157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1289 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1976  extracellular solute-binding protein family 1  81.33 
 
 		 477 aa  688    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1289  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 479 aa  974    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2194  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 414 aa  168  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00903267  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  23.73 
 
 		 429 aa  81.3  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  22.33 
 
 		 422 aa  70.1  0.00000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1588  extracellular solute-binding protein  22.66 
 
 		 452 aa  68.2  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.69 
 
 		 407 aa  66.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  22.83 
 
 		 431 aa  65.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  24.05 
 
 		 425 aa  63.5  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  22.43 
 
 		 430 aa  63.5  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  24.23 
 
 		 432 aa  61.6  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  23.46 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 		 432 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0996  extracellular solute-binding protein family 1  24.8 
 
 		 455 aa  61.2  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1494  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.01 
 
 		 438 aa  60.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 419 aa  60.5  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  24.02 
 
 		 495 aa  60.1  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  22.99 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00840  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.73 
 
 		 451 aa  58.5  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2821  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 		 428 aa  58.2  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.858803  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  21.66 
 
 		 457 aa  58.2  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  23.5 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2049  extracellular solute-binding protein family 1  23.87 
 
 		 438 aa  57.8  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2657  extracellular solute-binding protein family 1  21.65 
 
 		 422 aa  57.4  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000100934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1762  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.82 
 
 		 438 aa  57  0.0000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000740157  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1524  extracellular solute-binding protein family 1  24.9 
 
 		 439 aa  56.2  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 		 452 aa  56.2  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3207  extracellular solute-binding protein  28.66 
 
 		 467 aa  56.2  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  21.69 
 
 		 428 aa  56.2  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  25.7 
 
 		 423 aa  55.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 		 420 aa  55.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2551  extracellular solute-binding protein family 1  24.38 
 
 		 473 aa  55.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.35345  normal  0.255178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1041  extracellular solute-binding protein family 1  21.81 
 
 		 416 aa  55.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172945  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0770  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 		 444 aa  54.7  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  23.41 
 
 		 433 aa  54.3  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.52 
 
 		 402 aa  53.9  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  25.27 
 
 		 410 aa  53.9  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  25.27 
 
 		 410 aa  53.9  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  23.37 
 
 		 432 aa  53.9  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1807  extracellular solute-binding protein family 1  20.4 
 
 		 402 aa  53.5  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4463  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 411 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00452134  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  26.7 
 
 		 420 aa  52.4  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  24.1 
 
 		 433 aa  52.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0168  extracellular solute-binding protein family 1  22.12 
 
 		 412 aa  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4033  extracellular solute-binding protein  22.16 
 
 		 429 aa  52  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  25.44 
 
 		 456 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0508  extracellular solute-binding protein family 1  22.11 
 
 		 514 aa  51.6  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 		 435 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  22.37 
 
 		 422 aa  51.2  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  25.58 
 
 		 455 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  23.47 
 
 		 431 aa  51.2  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  32.95 
 
 		 434 aa  50.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1722  extracellular solute-binding protein family 1  22.7 
 
 		 476 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.902381 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  24.85 
 
 		 453 aa  50.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  21.7 
 
 		 417 aa  50.8  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3985  extracellular solute-binding protein  23.92 
 
 		 631 aa  50.4  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0580929  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  20.95 
 
 		 420 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  21.57 
 
 		 439 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1604  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 		 425 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2170  extracellular solute-binding protein family 1  27.35 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  21.57 
 
 		 439 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  21.39 
 
 		 444 aa  50.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  26.03 
 
 		 422 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.45 
 
 		 452 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7341  sugar ABC transporter sugar-binding protein  23.78 
 
 		 426 aa  49.7  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6240  ABC transporter substrate binding protein (maltose)  24.37 
 
 		 407 aa  49.7  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0994607  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2472  extracellular solute-binding protein  21.83 
 
 		 419 aa  48.9  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.250047 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4516  extracellular solute-binding protein  19.64 
 
 		 432 aa  48.9  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2983  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 		 467 aa  48.9  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3651  hypothetical protein  21.14 
 
 		 437 aa  49.3  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  0.0762923 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4644  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 		 409 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0265502  normal  0.0904039 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  21.57 
 
 		 412 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  24.42 
 
 		 440 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  23.95 
 
 		 434 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  21.72 
 
 		 504 aa  49.3  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6631  extracellular solute-binding protein family 1  24.9 
 
 		 410 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  20.85 
 
 		 470 aa  49.3  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  33 
 
 		 424 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3459  extracellular solute-binding protein family 1  24.29 
 
 		 458 aa  48.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.725469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2047  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  21.98 
 
 		 479 aa  48.5  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  23.05 
 
 		 461 aa  48.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.85 
 
 		 426 aa  47.8  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  21.79 
 
 		 468 aa  47.8  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0298  extracellular solute-binding protein  22.78 
 
 		 486 aa  48.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4454  extracellular solute-binding protein family 1  22.59 
 
 		 466 aa  48.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  20.3 
 
 		 418 aa  47.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  22.62 
 
 		 414 aa  47  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1550  extracellular solute-binding protein  23.49 
 
 		 428 aa  47  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3317  extracellular solute-binding protein  23.4 
 
 		 492 aa  47  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000142443  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  33.33 
 
 		 437 aa  47  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0687  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 		 407 aa  47  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.376534  normal  0.15795 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  20.28 
 
 		 420 aa  47  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  22.18 
 
 		 423 aa  47  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  22.53 
 
 		 419 aa  46.6  0.0009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  24.52 
 
 		 522 aa  46.6  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2870  extracellular solute-binding protein  23.48 
 
 		 447 aa  46.2  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  22.45 
 
 		 422 aa  46.2  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  20.62 
 
 		 436 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  21.38 
 
 		 408 aa  46.2  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  25.7 
 
 		 411 aa  46.6  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>