203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2657 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2657  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 422 aa  869    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000100934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2706  extracellular solute-binding protein  60.55 
 
 		 422 aa  500  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.5087  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3405  extracellular solute-binding protein  59.13 
 
 		 419 aa  499  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3546  extracellular solute-binding protein  58.39 
 
 		 419 aa  499  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000421461  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0449  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  57.58 
 
 		 419 aa  495  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0516  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  57.93 
 
 		 419 aa  493  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2646  extracellular solute-binding protein family 1  60.96 
 
 		 419 aa  491  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1651  extracellular solute-binding protein  55.58 
 
 		 427 aa  486  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.660801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2906  extracellular solute-binding protein family 1  60.2 
 
 		 419 aa  485  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1356  extracellular solute-binding protein  57.62 
 
 		 418 aa  484  1e-135  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0142784  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2472  extracellular solute-binding protein  59.16 
 
 		 419 aa  483  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.250047 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4033  extracellular solute-binding protein  57 
 
 		 429 aa  483  1e-135  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3153  extracellular solute-binding protein  54.78 
 
 		 417 aa  480  1e-134  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000182033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0208  putative extracellular solute-binding protein  45.22 
 
 		 458 aa  375  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0085185  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  29.47 
 
 		 427 aa  176  9e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  26.61 
 
 		 419 aa  96.3  9e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  27.88 
 
 		 422 aa  87.8  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  26.65 
 
 		 410 aa  86.3  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.46 
 
 		 441 aa  85.9  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 		 423 aa  83.6  0.000000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  25.96 
 
 		 417 aa  80.9  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  28.88 
 
 		 431 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  25.39 
 
 		 435 aa  76.3  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.03 
 
 		 458 aa  75.9  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 		 408 aa  75.9  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  24.1 
 
 		 408 aa  75.5  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 		 419 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0434  extracellular solute-binding protein family 1  25.64 
 
 		 444 aa  75.1  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 		 419 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  25.51 
 
 		 413 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 		 470 aa  73.6  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  22.41 
 
 		 468 aa  73.2  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 		 419 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.74 
 
 		 434 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 		 420 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 		 420 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 		 419 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3041  extracellular solute-binding protein  23.67 
 
 		 429 aa  69.7  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887996  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0548  extracellular solute-binding protein family 1  23.86 
 
 		 426 aa  68.9  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0032157  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1947  extracellular solute-binding protein  23.5 
 
 		 428 aa  69.7  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.709657  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  23.29 
 
 		 424 aa  68.2  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2380  extracellular solute-binding protein family 1  25.73 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  22.97 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  25.15 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  25.51 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 		 420 aa  67  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3483  extracellular solute-binding protein  28.81 
 
 		 417 aa  67  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  26.63 
 
 		 434 aa  67  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09490  extracellular solute-binding protein family 1  22.54 
 
 		 424 aa  66.6  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.48456e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6532  extracellular solute-binding protein family 1  27.41 
 
 		 427 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0178193 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5608  extracellular solute-binding protein family 1  26.27 
 
 		 427 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.959607  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  24.75 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3613  extracellular solute-binding protein family 1  25.58 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.249837  normal  0.747368 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2997  extracellular solute-binding protein family 1  24.76 
 
 		 462 aa  64.3  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000366828  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.05 
 
 		 452 aa  64.3  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1492  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.46 
 
 		 441 aa  63.5  0.000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1490  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  22.32 
 
 		 442 aa  63.2  0.000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.095095  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 		 439 aa  62.8  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  23.93 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7218  extracellular solute-binding protein  22.36 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1485  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.67 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.01 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6933  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.56 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0038808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1248  extracellular solute-binding protein family 1  23.89 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.494424  normal  0.639356 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2327  extracellular solute-binding protein family 1  24 
 
 		 424 aa  59.7  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  25.5 
 
 		 441 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 		 452 aa  58.5  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1588  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 		 452 aa  58.5  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4984  extracellular solute-binding protein family 1  23.88 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3623  extracellular solute-binding protein family 1  25.56 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00170169  normal  0.0768086 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0291  extracellular solute-binding protein  23.03 
 
 		 449 aa  58.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  22.99 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1306  extracellular solute-binding protein family 1  24.9 
 
 		 445 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1759  extracellular solute-binding protein family 1  23.48 
 
 		 436 aa  57.8  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.071409  normal  0.0857732 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1060  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.53 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.065415  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0882  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.297168  normal  0.673205 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.58 
 
 		 380 aa  57  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.283496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1289  extracellular solute-binding protein  23.29 
 
 		 479 aa  56.6  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  25.77 
 
 		 422 aa  56.6  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24620  carbohydrate-binding protein  23.89 
 
 		 424 aa  56.2  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  24.28 
 
 		 431 aa  56.2  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000238529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0115  extracellular solute-binding protein family 1  25.88 
 
 		 478 aa  55.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132691  normal  0.193469 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1218  extracellular solute-binding protein family 1  26.13 
 
 		 444 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  22.9 
 
 		 441 aa  54.7  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  25.77 
 
 		 427 aa  54.3  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3600  extracellular solute-binding protein family 1  22.41 
 
 		 425 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 432 aa  52.4  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  22.64 
 
 		 434 aa  51.6  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2234  extracellular solute-binding protein family 1  22.9 
 
 		 419 aa  51.6  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0477  extracellular solute-binding protein family 1  24.72 
 
 		 432 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3534  extracellular solute-binding protein family 1  30.34 
 
 		 445 aa  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.582574 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3860  extracellular solute-binding protein family 1  22.67 
 
 		 463 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.952749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1543  extracellular solute-binding protein family 1  30.43 
 
 		 478 aa  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.793818  normal  0.0319696 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 		 421 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4936  extracellular solute-binding protein family 1  22.67 
 
 		 463 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.105521 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1698  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 447 aa  51.6  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>