266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0074 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0074  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
429 aa  880    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1524  extracellular solute-binding protein family 1  32.68 
 
 
439 aa  225  1e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1520  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  29.84 
 
 
430 aa  204  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1812  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  29.84 
 
 
430 aa  204  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01287  predicted sugar transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  29.61 
 
 
430 aa  203  4e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01298  hypothetical protein  29.61 
 
 
430 aa  203  4e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1425  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  29.61 
 
 
430 aa  203  4e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2315  extracellular solute-binding protein  29.61 
 
 
430 aa  203  4e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62001  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2336  extracellular solute-binding protein family 1  29.61 
 
 
430 aa  203  6e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2164  extracellular solute-binding protein  27.66 
 
 
430 aa  180  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0845615 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1353  extracellular solute-binding protein family 1  28.67 
 
 
434 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1283  extracellular solute-binding protein  27.66 
 
 
450 aa  141  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  unclonable  0.0000000346676  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0306  extracellular solute-binding protein family 1  28.4 
 
 
473 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  21.58 
 
 
459 aa  83.2  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  28.29 
 
 
433 aa  80.9  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0364  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  26.94 
 
 
438 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4468  extracellular solute-binding protein  26.73 
 
 
436 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4812  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 
438 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  29.67 
 
 
424 aa  74.3  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  26.02 
 
 
504 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2640  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 
436 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.932575  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2925  putative maltose/mannitol ABC transporter binding protein subunit  26.89 
 
 
436 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.732093  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0974  extracellular solute-binding protein family 1  25.54 
 
 
435 aa  71.2  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606433  normal  0.163223 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4116  extracellular solute-binding protein  30.04 
 
 
447 aa  70.5  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000719407  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4325  extracellular solute-binding protein family 1  24.09 
 
 
454 aa  70.1  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0158  extracellular solute-binding protein family 1  25.36 
 
 
435 aa  70.1  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.317406 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5698  extracellular solute-binding protein family 1  25.1 
 
 
412 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.145305  normal  0.141272 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0633  extracellular solute-binding protein  24.35 
 
 
436 aa  68.6  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2058  extracellular solute-binding protein family 1  25.6 
 
 
435 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.617385 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  30.21 
 
 
439 aa  68.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0695  mannitol ABC transporter, periplasmic mannitol-binding protein  26.44 
 
 
441 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3386  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 
440 aa  67.8  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4516  extracellular solute-binding protein  23.92 
 
 
432 aa  67.4  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2440  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 
440 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0811647  decreased coverage  0.000336324 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2041  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 
436 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3246  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 
440 aa  67  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00178427  normal  0.716937 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0333  maltose/mannitol ABC transporter, periplasmic maltose/mannitol-binding protein, putative  26.14 
 
 
442 aa  67  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00410857  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1034  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 
442 aa  67  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4016  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  23.01 
 
 
437 aa  67  0.0000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0631  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  26.14 
 
 
442 aa  67  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2465  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  26.14 
 
 
442 aa  67  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0872  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  26.14 
 
 
442 aa  67  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0876  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  26.14 
 
 
442 aa  67  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0755942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0079  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  26.14 
 
 
442 aa  67  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0915  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  24.62 
 
 
443 aa  66.6  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2707  mannitol ABC transporter, periplasmic mannitol-binding protein  27.44 
 
 
440 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.069342  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  25.89 
 
 
421 aa  66.6  0.0000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3575  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  23.01 
 
 
437 aa  66.6  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3709  extracellular solute-binding protein  23.01 
 
 
437 aa  66.6  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1094  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 
439 aa  66.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.962008  normal  0.028756 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 
432 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5468  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 
442 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.303073 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27400  periplasmic mannitol-binding protein of mannitol ABC transporter  25.77 
 
 
438 aa  65.1  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  22.35 
 
 
415 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0702  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 
440 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.812706  normal  0.378032 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2870  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 
447 aa  64.3  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1494  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.07 
 
 
438 aa  64.3  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  22.26 
 
 
402 aa  64.3  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0720  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  23.46 
 
 
440 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000241977  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2144  sugar-binding periplasmic signal peptide protein  26.14 
 
 
441 aa  63.2  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000125903  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0459  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 
436 aa  63.2  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.420805  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  24.56 
 
 
425 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3270  extracellular solute-binding protein family 1  30.48 
 
 
435 aa  61.6  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.543416  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1711  extracellular solute-binding protein family 1  26.45 
 
 
450 aa  62.4  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.827618 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34420  putative binding protein component of ABC maltose/mannitol transporter  26.91 
 
 
436 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000870468  normal  0.425479 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3873  extracellular solute-binding protein family 1  19.64 
 
 
463 aa  61.2  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0964469  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5198  extracellular solute-binding protein family 1  24.92 
 
 
442 aa  60.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.06332 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5926  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.92 
 
 
441 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517551  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3450  extracellular solute-binding protein family 1  22.02 
 
 
436 aa  60.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  22.82 
 
 
427 aa  60.8  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2643  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 
441 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0222782  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2511  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 
441 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0464819  normal  0.359234 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0577  extracellular solute-binding protein  27.96 
 
 
440 aa  60.1  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3752  extracellular solute-binding protein family 1  22.25 
 
 
436 aa  60.1  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2902  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 
439 aa  59.3  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.489617 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1985  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 
441 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0378619  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2595  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 
441 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13364  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2619  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 
441 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.925096  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  22.02 
 
 
424 aa  59.3  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3779  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 
430 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.292836  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2463  extracellular solute-binding protein  22.57 
 
 
437 aa  59.3  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0490  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 
440 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000283806  hitchhiker  0.00214005 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0845  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 
435 aa  58.2  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  25.76 
 
 
427 aa  58.2  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  22.54 
 
 
414 aa  57.8  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0473  extracellular solute-binding protein  21.86 
 
 
420 aa  57.8  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2821  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 
428 aa  57.8  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.858803  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1879  extracellular solute-binding protein  20.55 
 
 
453 aa  57.8  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.909678  normal  0.114435 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  27.54 
 
 
410 aa  57.4  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4978  extracellular solute-binding protein family 1  28.38 
 
 
437 aa  57.4  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.346425  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 
435 aa  57.4  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0431  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
435 aa  57  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 
427 aa  57  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  26.49 
 
 
427 aa  56.6  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  20.98 
 
 
399 aa  56.6  0.0000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0446  extracellular solute-binding protein family 1  24.47 
 
 
424 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900099  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  25.23 
 
 
450 aa  56.2  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0631  extracellular solute-binding protein family 1  27.62 
 
 
435 aa  56.2  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0721  extracellular solute-binding protein  23.94 
 
 
437 aa  56.2  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540981  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2358  extracellular solute-binding protein  26.87 
 
 
441 aa  56.2  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>