More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1812 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01287  predicted sugar transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  99.07 
 
 		 430 aa  875    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2336  extracellular solute-binding protein family 1  98.84 
 
 		 430 aa  874    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1520  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  98.37 
 
 		 430 aa  868    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1812  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  100 
 
 		 430 aa  884    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2315  extracellular solute-binding protein  99.07 
 
 		 430 aa  875    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1425  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  99.07 
 
 		 430 aa  875    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2164  extracellular solute-binding protein  73.88 
 
 		 430 aa  675    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0845615 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01298  hypothetical protein  99.07 
 
 		 430 aa  875    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1524  extracellular solute-binding protein family 1  48.29 
 
 		 439 aa  450  1e-125  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0074  extracellular solute-binding protein  29.84 
 
 		 429 aa  204  3e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0306  extracellular solute-binding protein family 1  26.87 
 
 		 473 aa  110  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1353  extracellular solute-binding protein family 1  24.7 
 
 		 434 aa  106  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  23.41 
 
 		 459 aa  103  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1283  extracellular solute-binding protein  23.83 
 
 		 450 aa  98.2  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  unclonable  0.0000000346676  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1494  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.26 
 
 		 438 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  26.59 
 
 		 424 aa  82.4  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  22.05 
 
 		 411 aa  82.8  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  25.72 
 
 		 428 aa  82  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  25.82 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0224  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 		 431 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.23 
 
 		 438 aa  79.7  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  28.66 
 
 		 439 aa  75.9  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 		 426 aa  75.9  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6631  extracellular solute-binding protein family 1  23.22 
 
 		 410 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0188  extracellular solute-binding protein  22.05 
 
 		 420 aa  74.3  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6240  ABC transporter substrate binding protein (maltose)  26.75 
 
 		 407 aa  74.3  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0994607  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  24.92 
 
 		 425 aa  73.6  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 		 424 aa  73.6  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  23.88 
 
 		 427 aa  73.2  0.000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  24.48 
 
 		 433 aa  73.2  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0656  extracellular solute-binding protein family 1  26.3 
 
 		 431 aa  71.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31335 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  26.07 
 
 		 432 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3752  extracellular solute-binding protein family 1  27.99 
 
 		 436 aa  70.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 		 399 aa  70.9  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1548  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  22.67 
 
 		 438 aa  70.5  0.00000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000392798  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.15 
 
 		 426 aa  70.1  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3450  extracellular solute-binding protein family 1  27.67 
 
 		 436 aa  70.1  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0631  extracellular solute-binding protein family 1  28.04 
 
 		 435 aa  69.7  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3386  extracellular solute-binding protein family 1  29.44 
 
 		 440 aa  69.3  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4516  extracellular solute-binding protein  23.1 
 
 		 432 aa  68.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  22.92 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0915  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  26.8 
 
 		 443 aa  68.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  24.16 
 
 		 504 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0633  extracellular solute-binding protein  23.64 
 
 		 436 aa  68.2  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0845  extracellular solute-binding protein family 1  28.04 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27350  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.33 
 
 		 444 aa  68.2  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.404715  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.23 
 
 		 406 aa  67.8  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5687  extracellular solute-binding protein family 1  23.66 
 
 		 401 aa  67.4  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.627079  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  23.42 
 
 		 436 aa  67  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0698  extracellular solute-binding protein family 1  26.2 
 
 		 428 aa  66.6  0.0000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0317884  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3779  extracellular solute-binding protein family 1  27.57 
 
 		 430 aa  66.6  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.292836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 		 432 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 466 aa  66.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  24.25 
 
 		 456 aa  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  22.79 
 
 		 414 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  23.86 
 
 		 413 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  23.86 
 
 		 399 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  23.17 
 
 		 427 aa  64.7  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  23.43 
 
 		 413 aa  64.3  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2305  extracellular solute-binding protein  23.51 
 
 		 459 aa  64.3  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5698  extracellular solute-binding protein family 1  20.83 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.145305  normal  0.141272 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0473  extracellular solute-binding protein  22.04 
 
 		 420 aa  64.3  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 		 420 aa  63.9  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3777  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 		 436 aa  63.9  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.253936  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  23.75 
 
 		 446 aa  63.5  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0192  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.93 
 
 		 463 aa  63.5  0.000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  21.87 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3270  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 		 435 aa  63.2  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.543416  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  27.6 
 
 		 420 aa  63.2  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  22.66 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  22.5 
 
 		 421 aa  63.2  0.000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  27.67 
 
 		 427 aa  62.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  26.75 
 
 		 416 aa  62.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4016  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  23.91 
 
 		 437 aa  62.8  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  28.48 
 
 		 495 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2358  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 441 aa  62.4  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3575  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  23.91 
 
 		 437 aa  62  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.91 
 
 		 430 aa  62  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0772443  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3709  extracellular solute-binding protein  23.91 
 
 		 437 aa  62  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5337  extracellular solute-binding protein family 1  23.18 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401132  normal  0.122337 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1094  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 		 439 aa  62  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.962008  normal  0.028756 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5711  sugar uptake ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  21.05 
 
 		 448 aa  61.2  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.188634  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  29.79 
 
 		 427 aa  61.6  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1060  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  29.07 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.065415  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.62 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  22.88 
 
 		 455 aa  61.6  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  22.58 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  27.27 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0138  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 434 aa  60.8  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  19.54 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4116  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 447 aa  61.2  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000719407  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  21.6 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 		 411 aa  60.5  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4566  extracellular solute-binding protein  24.65 
 
 		 453 aa  60.5  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4174  extracellular solute-binding protein family 1  24.18 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1258  twin-arginine translocation pathway signal  24.18 
 
 		 442 aa  60.1  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0270  extracellular solute-binding protein  21.48 
 
 		 419 aa  60.1  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.562219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>