177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1879 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1879  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
453 aa  941    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.909678  normal  0.114435 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4516  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 
432 aa  82.4  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  22.65 
 
 
459 aa  79.3  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0915  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  24.37 
 
 
443 aa  70.5  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1711  extracellular solute-binding protein family 1  22.37 
 
 
450 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.827618 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4468  extracellular solute-binding protein  25.99 
 
 
436 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3246  extracellular solute-binding protein family 1  30.09 
 
 
440 aa  67  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00178427  normal  0.716937 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2144  sugar-binding periplasmic signal peptide protein  28.84 
 
 
441 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000125903  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2463  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 
437 aa  65.9  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3999  extracellular solute-binding protein family 1  24.24 
 
 
452 aa  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220113  normal  0.250177 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0720  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  29.63 
 
 
440 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000241977  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3777  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 
436 aa  65.1  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.253936  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2640  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 
436 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.932575  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  24.83 
 
 
419 aa  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4116  extracellular solute-binding protein  26.62 
 
 
447 aa  63.5  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000719407  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0364  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  25.17 
 
 
438 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2643  extracellular solute-binding protein  29.91 
 
 
441 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0222782  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2511  extracellular solute-binding protein  29.91 
 
 
441 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0464819  normal  0.359234 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  24.12 
 
 
456 aa  63.2  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0333  maltose/mannitol ABC transporter, periplasmic maltose/mannitol-binding protein, putative  28.11 
 
 
442 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00410857  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1034  extracellular solute-binding protein  28.11 
 
 
442 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3752  extracellular solute-binding protein family 1  25.89 
 
 
436 aa  63.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  24.5 
 
 
419 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0631  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  28.11 
 
 
442 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2465  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  28.11 
 
 
442 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0872  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  28.11 
 
 
442 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0876  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  28.11 
 
 
442 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0755942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0079  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  28.11 
 
 
442 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2358  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
441 aa  62.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  24.37 
 
 
439 aa  62  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0695  mannitol ABC transporter, periplasmic mannitol-binding protein  26.53 
 
 
441 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4357  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 
455 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200959  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  23.68 
 
 
430 aa  61.6  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4443  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 
455 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0226595 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0490  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 
440 aa  62  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000283806  hitchhiker  0.00214005 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  24.69 
 
 
422 aa  62  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27400  periplasmic mannitol-binding protein of mannitol ABC transporter  28.11 
 
 
438 aa  61.2  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0048  extracellular solute-binding protein  23.79 
 
 
513 aa  61.6  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  24.69 
 
 
422 aa  61.6  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2707  mannitol ABC transporter, periplasmic mannitol-binding protein  23.55 
 
 
440 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.069342  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5926  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  29.03 
 
 
441 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517551  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1985  extracellular solute-binding protein  28.84 
 
 
441 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0378619  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2619  extracellular solute-binding protein  28.84 
 
 
441 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.925096  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2595  extracellular solute-binding protein  28.84 
 
 
441 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13364  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0702  extracellular solute-binding protein  26.98 
 
 
440 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.812706  normal  0.378032 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0633  extracellular solute-binding protein  26.62 
 
 
436 aa  60.5  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  24.53 
 
 
422 aa  60.5  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4812  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 
438 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3450  extracellular solute-binding protein family 1  25.53 
 
 
436 aa  59.7  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3337  extracellular solute-binding protein family 1  26.21 
 
 
427 aa  59.7  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4737  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 
455 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2925  putative maltose/mannitol ABC transporter binding protein subunit  26.79 
 
 
436 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.732093  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0974  extracellular solute-binding protein family 1  24.42 
 
 
435 aa  58.2  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606433  normal  0.163223 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0303  extracellular solute-binding protein family 1  24.33 
 
 
478 aa  57.8  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0074  extracellular solute-binding protein  20.55 
 
 
429 aa  57.8  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0091  ABC sorbitol/mannitol transporter, periplasmic binding protein  22.95 
 
 
436 aa  57.8  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.126585  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2440  extracellular solute-binding protein  23.14 
 
 
440 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0811647  decreased coverage  0.000336324 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3119  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  21.58 
 
 
442 aa  56.6  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.657036  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  22.71 
 
 
412 aa  56.6  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1727  extracellular solute-binding protein  22.95 
 
 
436 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  23.96 
 
 
433 aa  56.6  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1681  extracellular solute-binding protein  22.74 
 
 
436 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.901925  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  24.74 
 
 
427 aa  56.2  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  22.71 
 
 
412 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.44 
 
 
438 aa  55.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34420  putative binding protein component of ABC maltose/mannitol transporter  26.43 
 
 
436 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000870468  normal  0.425479 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3409  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 
404 aa  55.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.280364  normal  0.614723 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3793  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 
437 aa  55.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.742912 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  21.88 
 
 
399 aa  55.8  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4059  extracellular solute-binding protein family 1  26.87 
 
 
440 aa  54.7  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4883  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.14 
 
 
417 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134037  normal  0.0630481 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0431  extracellular solute-binding protein  23.7 
 
 
435 aa  54.3  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4845  extracellular solute-binding protein  22.89 
 
 
434 aa  54.3  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.834917  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3313  extracellular solute-binding protein family 1  21.54 
 
 
442 aa  54.3  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.778026  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  23.47 
 
 
404 aa  54.3  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3227  extracellular solute-binding protein family 1  21.54 
 
 
442 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  23.24 
 
 
425 aa  53.9  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3674  ABC sugar transporter, periplasmic binding protein  26.18 
 
 
404 aa  53.9  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  24.38 
 
 
424 aa  53.9  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3873  extracellular solute-binding protein family 1  21.62 
 
 
463 aa  53.9  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0964469  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2058  extracellular solute-binding protein family 1  25.87 
 
 
435 aa  53.9  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.617385 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  21.83 
 
 
419 aa  53.9  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5309  extracellular solute-binding protein family 1  22.7 
 
 
447 aa  53.5  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574903  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3779  extracellular solute-binding protein family 1  24.87 
 
 
430 aa  53.5  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.292836  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  22.04 
 
 
424 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4978  extracellular solute-binding protein family 1  23.64 
 
 
437 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.346425  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  23.56 
 
 
420 aa  53.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.228974 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2041  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 
436 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1094  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 
439 aa  52.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.962008  normal  0.028756 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1520  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  32.35 
 
 
430 aa  52  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  28.78 
 
 
496 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  22.92 
 
 
421 aa  51.6  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2696  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 
498 aa  51.6  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.86 
 
 
407 aa  51.6  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0889  extracellular solute-binding protein  23 
 
 
435 aa  51.2  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.17 
 
 
452 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  21.26 
 
 
419 aa  50.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  25.7 
 
 
421 aa  50.8  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4325  extracellular solute-binding protein family 1  24.87 
 
 
454 aa  50.4  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0785  ABC transporter substrate binding protein (alpha-glucoside)  27.46 
 
 
452 aa  50.4  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>