More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_01298 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01287  predicted sugar transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  100 
 
 
430 aa  883    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2336  extracellular solute-binding protein family 1  99.77 
 
 
430 aa  882    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01298  hypothetical protein  100 
 
 
430 aa  883    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1812  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  99.07 
 
 
430 aa  875    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1425  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  100 
 
 
430 aa  883    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2315  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
430 aa  883    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62001  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1520  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  99.3 
 
 
430 aa  875    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2164  extracellular solute-binding protein  73.65 
 
 
430 aa  676    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0845615 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1524  extracellular solute-binding protein family 1  48.29 
 
 
439 aa  451  1e-125  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0074  extracellular solute-binding protein  29.61 
 
 
429 aa  203  4e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0306  extracellular solute-binding protein family 1  27.11 
 
 
473 aa  114  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1353  extracellular solute-binding protein family 1  26.57 
 
 
434 aa  107  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  23.64 
 
 
459 aa  104  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1283  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 
450 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  unclonable  0.0000000346676  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1494  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.98 
 
 
438 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  21.75 
 
 
411 aa  82  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.51 
 
 
438 aa  82  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 
424 aa  82  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  25.72 
 
 
428 aa  82  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0224  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 
431 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 
408 aa  78.2  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  25.41 
 
 
415 aa  78.2  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  24.17 
 
 
426 aa  75.1  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  29.34 
 
 
439 aa  75.1  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6631  extracellular solute-binding protein family 1  23.6 
 
 
410 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6240  ABC transporter substrate binding protein (maltose)  27.19 
 
 
407 aa  74.7  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0994607  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
425 aa  74.3  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  22.47 
 
 
427 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0656  extracellular solute-binding protein family 1  26.3 
 
 
431 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31335 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3752  extracellular solute-binding protein family 1  28.3 
 
 
436 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  25.64 
 
 
432 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 
424 aa  71.2  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3450  extracellular solute-binding protein family 1  27.99 
 
 
436 aa  70.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27350  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.63 
 
 
444 aa  70.9  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.404715  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  26.82 
 
 
399 aa  70.9  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 
414 aa  70.5  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 
433 aa  69.7  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0188  extracellular solute-binding protein  21.75 
 
 
420 aa  69.7  0.00000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3386  extracellular solute-binding protein family 1  29.44 
 
 
440 aa  68.9  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0633  extracellular solute-binding protein  22.38 
 
 
436 aa  69.3  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5698  extracellular solute-binding protein family 1  21.61 
 
 
412 aa  69.7  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.145305  normal  0.141272 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0631  extracellular solute-binding protein family 1  28.04 
 
 
435 aa  69.3  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1548  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.49 
 
 
438 aa  68.9  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000392798  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  24.15 
 
 
504 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0845  extracellular solute-binding protein family 1  28.04 
 
 
435 aa  67.8  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.41 
 
 
426 aa  68.2  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.53 
 
 
406 aa  68.2  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5687  extracellular solute-binding protein family 1  24.11 
 
 
401 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.627079  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3779  extracellular solute-binding protein family 1  27.57 
 
 
430 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.292836  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0915  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  26.38 
 
 
443 aa  67.4  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  26.47 
 
 
432 aa  66.6  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  23.71 
 
 
413 aa  66.6  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4516  extracellular solute-binding protein  22.57 
 
 
432 aa  65.9  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  23.1 
 
 
436 aa  65.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  23.86 
 
 
413 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  22.96 
 
 
410 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  22.66 
 
 
414 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  21.39 
 
 
410 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  23.86 
 
 
399 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  28.48 
 
 
495 aa  64.7  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 
420 aa  64.7  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3777  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 
436 aa  64.7  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.253936  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  23.17 
 
 
427 aa  64.7  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  23.58 
 
 
446 aa  64.3  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
415 aa  63.9  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2305  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 
459 aa  63.9  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0473  extracellular solute-binding protein  22.04 
 
 
420 aa  63.9  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0698  extracellular solute-binding protein family 1  26.77 
 
 
428 aa  63.9  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0317884  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2358  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 
441 aa  63.9  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1094  extracellular solute-binding protein  25.18 
 
 
439 aa  63.5  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.962008  normal  0.028756 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 
466 aa  63.5  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  22.76 
 
 
421 aa  63.5  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4016  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  23.75 
 
 
437 aa  63.5  0.000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  27.74 
 
 
427 aa  63.2  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3270  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 
435 aa  63.2  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.543416  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3575  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  23.75 
 
 
437 aa  62.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3709  extracellular solute-binding protein  23.75 
 
 
437 aa  62.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  26.75 
 
 
416 aa  63.2  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.38 
 
 
366 aa  62.4  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  23.35 
 
 
422 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  27.04 
 
 
411 aa  61.6  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 
420 aa  62  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  22.05 
 
 
410 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5337  extracellular solute-binding protein family 1  23.08 
 
 
434 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401132  normal  0.122337 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  29.79 
 
 
427 aa  62  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0192  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.64 
 
 
463 aa  61.2  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 
411 aa  61.6  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 
411 aa  61.2  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.62 
 
 
380 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.283496  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1060  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  29.65 
 
 
408 aa  61.6  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.065415  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  23.51 
 
 
456 aa  61.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  22.58 
 
 
403 aa  61.2  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25.37 
 
 
406 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  21.74 
 
 
405 aa  61.2  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1258  twin-arginine translocation pathway signal  24.16 
 
 
442 aa  60.5  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.91 
 
 
430 aa  60.5  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0772443  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0138  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
434 aa  60.5  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  28.15 
 
 
479 aa  60.5  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4174  extracellular solute-binding protein family 1  24.18 
 
 
426 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4644  extracellular solute-binding protein  24.25 
 
 
409 aa  60.1  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0265502  normal  0.0904039 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>