More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_15560 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_15560  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 418 aa  858    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1150  extracellular solute-binding protein  49.87 
 
 		 441 aa  421  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.344094  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0227  extracellular solute-binding protein  51.26 
 
 		 424 aa  391  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.998322  normal  0.257108 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0228  extracellular solute-binding protein  43.82 
 
 		 435 aa  352  1e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6533  normal  0.282981 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3428  extracellular solute-binding protein  45.48 
 
 		 425 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390518  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0232  extracellular solute-binding protein  40.09 
 
 		 425 aa  298  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4871  extracellular solute-binding protein family 1  39.38 
 
 		 434 aa  289  7e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.618682  normal  0.377624 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7039  extracellular solute-binding protein  38.17 
 
 		 428 aa  262  8.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3847  extracellular solute-binding protein family 1  36.8 
 
 		 421 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00585532  normal  0.205792 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3299  extracellular solute-binding protein  35.36 
 
 		 421 aa  229  5e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4148  extracellular solute-binding protein  34.01 
 
 		 426 aa  213  7e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0472509  normal  0.106363 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  28 
 
 		 439 aa  159  8e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 		 423 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  23.88 
 
 		 466 aa  93.6  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  24.63 
 
 		 431 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  26.22 
 
 		 425 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 		 410 aa  91.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  23.46 
 
 		 425 aa  91.3  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  22.45 
 
 		 417 aa  91.3  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  27.52 
 
 		 435 aa  89.7  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1438  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 		 400 aa  87.4  4e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000172655  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 		 461 aa  87  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0310  extracellular solute-binding protein family 1  24.43 
 
 		 443 aa  86.7  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20470  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 		 406 aa  84.7  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000403753  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.07 
 
 		 426 aa  84.3  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0144  extracellular solute-binding protein  23.04 
 
 		 403 aa  83.6  0.000000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  26.47 
 
 		 441 aa  82.4  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 		 424 aa  82.8  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0512  extracellular solute-binding protein  25.35 
 
 		 423 aa  81.3  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00024476  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2146  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 		 414 aa  81.3  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  24.33 
 
 		 410 aa  80.5  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6192  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.3 
 
 		 431 aa  80.5  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.08 
 
 		 407 aa  80.1  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  24.69 
 
 		 410 aa  79.7  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  24.09 
 
 		 420 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  23.83 
 
 		 428 aa  79  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  23.23 
 
 		 429 aa  78.6  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 		 488 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  26.04 
 
 		 414 aa  77.8  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0499  extracellular solute-binding protein family 1  25.23 
 
 		 434 aa  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000057577 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  26 
 
 		 488 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  24.04 
 
 		 428 aa  77.4  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2611  extracellular solute-binding protein family 1  27.82 
 
 		 453 aa  76.6  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  23.68 
 
 		 427 aa  76.6  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 		 415 aa  76.6  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1702  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 		 422 aa  76.6  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  22.89 
 
 		 406 aa  76.3  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  23.04 
 
 		 424 aa  75.9  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  25.34 
 
 		 403 aa  76.3  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  22.85 
 
 		 435 aa  75.9  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  22.57 
 
 		 412 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  25.22 
 
 		 436 aa  75.5  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  23.6 
 
 		 421 aa  75.1  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2209  extracellular solute-binding protein family 1  22.94 
 
 		 487 aa  74.3  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 		 445 aa  74.3  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2582  extracellular solute-binding protein family 1  25.8 
 
 		 416 aa  74.7  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  24.27 
 
 		 416 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  24.27 
 
 		 416 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  22.56 
 
 		 405 aa  74.3  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1708  extracellular solute-binding protein family 1  23.45 
 
 		 458 aa  74.3  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  22.82 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  24.17 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  23.19 
 
 		 457 aa  73.6  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  21.29 
 
 		 430 aa  73.6  0.000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  21.29 
 
 		 430 aa  73.2  0.000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  25.36 
 
 		 410 aa  73.2  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  25.36 
 
 		 410 aa  73.2  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  23.82 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0895  extracellular solute-binding protein family 1  23.59 
 
 		 436 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.441999 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  23.26 
 
 		 417 aa  72.4  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0274  extracellular solute-binding protein  23.99 
 
 		 439 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.285114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  21.45 
 
 		 420 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3183  extracellular solute-binding protein family 1  24 
 
 		 411 aa  71.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.641192  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  25.74 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  25.28 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  24.71 
 
 		 435 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  22.28 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  24.75 
 
 		 444 aa  70.9  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1711  extracellular solute-binding protein family 1  24.18 
 
 		 454 aa  70.5  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.795485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0596  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00439649  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2958  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 		 410 aa  69.7  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.347864  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  26.04 
 
 		 445 aa  69.7  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  22.75 
 
 		 434 aa  69.3  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  23.32 
 
 		 419 aa  69.7  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  21.55 
 
 		 434 aa  68.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  23.86 
 
 		 415 aa  68.6  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  23.06 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0188  extracellular solute-binding protein  21.63 
 
 		 420 aa  68.9  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  23.32 
 
 		 419 aa  68.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  21.75 
 
 		 424 aa  67.8  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04610  extracellular solute-binding protein family 1  23.05 
 
 		 431 aa  67.4  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1170  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.441465  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0322  extracellular solute-binding protein  22.97 
 
 		 419 aa  67  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  22.44 
 
 		 435 aa  67  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  22.74 
 
 		 411 aa  67  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  22.98 
 
 		 426 aa  67  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  25.3 
 
 		 442 aa  67  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1269  extracellular solute-binding protein family 1  22.72 
 
 		 412 aa  66.2  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>