More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2832 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2832  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 417 aa  840    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4993  extracellular solute-binding protein family 1  60.81 
 
 		 432 aa  495  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0450999  normal  0.012477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3842  extracellular solute-binding protein family 1  53.45 
 
 		 429 aa  432  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0316121  normal  0.0422385 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  34.79 
 
 		 412 aa  259  6e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  34.79 
 
 		 412 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  34.71 
 
 		 421 aa  258  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2146  extracellular solute-binding protein  35.45 
 
 		 414 aa  258  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6528  extracellular solute-binding protein family 1  36.27 
 
 		 415 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4147  extracellular solute-binding protein family 1  30.66 
 
 		 441 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.892231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 423 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  29.97 
 
 		 430 aa  119  7e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.1 
 
 		 426 aa  111  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 		 414 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  27.32 
 
 		 447 aa  110  5e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4241  extracellular solute-binding protein family 1  31.47 
 
 		 422 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  27.05 
 
 		 431 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  27.24 
 
 		 428 aa  98.2  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  28 
 
 		 456 aa  95.9  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  24.5 
 
 		 410 aa  96.3  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  23.46 
 
 		 410 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  29.14 
 
 		 439 aa  95.1  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 		 429 aa  95.1  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  23.22 
 
 		 410 aa  94.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  26.96 
 
 		 435 aa  94.4  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  26.68 
 
 		 455 aa  94  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  23.03 
 
 		 403 aa  92.8  9e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  25.76 
 
 		 430 aa  90.9  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  26.58 
 
 		 427 aa  90.1  7e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 		 436 aa  89.7  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  24.33 
 
 		 411 aa  88.2  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1807  extracellular solute-binding protein family 1  29.44 
 
 		 402 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 424 aa  89  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1895  extracellular solute-binding protein  28.8 
 
 		 445 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.854658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7725  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.61 
 
 		 420 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.8 
 
 		 407 aa  88.2  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  24.18 
 
 		 457 aa  85.1  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  23.61 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 433 aa  84.3  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1708  extracellular solute-binding protein family 1  25.52 
 
 		 458 aa  84  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  24.79 
 
 		 445 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5698  extracellular solute-binding protein family 1  27.16 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.145305  normal  0.141272 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  28.57 
 
 		 446 aa  83.6  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4148  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 		 426 aa  83.2  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0472509  normal  0.106363 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.03 
 
 		 452 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  26.98 
 
 		 410 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  23.45 
 
 		 454 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  26.99 
 
 		 427 aa  81.6  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2758  extracellular solute-binding protein family 1  26.91 
 
 		 423 aa  82  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.736779  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  26.98 
 
 		 410 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0403  extracellular solute-binding protein family 1  26.73 
 
 		 426 aa  81.3  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512139  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  31.47 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  23.28 
 
 		 426 aa  80.9  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  24.72 
 
 		 404 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.47 
 
 		 422 aa  80.5  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 		 411 aa  80.1  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  29.69 
 
 		 411 aa  80.1  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  23.48 
 
 		 436 aa  79.7  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  25.16 
 
 		 419 aa  79.7  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  24.74 
 
 		 411 aa  79.3  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1711  extracellular solute-binding protein family 1  26.65 
 
 		 454 aa  79.3  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.795485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1296  extracellular solute-binding protein family 1  25.51 
 
 		 443 aa  79.7  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  27.8 
 
 		 429 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 		 453 aa  79  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.93 
 
 		 426 aa  78.2  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8464  extracellular solute-binding protein family 1  30.77 
 
 		 481 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.635867  normal  0.0842744 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2552  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 		 443 aa  78.6  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000382941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4174  extracellular solute-binding protein family 1  23.27 
 
 		 426 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.65 
 
 		 419 aa  77.8  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.83 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  26.87 
 
 		 410 aa  77.8  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  25.17 
 
 		 419 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4213  extracellular solute-binding protein family 1  23.27 
 
 		 426 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.215316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  24.42 
 
 		 431 aa  77.4  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  25.3 
 
 		 424 aa  77.8  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  24.61 
 
 		 425 aa  77.8  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 		 412 aa  77  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  26.1 
 
 		 416 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2526  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 520 aa  76.6  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430481  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 		 395 aa  76.6  0.0000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  25.44 
 
 		 416 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2845  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 		 439 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  24.83 
 
 		 426 aa  76.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4693  extracellular solute-binding protein family 1  29.71 
 
 		 457 aa  75.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.363745 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2378  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 		 451 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.612639  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0446  extracellular solute-binding protein family 1  29.67 
 
 		 424 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900099  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  24.7 
 
 		 412 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  28.44 
 
 		 496 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  25.67 
 
 		 421 aa  75.1  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  28.88 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5872  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.19 
 
 		 460 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.696543 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2274  extracellular solute-binding protein family 1  27.3 
 
 		 428 aa  74.3  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  28.44 
 
 		 439 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4863  extracellular solute-binding protein family 1  23.79 
 
 		 492 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.426159 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3895  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 		 433 aa  74.7  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  28.44 
 
 		 439 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  28.44 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  23.9 
 
 		 433 aa  74.3  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>