249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4463 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4463  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
411 aa  831    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00452134  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0747  extracellular solute-binding protein  38.51 
 
 
435 aa  220  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118998 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4429  extracellular solute-binding protein  37.61 
 
 
430 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3624  extracellular solute-binding protein family 1  37.22 
 
 
425 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.541774  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20470  extracellular solute-binding protein family 1  22.16 
 
 
406 aa  97.1  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000403753  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  27.08 
 
 
415 aa  91.7  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 
391 aa  86.7  6e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 
391 aa  84.3  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0984  extracellular solute-binding protein  23.77 
 
 
392 aa  83.6  0.000000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000118485  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0966  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 
392 aa  83.2  0.000000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000011003  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3183  extracellular solute-binding protein family 1  22.69 
 
 
411 aa  82  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.641192  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 
395 aa  81.6  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1262  extracellular solute-binding protein  25.72 
 
 
408 aa  80.9  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.953049  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0596  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 
390 aa  79.3  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00439649  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2574  extracellular solute-binding protein family 1  21.94 
 
 
401 aa  78.6  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000602333  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1055  extracellular solute-binding protein  24.06 
 
 
418 aa  77.4  0.0000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.404897  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0986  extracellular solute-binding protein  21.45 
 
 
449 aa  75.5  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.265801 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1865  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 
454 aa  73.9  0.000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0712  extracellular solute-binding protein family 1  27.19 
 
 
397 aa  73.6  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.518168  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4563  extracellular solute-binding protein  23.98 
 
 
439 aa  73.6  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4136  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  22.82 
 
 
400 aa  73.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  20.93 
 
 
424 aa  73.2  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  25.82 
 
 
411 aa  72.4  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4267  extracellular solute-binding protein family 1  24.25 
 
 
400 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1170  extracellular solute-binding protein family 1  23.26 
 
 
397 aa  72.8  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.441465  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2649  extracellular solute-binding protein family 1  24.59 
 
 
400 aa  71.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4289  extracellular solute-binding protein family 1  22.82 
 
 
400 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1617  extracellular solute-binding protein  22.47 
 
 
460 aa  69.7  0.00000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1118  extracellular solute-binding protein family 1  24.61 
 
 
400 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704817  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  22.55 
 
 
417 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2758  extracellular solute-binding protein family 1  25.08 
 
 
423 aa  67.8  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.736779  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0854  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 
398 aa  67  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.124504  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0199  extracellular solute-binding protein  22.11 
 
 
423 aa  66.2  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.136897  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0205  extracellular solute-binding protein  22.11 
 
 
423 aa  66.2  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1696  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 
436 aa  65.9  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00506774  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  21.53 
 
 
435 aa  66.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1151  extracellular solute-binding protein family 1  26.09 
 
 
400 aa  65.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 
433 aa  65.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0206  extracellular solute-binding protein family 1  25.82 
 
 
433 aa  65.1  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.568957  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 
420 aa  65.5  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0188  extracellular solute-binding protein  21.08 
 
 
420 aa  65.1  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0219  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.22 
 
 
423 aa  64.7  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000685496  hitchhiker  0.000000202467 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  25.99 
 
 
422 aa  64.7  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0632  extracellular solute-binding protein family 1  27.59 
 
 
434 aa  64.3  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.708501  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0406  extracellular solute-binding protein family 1  25.48 
 
 
428 aa  63.2  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00219397  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05214  maltose ABC transporter periplasmic protein  28 
 
 
416 aa  62  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1846  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.06 
 
 
442 aa  61.2  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000328949  hitchhiker  0.000299807 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4138  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  24.91 
 
 
419 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00348898  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001328  maltose/maltodextrin ABC transporter substrate binding periplasmic protein MalE  26.35 
 
 
392 aa  60.8  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15040  extracellular solute-binding protein family 1  23.7 
 
 
458 aa  60.8  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.751229  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2714  extracellular solute-binding protein  29.75 
 
 
419 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.182746  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 
414 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4064  maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein, putative  26.13 
 
 
419 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0421403  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  20.17 
 
 
461 aa  60.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  24.22 
 
 
445 aa  60.5  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  22.16 
 
 
423 aa  60.5  0.00000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  22.69 
 
 
431 aa  60.1  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1321  extracellular solute-binding protein family 1  24.77 
 
 
410 aa  60.1  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2958  extracellular solute-binding protein family 1  24.15 
 
 
410 aa  59.7  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.347864  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  22.8 
 
 
432 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2535  extracellular solute-binding protein family 1  22.69 
 
 
418 aa  59.7  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.105932  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4119  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  26.13 
 
 
419 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000674051  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0340  extracellular solute-binding protein  21.43 
 
 
419 aa  58.5  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3922  maltosaccharide ABC transporter maltosaccharide-binding protein  26.13 
 
 
419 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0134813  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3754  maltose-maltodextrin ABC-related solute binding protein  26.13 
 
 
419 aa  58.9  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000542287  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3770  maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  26.13 
 
 
419 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000087749  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4229  maltosaccharide ABC transporter maltosaccharide-binding protein  26.13 
 
 
419 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.749727  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4032  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  26.13 
 
 
419 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 
412 aa  58.9  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  30.81 
 
 
438 aa  57.8  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1438  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
400 aa  58.2  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000172655  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  26.97 
 
 
412 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  26.92 
 
 
440 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0753  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 
437 aa  57.8  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  21.94 
 
 
437 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2057  extracellular solute-binding protein family 1  22.73 
 
 
421 aa  57.8  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.112802  normal  0.296802 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2034  extracellular solute-binding protein family 1  20.61 
 
 
422 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal  0.822994 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2308  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 
440 aa  57.8  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000253431  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0322  extracellular solute-binding protein  21.38 
 
 
419 aa  57.4  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16190  extracellular solute-binding protein family 1  24.5 
 
 
401 aa  57.4  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1441  maltose/maltodextrin ABC transporter, maltose/maltodextrin-binding protein  20.49 
 
 
415 aa  57  0.0000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0332503  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03790  maltose-binding periplasmic protein  25.45 
 
 
467 aa  57  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0386362 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1181  extracellular solute-binding protein  19.4 
 
 
413 aa  57  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000595288  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2009  extracellular solute-binding protein family 1  20.61 
 
 
422 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0294  maltose ABC transporter periplasmic protein  24.26 
 
 
406 aa  56.6  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.491527  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 
415 aa  56.6  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1120  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  22.73 
 
 
419 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000383609  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  21.33 
 
 
419 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4936  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 
463 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.105521 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4697  extracellular solute-binding protein family 1  27.01 
 
 
442 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  21.89 
 
 
408 aa  55.8  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  23.27 
 
 
457 aa  55.8  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3860  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 
463 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.952749  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0282  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 
423 aa  55.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3841  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 
419 aa  55.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000013033  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  26.59 
 
 
412 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  23.46 
 
 
433 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  20.9 
 
 
406 aa  54.3  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3941  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  28.83 
 
 
436 aa  54.3  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2315  extracellular solute-binding protein family 1  28.06 
 
 
503 aa  53.9  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>