248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2254 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2254  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
432 aa  872    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534892  hitchhiker  0.00235651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5002  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  49.54 
 
 
426 aa  415  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.287585  normal  0.158884 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1080  extracellular solute-binding protein  48.15 
 
 
426 aa  412  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1187  extracellular solute-binding protein  47.69 
 
 
426 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.118326  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2013  extracellular solute-binding protein family 1  47.11 
 
 
423 aa  396  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.991542  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2114  extracellular solute-binding protein family 1  43.88 
 
 
428 aa  356  5e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14790  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  44.6 
 
 
424 aa  352  7e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.0502834 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10950  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  39.95 
 
 
423 aa  321  9.999999999999999e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.575293  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0192  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  33.1 
 
 
463 aa  231  3e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  29.37 
 
 
421 aa  166  6.9999999999999995e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  27.21 
 
 
432 aa  159  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4174  extracellular solute-binding protein family 1  26.15 
 
 
426 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  28.09 
 
 
432 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4213  extracellular solute-binding protein family 1  26.15 
 
 
426 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.215316  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  28.19 
 
 
432 aa  154  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1604  extracellular solute-binding protein  23.93 
 
 
425 aa  143  6e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  28.19 
 
 
420 aa  133  5e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  28.19 
 
 
420 aa  132  9e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0687  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 
407 aa  128  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.376534  normal  0.15795 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3075  sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  26.93 
 
 
431 aa  126  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.111769 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01821  solute-binding family 1 protein  24.22 
 
 
434 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0284  extracellular solute-binding protein family 1  28.89 
 
 
414 aa  120  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 
416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0108  twin-arginine translocation pathway signal  25.25 
 
 
435 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.77402 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0152  putative sugar-binding protein  26.41 
 
 
436 aa  104  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 
429 aa  82  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  24.11 
 
 
415 aa  80.9  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 
423 aa  80.9  0.00000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  23.96 
 
 
427 aa  70.5  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 
412 aa  70.9  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  23.9 
 
 
424 aa  70.5  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0296  hypothetical protein  25.14 
 
 
439 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  25.33 
 
 
412 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.09 
 
 
418 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  31.79 
 
 
483 aa  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  24.8 
 
 
412 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.57 
 
 
434 aa  65.1  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  23.71 
 
 
414 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  24.56 
 
 
442 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  22.39 
 
 
446 aa  65.5  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2364  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.34 
 
 
416 aa  63.5  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128582  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  23.61 
 
 
415 aa  63.5  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  25.3 
 
 
435 aa  63.2  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0770  extracellular solute-binding protein family 1  25.58 
 
 
444 aa  62.4  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2834  extracellular solute-binding protein  27.36 
 
 
459 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.873121  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15060  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.1 
 
 
457 aa  62.4  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.138683  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 
419 aa  62.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0291  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 
449 aa  63.2  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  23.01 
 
 
414 aa  62  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3941  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  23.73 
 
 
436 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 
393 aa  62  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.35 
 
 
422 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
411 aa  62  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 
457 aa  62  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  29.48 
 
 
410 aa  61.6  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  23.87 
 
 
459 aa  61.2  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  23.15 
 
 
412 aa  60.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  28 
 
 
415 aa  60.8  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  23.03 
 
 
402 aa  60.8  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  27.13 
 
 
422 aa  60.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2058  extracellular solute-binding protein family 1  24.33 
 
 
435 aa  60.5  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.617385 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3566  extracellular solute-binding protein family 1  27.62 
 
 
426 aa  60.1  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3944  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 
464 aa  60.1  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.920276  normal  0.0416082 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1708  extracellular solute-binding protein family 1  23 
 
 
458 aa  59.3  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  23.1 
 
 
410 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2460  extracellular solute-binding protein family 1  23.17 
 
 
441 aa  58.9  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.372805  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  23.04 
 
 
437 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  22.72 
 
 
430 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2920  extracellular solute-binding protein family 1  23.11 
 
 
424 aa  57.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 
420 aa  58.2  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.228974 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  24.2 
 
 
419 aa  58.2  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  24.1 
 
 
504 aa  57.8  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7201  extracellular solute-binding protein family 1  27.74 
 
 
447 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1524  extracellular solute-binding protein family 1  26.07 
 
 
439 aa  57.4  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 
433 aa  57  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1976  extracellular solute-binding protein family 1  26.09 
 
 
477 aa  56.6  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  22.15 
 
 
412 aa  56.6  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1321  extracellular solute-binding protein family 1  25.36 
 
 
410 aa  56.6  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2958  extracellular solute-binding protein family 1  25.36 
 
 
410 aa  56.6  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.347864  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0721  extracellular solute-binding protein  23.98 
 
 
437 aa  56.6  0.0000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540981  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  23.56 
 
 
431 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5698  extracellular solute-binding protein family 1  21.45 
 
 
412 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.145305  normal  0.141272 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3651  hypothetical protein  21.72 
 
 
437 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  0.0762923 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0289  extracellular solute-binding protein  23.98 
 
 
437 aa  55.8  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000019091  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  24.66 
 
 
434 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  23.88 
 
 
411 aa  55.8  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  28.31 
 
 
403 aa  55.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2627  extracellular solute-binding protein family 1  24.74 
 
 
434 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00662506  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  27.55 
 
 
416 aa  55.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  22.9 
 
 
406 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  23.47 
 
 
410 aa  54.7  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  23.1 
 
 
410 aa  55.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  23.51 
 
 
421 aa  55.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0914  maltose/maltodextrin ABC transporter, periplasmic maltose/maltodextrin-binding protein  24.61 
 
 
411 aa  54.7  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.459005  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  23.31 
 
 
439 aa  54.7  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  23.89 
 
 
454 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.49 
 
 
426 aa  54.3  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0158  extracellular solute-binding protein family 1  24.88 
 
 
435 aa  54.7  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.317406 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  22.53 
 
 
425 aa  54.3  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0075  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 
441 aa  53.9  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>