216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3623 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3623  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 442 aa  889    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00170169  normal  0.0768086 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0115  extracellular solute-binding protein family 1  52.44 
 
 		 478 aa  464  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132691  normal  0.193469 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5608  extracellular solute-binding protein family 1  52.12 
 
 		 427 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.959607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3613  extracellular solute-binding protein family 1  50.48 
 
 		 429 aa  412  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.249837  normal  0.747368 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6532  extracellular solute-binding protein family 1  50.87 
 
 		 427 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0178193 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4889  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.8 
 
 		 429 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2914  extracellular solute-binding protein family 1  28.97 
 
 		 440 aa  99.4  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0434  extracellular solute-binding protein family 1  27.63 
 
 		 444 aa  97.1  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.3 
 
 		 434 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  25.86 
 
 		 417 aa  94  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  24.84 
 
 		 422 aa  91.7  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3838  extracellular solute-binding protein  29.57 
 
 		 420 aa  89.7  8e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 423 aa  82.4  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.08 
 
 		 458 aa  81.6  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  26.52 
 
 		 431 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  25.14 
 
 		 434 aa  79  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0237  extracellular solute-binding protein family 1  26.17 
 
 		 444 aa  78.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  26.22 
 
 		 434 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 		 408 aa  74.7  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  24.84 
 
 		 424 aa  74.3  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3716  extracellular solute-binding protein family 1  25.68 
 
 		 440 aa  72.8  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3675  extracellular solute-binding protein family 1  25.26 
 
 		 447 aa  71.6  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0540  ABC transporter, substrate-binding protein  24.3 
 
 		 461 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0996  extracellular solute-binding protein family 1  21.33 
 
 		 455 aa  70.1  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 454 aa  69.7  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  30.1 
 
 		 422 aa  68.2  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.25 
 
 		 438 aa  68.2  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3914  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 		 457 aa  67  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0556  ABC transporter, solute-binding protein  23.72 
 
 		 461 aa  66.6  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  24 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  21.04 
 
 		 444 aa  66.6  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4033  extracellular solute-binding protein  26.8 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3483  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2647  extracellular solute-binding protein family 1  33.65 
 
 		 446 aa  65.9  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.890591  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1708  extracellular solute-binding protein family 1  27.32 
 
 		 458 aa  66.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1490  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.07 
 
 		 442 aa  65.1  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.095095  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3941  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.14 
 
 		 436 aa  65.1  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1492  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.81 
 
 		 441 aa  64.7  0.000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3350  extracellular solute-binding protein family 1  23.15 
 
 		 461 aa  64.3  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.08 
 
 		 427 aa  63.9  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  29.9 
 
 		 427 aa  62.8  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  22.87 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3041  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 		 429 aa  62.4  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887996  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 		 415 aa  62.4  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1485  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.72 
 
 		 429 aa  62  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3534  extracellular solute-binding protein family 1  26.74 
 
 		 445 aa  60.8  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.582574 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0127  extracellular solute-binding protein family 1  27.1 
 
 		 442 aa  61.2  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  24.85 
 
 		 470 aa  60.8  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09490  extracellular solute-binding protein family 1  24.29 
 
 		 424 aa  60.5  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.48456e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0998  extracellular solute-binding protein family 1  24.03 
 
 		 451 aa  60.1  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3657  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  22.19 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  25.09 
 
 		 413 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2706  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 		 422 aa  59.3  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.5087  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  21.84 
 
 		 419 aa  59.7  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  25.5 
 
 		 399 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.27 
 
 		 406 aa  59.3  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  28.89 
 
 		 424 aa  58.9  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2657  extracellular solute-binding protein family 1  25.56 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000100934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1248  extracellular solute-binding protein family 1  24.08 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.494424  normal  0.639356 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0529  extracellular solute-binding protein  27.08 
 
 		 464 aa  58.5  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.361956  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  23.9 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1356  extracellular solute-binding protein  26.83 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0142784  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3651  hypothetical protein  24.29 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  0.0762923 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  27.87 
 
 		 456 aa  57  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  25.46 
 
 		 427 aa  57  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  26.26 
 
 		 455 aa  57  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3600  extracellular solute-binding protein family 1  25.63 
 
 		 425 aa  57  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0910  extracellular solute-binding protein family 1  30.73 
 
 		 466 aa  56.6  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.764586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  22.75 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3246  extracellular solute-binding protein family 1  23.21 
 
 		 443 aa  56.2  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  24.42 
 
 		 420 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  22.55 
 
 		 414 aa  56.2  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1478  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  20.69 
 
 		 439 aa  56.2  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000417686  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  24.42 
 
 		 420 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  22.83 
 
 		 408 aa  56.2  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  31.5 
 
 		 430 aa  56.2  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1651  extracellular solute-binding protein  23.84 
 
 		 427 aa  55.8  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.660801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  24.33 
 
 		 419 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4568  extracellular solute-binding protein family 1  24.14 
 
 		 410 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.267408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 		 427 aa  55.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 448 aa  55.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  22.61 
 
 		 422 aa  55.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  27.8 
 
 		 435 aa  55.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3546  extracellular solute-binding protein  24.29 
 
 		 419 aa  55.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000421461  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00840  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.54 
 
 		 451 aa  55.8  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  24.42 
 
 		 419 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2999  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 		 419 aa  54.7  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.662901  hitchhiker  0.0000395876 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0267  extracellular solute-binding protein family 1  27.09 
 
 		 462 aa  54.7  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.39283  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 		 419 aa  54.7  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0168  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 412 aa  54.3  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3237  extracellular solute-binding protein family 1  30.28 
 
 		 464 aa  54.3  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  23.14 
 
 		 439 aa  53.9  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  22.43 
 
 		 414 aa  53.9  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01750  carbohydrate-binding protein  26 
 
 		 457 aa  53.5  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110954  normal  0.899537 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3935  extracellular solute-binding protein  24.38 
 
 		 420 aa  53.5  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0774395  normal  0.611638 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4454  extracellular solute-binding protein family 1  25.17 
 
 		 466 aa  53.1  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7166  alpha-glucoside ABC transporter  27.01 
 
 		 451 aa  53.1  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3967  extracellular solute-binding protein  31.33 
 
 		 448 aa  53.5  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182057  normal  0.154584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>