243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1492 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1492  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  100 
 
 
441 aa  898    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1490  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  54.98 
 
 
442 aa  491  1e-137  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.095095  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3365  extracellular solute-binding protein family 1  35.23 
 
 
455 aa  225  1e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.079846  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1360  extracellular solute-binding protein  33.85 
 
 
478 aa  211  3e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.937812  normal  0.278157 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2590  extracellular solute-binding protein family 1  27.36 
 
 
464 aa  140  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5441  extracellular solute-binding protein family 1  27.44 
 
 
452 aa  140  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  26.57 
 
 
470 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4454  extracellular solute-binding protein family 1  25.39 
 
 
466 aa  128  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1218  extracellular solute-binding protein family 1  26.94 
 
 
444 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1306  extracellular solute-binding protein family 1  26.65 
 
 
445 aa  120  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00840  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.54 
 
 
451 aa  117  6e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1243  extracellular solute-binding protein  24.36 
 
 
444 aa  111  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0184  extracellular solute-binding protein family 1  25.75 
 
 
450 aa  109  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01480  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25 
 
 
435 aa  107  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4612  extracellular solute-binding protein family 1  23.58 
 
 
437 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6971  extracellular solute-binding protein family 1  23.54 
 
 
431 aa  94  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.487837  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2415  extracellular solute-binding protein family 1  23.22 
 
 
433 aa  92.8  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2783  extracellular solute-binding protein family 1  24.64 
 
 
431 aa  91.3  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185157  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0540  ABC transporter, substrate-binding protein  25.61 
 
 
461 aa  89  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0145  extracellular solute-binding protein family 1  25.72 
 
 
442 aa  86.3  9e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0556  ABC transporter, solute-binding protein  24.08 
 
 
461 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  23.33 
 
 
424 aa  79.3  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  25.94 
 
 
427 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3534  extracellular solute-binding protein family 1  25.4 
 
 
445 aa  76.3  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.582574 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2657  extracellular solute-binding protein family 1  23.46 
 
 
422 aa  74.7  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000100934  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  25.31 
 
 
444 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 
452 aa  73.2  0.000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2983  extracellular solute-binding protein family 1  21.5 
 
 
425 aa  72.8  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0701  extracellular solute-binding protein family 1  25.58 
 
 
432 aa  73.2  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0059  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 
439 aa  72.4  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 
435 aa  70.9  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.22 
 
 
407 aa  70.5  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  24.91 
 
 
434 aa  69.3  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 
434 aa  69.7  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25.13 
 
 
431 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 
415 aa  67.4  0.0000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  24.45 
 
 
417 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0199  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
423 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.136897  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0205  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
423 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  24.4 
 
 
451 aa  65.5  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6532  extracellular solute-binding protein family 1  26.87 
 
 
427 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0178193 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  24.28 
 
 
419 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  23.44 
 
 
441 aa  64.7  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  23.83 
 
 
457 aa  64.7  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2576  extracellular solute-binding protein family 1  25.56 
 
 
614 aa  64.3  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  24.28 
 
 
420 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4425  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 
446 aa  64.3  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.446855  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  24.28 
 
 
420 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 
419 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  23.36 
 
 
425 aa  63.9  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3183  extracellular solute-binding protein family 1  25.46 
 
 
411 aa  63.9  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.641192  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  23.96 
 
 
419 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5608  extracellular solute-binding protein family 1  26.51 
 
 
427 aa  63.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.959607  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  23.64 
 
 
419 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  22.77 
 
 
468 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  26.89 
 
 
432 aa  61.6  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3246  extracellular solute-binding protein family 1  23.98 
 
 
443 aa  61.6  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4033  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 
429 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.04 
 
 
434 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6933  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.93 
 
 
412 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0038808  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  23.29 
 
 
419 aa  61.6  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4563  extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 
439 aa  61.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.01 
 
 
441 aa  60.8  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3623  extracellular solute-binding protein family 1  23.43 
 
 
442 aa  60.1  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00170169  normal  0.0768086 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2102  periplasmic protein  22.11 
 
 
447 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.502645  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 
415 aa  60.1  0.00000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 
437 aa  59.7  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  25.14 
 
 
410 aa  59.7  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0127  extracellular solute-binding protein family 1  24.21 
 
 
442 aa  59.3  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  23.52 
 
 
435 aa  59.3  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  25.87 
 
 
441 aa  59.3  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 
412 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 
412 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  25.91 
 
 
425 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
412 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  24.15 
 
 
423 aa  58.2  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  25.28 
 
 
446 aa  58.5  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.2 
 
 
430 aa  58.5  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  24.17 
 
 
424 aa  58.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  24.31 
 
 
436 aa  58.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2611  extracellular solute-binding protein family 1  26.79 
 
 
453 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058641  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  27.02 
 
 
410 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2376  extracellular solute-binding protein family 1  24.81 
 
 
438 aa  57.8  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0529  extracellular solute-binding protein  23 
 
 
464 aa  57.8  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.361956  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1963  extracellular solute-binding protein family 1  21.97 
 
 
449 aa  57  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.734467  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  24.77 
 
 
441 aa  57  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0227  extracellular solute-binding protein  27.73 
 
 
424 aa  57  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.998322  normal  0.257108 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12290  maltose-binding periplasmic protein  28.15 
 
 
422 aa  56.6  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0134652  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  22.59 
 
 
424 aa  56.6  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
412 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 
435 aa  56.2  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  27.61 
 
 
422 aa  56.2  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  25.45 
 
 
415 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  23.04 
 
 
419 aa  55.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0573  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 
460 aa  55.8  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1792  extracellular solute-binding protein  25.17 
 
 
462 aa  56.2  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  24.58 
 
 
504 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5027  extracellular solute-binding protein family 1  23.55 
 
 
434 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0894368  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  24.27 
 
 
420 aa  55.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1651  extracellular solute-binding protein  23 
 
 
427 aa  54.7  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.660801  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>