 
 
 
411 aa  62  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0552  extracellular solute-binding protein  26.85 
 
 
445 aa  62  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.764632 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4443  extracellular solute-binding protein  23.37 
 
 
455 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0226595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 
414 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2315  extracellular solute-binding protein family 1  25.59 
 
 
503 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1099  extracellular solute-binding protein  23.75 
 
 
420 aa  61.6  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000491601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>