More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4059 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_4059  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 440 aa  876    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.07 
 
 		 453 aa  204  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  35.33 
 
 		 437 aa  203  6e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17020  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  35 
 
 		 431 aa  192  8e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00301962  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  31.32 
 
 		 445 aa  175  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0310  extracellular solute-binding protein family 1  32.1 
 
 		 440 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0877495  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  28.88 
 
 		 449 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0048  extracellular solute-binding protein family 1  28.74 
 
 		 434 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04070  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.28 
 
 		 444 aa  150  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  29.32 
 
 		 444 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  29.6 
 
 		 438 aa  148  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3304  extracellular solute-binding protein family 1  29.56 
 
 		 441 aa  146  6e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753481 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.54 
 
 		 450 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04000  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  31.17 
 
 		 445 aa  140  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  28.57 
 
 		 447 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1762  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.75 
 
 		 438 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000740157  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  27.45 
 
 		 439 aa  137  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  29.52 
 
 		 458 aa  131  3e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  28.32 
 
 		 456 aa  129  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  28.5 
 
 		 445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.59 
 
 		 449 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4188  extracellular solute-binding protein family 1  29.49 
 
 		 454 aa  127  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1064  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 		 480 aa  116  7.999999999999999e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.075314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  25.93 
 
 		 437 aa  86.7  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  25.77 
 
 		 434 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1711  extracellular solute-binding protein family 1  30.56 
 
 		 454 aa  84.7  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.795485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 424 aa  84.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  26.3 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1708  extracellular solute-binding protein family 1  27.87 
 
 		 458 aa  80.5  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  24.57 
 
 		 446 aa  78.2  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2808  extracellular solute-binding protein family 1  25.49 
 
 		 430 aa  77.4  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.512241 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  26.1 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2896  extracellular solute-binding protein  27.56 
 
 		 452 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 		 429 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1879  extracellular solute-binding protein  27.56 
 
 		 452 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  25.38 
 
 		 456 aa  70.5  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  25.3 
 
 		 447 aa  70.9  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  25.43 
 
 		 445 aa  70.1  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  23.6 
 
 		 422 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  22.93 
 
 		 457 aa  67.8  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3222  extracellular solute-binding protein family 1  25.7 
 
 		 457 aa  67.8  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.950328  normal  0.818094 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2418  extracellular solute-binding protein family 1  28.65 
 
 		 447 aa  67  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3944  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 		 464 aa  66.6  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.920276  normal  0.0416082 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3131  extracellular solute-binding protein family 1  24.18 
 
 		 422 aa  66.6  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00803878 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0322  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 		 419 aa  66.6  0.0000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  28.85 
 
 		 420 aa  66.6  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  23.58 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  26.19 
 
 		 425 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  23.47 
 
 		 439 aa  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3329  extracellular solute-binding protein  22.02 
 
 		 431 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0332045  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  29.32 
 
 		 414 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  30.3 
 
 		 415 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  25.52 
 
 		 504 aa  65.9  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3999  extracellular solute-binding protein family 1  23.73 
 
 		 452 aa  65.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220113  normal  0.250177 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  28.7 
 
 		 419 aa  65.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 423 aa  64.7  0.000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  30.83 
 
 		 433 aa  64.3  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 424 aa  64.3  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0375  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  24.02 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 		 421 aa  63.9  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  25.72 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0972  extracellular solute-binding protein family 1  24.41 
 
 		 421 aa  63.5  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  27.64 
 
 		 421 aa  63.5  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 		 455 aa  63.2  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1785  extracellular solute-binding protein family 1  25.8 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.155279  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  25.9 
 
 		 439 aa  63.2  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  29.63 
 
 		 411 aa  62.8  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.81 
 
 		 419 aa  62.8  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  26.98 
 
 		 419 aa  62.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0378  extracellular solute-binding protein family 1  24.56 
 
 		 420 aa  63.2  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 		 423 aa  62.4  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2265  extracellular solute-binding protein family 1  26.42 
 
 		 418 aa  62.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  23.65 
 
 		 412 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  26.32 
 
 		 443 aa  62.4  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0340  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0736  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 		 421 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  21.94 
 
 		 421 aa  61.2  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1080  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 		 426 aa  61.6  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103993 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19280  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.41 
 
 		 416 aa  61.6  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.147667  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3674  ABC sugar transporter, periplasmic binding protein  29.11 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3409  extracellular solute-binding protein  29.11 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.280364  normal  0.614723 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0698  extracellular solute-binding protein family 1  23.13 
 
 		 428 aa  60.8  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0317884  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 		 424 aa  61.2  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0476  extracellular solute-binding protein family 1  27.22 
 
 		 401 aa  61.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0842  extracellular solute-binding protein family 1  24.62 
 
 		 432 aa  60.8  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  24.08 
 
 		 442 aa  60.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0791  extracellular solute-binding protein family 1  28.34 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.418273 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  20.75 
 
 		 416 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3590  extracellular solute-binding protein  22.2 
 
 		 438 aa  60.5  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 		 444 aa  60.1  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 		 424 aa  60.5  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  25.68 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4488  extracellular solute-binding protein family 1  27.7 
 
 		 434 aa  59.7  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.395657  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 		 414 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  25.45 
 
 		 522 aa  59.7  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2308  extracellular solute-binding protein  20.54 
 
 		 440 aa  59.3  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000253431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>