More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0192 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0192  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  100 
 
 		 463 aa  959    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5002  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  34.43 
 
 		 426 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.287585  normal  0.158884 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14790  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  33.41 
 
 		 424 aa  241  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.0502834 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2013  extracellular solute-binding protein family 1  34.26 
 
 		 423 aa  238  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.991542  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2254  extracellular solute-binding protein family 1  33.1 
 
 		 432 aa  231  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534892  hitchhiker  0.00235651 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2114  extracellular solute-binding protein family 1  34.14 
 
 		 428 aa  230  5e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1187  extracellular solute-binding protein  32.32 
 
 		 426 aa  229  6e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.118326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1080  extracellular solute-binding protein  32.08 
 
 		 426 aa  227  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103993 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10950  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.07 
 
 		 423 aa  203  5e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.575293  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  30.44 
 
 		 432 aa  187  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  30.14 
 
 		 432 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  31.08 
 
 		 421 aa  182  9.000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  28.64 
 
 		 432 aa  179  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4213  extracellular solute-binding protein family 1  30.12 
 
 		 426 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.215316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4174  extracellular solute-binding protein family 1  30.12 
 
 		 426 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  28.67 
 
 		 420 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  28.67 
 
 		 420 aa  152  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1604  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 		 425 aa  142  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01821  solute-binding family 1 protein  25.12 
 
 		 434 aa  141  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3075  sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  28.34 
 
 		 431 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.111769 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  28.39 
 
 		 416 aa  135  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0108  twin-arginine translocation pathway signal  24.69 
 
 		 435 aa  126  8.000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.77402 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0687  extracellular solute-binding protein  25.36 
 
 		 407 aa  125  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.376534  normal  0.15795 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0284  extracellular solute-binding protein family 1  27.7 
 
 		 414 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0152  putative sugar-binding protein  26.76 
 
 		 436 aa  118  3e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  26.17 
 
 		 427 aa  99  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6192  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.89 
 
 		 431 aa  96.3  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 		 424 aa  95.5  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3553  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 		 419 aa  89  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 		 415 aa  87  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  23.43 
 
 		 426 aa  85.1  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  24.53 
 
 		 420 aa  82.8  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.228974 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  23.8 
 
 		 415 aa  81.6  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0499  extracellular solute-binding protein family 1  26.86 
 
 		 434 aa  77.4  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000057577 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  24.38 
 
 		 456 aa  77.4  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04610  extracellular solute-binding protein family 1  23.76 
 
 		 431 aa  76.6  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0298  extracellular solute-binding protein  22.94 
 
 		 486 aa  76.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1485  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.37 
 
 		 429 aa  75.5  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  21.98 
 
 		 459 aa  74.7  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0137  extracellular solute-binding protein family 1  23.12 
 
 		 453 aa  74.7  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  22.25 
 
 		 459 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2364  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.4 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 		 411 aa  73.2  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1199  extracellular solute-binding protein family 1  26.11 
 
 		 432 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000829014 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  21.79 
 
 		 414 aa  73.2  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  25.13 
 
 		 442 aa  72.8  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1126  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 		 432 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190587  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  23.91 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  26 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1494  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.79 
 
 		 438 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  25.95 
 
 		 430 aa  70.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  21.98 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  23.61 
 
 		 426 aa  70.5  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3128  extracellular solute-binding protein family 1  27.22 
 
 		 450 aa  69.7  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0477771 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1371  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 438 aa  69.7  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1296  extracellular solute-binding protein family 1  22.76 
 
 		 443 aa  69.7  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  22.69 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  22.56 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  22.03 
 
 		 403 aa  68.2  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.95 
 
 		 441 aa  68.2  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  24.2 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  23.75 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  23.04 
 
 		 406 aa  67.8  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  30.38 
 
 		 430 aa  67  0.0000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  21.56 
 
 		 454 aa  67  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  30.38 
 
 		 430 aa  67  0.0000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  22.57 
 
 		 446 aa  67  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  22.66 
 
 		 419 aa  67  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.93 
 
 		 449 aa  66.6  0.0000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  31.4 
 
 		 434 aa  65.9  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  24.06 
 
 		 410 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  23.84 
 
 		 428 aa  66.2  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  23.12 
 
 		 440 aa  65.9  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25.63 
 
 		 431 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2036  extracellular solute-binding protein family 1  23.62 
 
 		 439 aa  65.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.182591  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  22.84 
 
 		 436 aa  65.9  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  26.38 
 
 		 437 aa  65.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  23.23 
 
 		 441 aa  64.7  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 		 457 aa  64.7  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2627  extracellular solute-binding protein family 1  22.88 
 
 		 434 aa  64.7  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00662506  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  23 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  23 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  22.17 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  29.84 
 
 		 433 aa  64.7  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  22.25 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  22.97 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04270  extracellular solute-binding protein family 1  23.28 
 
 		 418 aa  64.3  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1702  sugar-binding protein  23.74 
 
 		 442 aa  63.9  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.981171  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4241  extracellular solute-binding protein family 1  21.71 
 
 		 422 aa  63.5  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1812  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.93 
 
 		 430 aa  63.5  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  26.03 
 
 		 422 aa  63.5  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 		 444 aa  63.2  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0224  extracellular solute-binding protein  22.55 
 
 		 431 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  22.86 
 
 		 416 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2052  extracellular solute-binding protein  22.78 
 
 		 438 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3216  extracellular solute-binding protein  22.92 
 
 		 425 aa  62.4  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.949389 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24 
 
 		 366 aa  62  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  21.56 
 
 		 399 aa  61.6  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 434 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>