228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_14790 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_14790  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  100 
 
 		 424 aa  858    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.0502834 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1187  extracellular solute-binding protein  49.77 
 
 		 426 aa  412  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.118326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5002  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  48.95 
 
 		 426 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.287585  normal  0.158884 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1080  extracellular solute-binding protein  50.47 
 
 		 426 aa  411  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103993 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2013  extracellular solute-binding protein family 1  48.1 
 
 		 423 aa  400  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.991542  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2114  extracellular solute-binding protein family 1  45.95 
 
 		 428 aa  372  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2254  extracellular solute-binding protein family 1  44.6 
 
 		 432 aa  352  5.9999999999999994e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534892  hitchhiker  0.00235651 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10950  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  40.85 
 
 		 423 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.575293  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0192  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  33.41 
 
 		 463 aa  241  2e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 		 432 aa  176  8e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 		 432 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 		 420 aa  155  9e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  28.82 
 
 		 432 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 		 420 aa  154  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3075  sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  28.91 
 
 		 431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.111769 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  30.13 
 
 		 421 aa  142  8e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  28.68 
 
 		 416 aa  142  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4174  extracellular solute-binding protein family 1  27.25 
 
 		 426 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4213  extracellular solute-binding protein family 1  27.25 
 
 		 426 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.215316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0687  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 		 407 aa  135  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.376534  normal  0.15795 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0284  extracellular solute-binding protein family 1  27.64 
 
 		 414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1604  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 		 425 aa  123  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01821  solute-binding family 1 protein  24.1 
 
 		 434 aa  100  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0152  putative sugar-binding protein  26.96 
 
 		 436 aa  95.9  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0108  twin-arginine translocation pathway signal  24.2 
 
 		 435 aa  95.9  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.77402 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  26.03 
 
 		 426 aa  85.1  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 		 424 aa  84  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  24.26 
 
 		 415 aa  83.6  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  26.93 
 
 		 427 aa  81.6  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  29.17 
 
 		 422 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1708  extracellular solute-binding protein family 1  24.76 
 
 		 458 aa  72.4  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  24.53 
 
 		 446 aa  71.2  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 		 429 aa  71.6  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 424 aa  71.2  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  24.89 
 
 		 419 aa  70.5  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  24.94 
 
 		 430 aa  70.5  0.00000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 		 430 aa  70.5  0.00000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.5 
 
 		 430 aa  69.7  0.00000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  21.24 
 
 		 454 aa  69.7  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  22.63 
 
 		 406 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.91 
 
 		 406 aa  68.6  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  26.8 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  23.93 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  24.54 
 
 		 459 aa  67.4  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  24.04 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 		 483 aa  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  25.51 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5476  extracellular solute-binding protein family 1  23.7 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.487316 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.93 
 
 		 426 aa  64.7  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0403  extracellular solute-binding protein family 1  24.5 
 
 		 426 aa  63.9  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512139  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  20.69 
 
 		 459 aa  63.5  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3860  extracellular solute-binding protein family 1  23.7 
 
 		 463 aa  63.2  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.952749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4936  extracellular solute-binding protein family 1  23.7 
 
 		 463 aa  63.2  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.105521 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5213  extracellular solute-binding protein family 1  23.41 
 
 		 415 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.506772 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  25.07 
 
 		 428 aa  61.6  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  23.51 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  28.65 
 
 		 440 aa  62.4  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  22.08 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  24.21 
 
 		 423 aa  61.2  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3553  extracellular solute-binding protein  23.27 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  24 
 
 		 420 aa  60.8  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  24.48 
 
 		 442 aa  60.1  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2164  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0845615 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  22.73 
 
 		 402 aa  59.3  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  23.16 
 
 		 422 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  20.8 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  23.12 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.87 
 
 		 453 aa  58.9  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  23.95 
 
 		 436 aa  58.9  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  25.54 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  23.75 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1812  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.41 
 
 		 430 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2336  extracellular solute-binding protein family 1  23.41 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  35.94 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01287  predicted sugar transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  23.41 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1425  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.41 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01298  hypothetical protein  23.41 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2315  extracellular solute-binding protein  23.41 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1711  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 454 aa  57  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.795485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1520  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.59 
 
 		 430 aa  57  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  20.57 
 
 		 416 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  23.45 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  20.67 
 
 		 419 aa  56.2  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  22.47 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2364  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.75 
 
 		 416 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  23.56 
 
 		 411 aa  55.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  21.71 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5687  extracellular solute-binding protein family 1  22.39 
 
 		 401 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.627079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  22.85 
 
 		 447 aa  55.1  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  24.23 
 
 		 412 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3329  extracellular solute-binding protein  34.06 
 
 		 431 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0332045  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  26.56 
 
 		 412 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1055  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 418 aa  55.8  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.404897  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  23.95 
 
 		 421 aa  55.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.23 
 
 		 434 aa  55.1  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  24.23 
 
 		 412 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  21.98 
 
 		 445 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  23.41 
 
 		 441 aa  54.7  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>