More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2164 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01287  predicted sugar transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  73.65 
 
 		 430 aa  676    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2336  extracellular solute-binding protein family 1  73.41 
 
 		 430 aa  673    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1812  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  73.88 
 
 		 430 aa  675    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1520  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  73.65 
 
 		 430 aa  672    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2315  extracellular solute-binding protein  73.65 
 
 		 430 aa  676    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1425  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  73.65 
 
 		 430 aa  676    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01298  hypothetical protein  73.65 
 
 		 430 aa  676    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2164  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 430 aa  890    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0845615 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1524  extracellular solute-binding protein family 1  49.66 
 
 		 439 aa  460  9.999999999999999e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0074  extracellular solute-binding protein  27.66 
 
 		 429 aa  180  4e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1353  extracellular solute-binding protein family 1  25.69 
 
 		 434 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0306  extracellular solute-binding protein family 1  25.36 
 
 		 473 aa  101  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1283  extracellular solute-binding protein  23.87 
 
 		 450 aa  96.3  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  unclonable  0.0000000346676  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  22.92 
 
 		 459 aa  86.7  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0656  extracellular solute-binding protein family 1  27.64 
 
 		 431 aa  83.2  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31335 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0224  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 		 431 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  24.31 
 
 		 427 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.21 
 
 		 438 aa  80.5  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1494  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.95 
 
 		 438 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  26.27 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  22.94 
 
 		 405 aa  77  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3386  extracellular solute-binding protein family 1  31.75 
 
 		 440 aa  76.3  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  26.88 
 
 		 425 aa  74.3  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  26.69 
 
 		 403 aa  72.8  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  30.27 
 
 		 439 aa  72.4  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.59 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3270  extracellular solute-binding protein family 1  30.69 
 
 		 435 aa  70.9  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.543416  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  27.74 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  23.64 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  26.99 
 
 		 432 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  27.05 
 
 		 410 aa  69.7  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3752  extracellular solute-binding protein family 1  28.77 
 
 		 436 aa  68.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  31.21 
 
 		 427 aa  68.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.71 
 
 		 426 aa  67.8  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2418  extracellular solute-binding protein family 1  24.38 
 
 		 447 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2358  extracellular solute-binding protein  28.33 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  28.07 
 
 		 436 aa  68.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  23.35 
 
 		 504 aa  68.2  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  21.32 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  21.88 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3450  extracellular solute-binding protein family 1  28.42 
 
 		 436 aa  67.8  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  24.23 
 
 		 421 aa  67  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  25.73 
 
 		 424 aa  66.6  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  24.08 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  28.33 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  25.85 
 
 		 432 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  26.01 
 
 		 426 aa  65.1  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.16 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0845  extracellular solute-binding protein family 1  27.51 
 
 		 435 aa  64.3  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 		 424 aa  65.1  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0188  extracellular solute-binding protein  22.52 
 
 		 420 aa  64.3  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6631  extracellular solute-binding protein family 1  25.78 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0631  extracellular solute-binding protein family 1  27.51 
 
 		 435 aa  64.3  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2662  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 433 aa  63.9  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.377519  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0633  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 		 436 aa  63.9  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  29.13 
 
 		 432 aa  63.5  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3771  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 		 421 aa  63.2  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2730  extracellular solute-binding protein family 1  22.32 
 
 		 399 aa  63.2  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2707  mannitol ABC transporter, periplasmic mannitol-binding protein  26.27 
 
 		 440 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.069342  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6240  ABC transporter substrate binding protein (maltose)  25.22 
 
 		 407 aa  62.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0994607  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  29.49 
 
 		 495 aa  62.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0361  extracellular solute-binding protein  23.29 
 
 		 444 aa  62.8  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.678366  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0698  extracellular solute-binding protein family 1  26.95 
 
 		 428 aa  62  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0317884  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3775  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 		 441 aa  62  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.577316  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5687  extracellular solute-binding protein family 1  25.33 
 
 		 401 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.627079  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  27.75 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0270  extracellular solute-binding protein  21.07 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.562219  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 		 432 aa  61.6  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5698  extracellular solute-binding protein family 1  22.11 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.145305  normal  0.141272 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  25.56 
 
 		 444 aa  60.8  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2463  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 		 437 aa  60.5  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  25.79 
 
 		 432 aa  60.5  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0702  extracellular solute-binding protein  24.38 
 
 		 440 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.812706  normal  0.378032 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2144  sugar-binding periplasmic signal peptide protein  24.34 
 
 		 441 aa  60.1  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000125903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27350  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.9 
 
 		 444 aa  59.7  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.404715  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0490  extracellular solute-binding protein  23.72 
 
 		 440 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000283806  hitchhiker  0.00214005 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0721  extracellular solute-binding protein  25.15 
 
 		 437 aa  59.3  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540981  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5926  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.38 
 
 		 441 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2619  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.925096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14790  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.62 
 
 		 424 aa  59.3  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.0502834 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2511  extracellular solute-binding protein  24.38 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0464819  normal  0.359234 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 		 411 aa  59.3  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1985  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0378619  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2643  extracellular solute-binding protein  24.38 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0222782  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2595  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13364  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 420 aa  59.3  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  24.75 
 
 		 420 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5711  sugar uptake ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  21.07 
 
 		 448 aa  59.3  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.188634  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0333  maltose/mannitol ABC transporter, periplasmic maltose/mannitol-binding protein, putative  24.61 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00410857  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  26.22 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  24.22 
 
 		 454 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  23.62 
 
 		 421 aa  58.5  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0473  extracellular solute-binding protein  21.9 
 
 		 420 aa  58.9  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0631  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  24.61 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2465  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  24.61 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0872  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  24.61 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0876  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  24.61 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0755942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>