More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_2194 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_2194  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
414 aa  843    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00903267  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1289  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 
479 aa  168  2e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1976  extracellular solute-binding protein family 1  29.91 
 
 
477 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  25.69 
 
 
419 aa  92.8  9e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
431 aa  89  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 
410 aa  80.5  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  24.01 
 
 
419 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  22.89 
 
 
439 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  22.89 
 
 
439 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  22.89 
 
 
412 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  23.88 
 
 
422 aa  74.7  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 
429 aa  74.7  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 
446 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 
410 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
413 aa  73.9  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  23.31 
 
 
496 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1390  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 
444 aa  72.4  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00129811  normal  0.103249 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  29.72 
 
 
420 aa  71.6  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  24.72 
 
 
428 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  23.04 
 
 
412 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  24.53 
 
 
410 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3348  extracellular solute-binding protein family 1  25.39 
 
 
443 aa  71.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  24.42 
 
 
404 aa  70.5  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0041  extracellular solute-binding protein  21.88 
 
 
460 aa  70.5  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  24.82 
 
 
423 aa  68.9  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  24.18 
 
 
453 aa  69.7  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  25.14 
 
 
428 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  29.23 
 
 
423 aa  68.6  0.0000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6528  extracellular solute-binding protein family 1  25.21 
 
 
415 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  23.35 
 
 
423 aa  68.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  21.99 
 
 
428 aa  67.8  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  22.92 
 
 
412 aa  67.8  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  22.54 
 
 
425 aa  67.4  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.76 
 
 
418 aa  66.6  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  22.88 
 
 
449 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7341  sugar ABC transporter sugar-binding protein  27.08 
 
 
426 aa  65.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  21.04 
 
 
421 aa  65.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05710  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.44 
 
 
425 aa  65.9  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13799  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  22.53 
 
 
425 aa  65.1  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  24.41 
 
 
412 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  23.67 
 
 
436 aa  65.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15380  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.09 
 
 
465 aa  64.7  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.479356  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  20.67 
 
 
430 aa  64.3  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  24.47 
 
 
426 aa  64.3  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  24.41 
 
 
412 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  22.48 
 
 
419 aa  63.5  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  25.7 
 
 
422 aa  63.2  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  22.67 
 
 
420 aa  63.5  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0791  extracellular solute-binding protein family 1  23.01 
 
 
399 aa  63.2  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.418273 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  22.33 
 
 
461 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0476  extracellular solute-binding protein family 1  26.19 
 
 
401 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  22.93 
 
 
443 aa  62.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  20.59 
 
 
421 aa  62  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4940  extracellular solute-binding protein family 1  20.13 
 
 
484 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.47 
 
 
407 aa  62  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0475  extracellular solute-binding protein family 1  23.1 
 
 
397 aa  62.4  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0487  extracellular solute-binding protein family 1  22.59 
 
 
433 aa  62  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1713  extracellular solute-binding protein  21.15 
 
 
402 aa  62  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2146  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 
414 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0889  extracellular solute-binding protein  22.42 
 
 
435 aa  61.2  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 
408 aa  61.6  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0282  extracellular solute-binding protein  25.22 
 
 
423 aa  61.2  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0698  extracellular solute-binding protein family 1  22.49 
 
 
428 aa  61.2  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0317884  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0174  extracellular solute-binding protein family 1  20.73 
 
 
951 aa  61.2  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.01491  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  21.97 
 
 
434 aa  61.6  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  32.1 
 
 
441 aa  60.5  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  23.74 
 
 
422 aa  60.5  0.00000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3934  extracellular solute-binding protein family 1  24.5 
 
 
447 aa  60.5  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.486973  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23010  extracellular solute-binding protein family 1  22.48 
 
 
436 aa  60.1  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000978171  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  23.16 
 
 
411 aa  60.1  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  24.29 
 
 
435 aa  59.7  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  21.79 
 
 
466 aa  59.7  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 
414 aa  59.7  0.00000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  23.18 
 
 
423 aa  59.7  0.00000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0446  extracellular solute-binding protein family 1  21.14 
 
 
424 aa  59.7  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900099  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1743  extracellular solute-binding protein family 1  23.88 
 
 
447 aa  59.7  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1492  extracellular solute-binding protein  21.24 
 
 
421 aa  59.7  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0758  extracellular solute-binding protein family 1  22.97 
 
 
443 aa  59.3  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3005  extracellular solute-binding protein  22.69 
 
 
386 aa  59.3  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0509574  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  22.98 
 
 
411 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  23.16 
 
 
411 aa  59.7  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1550  extracellular solute-binding protein  21.75 
 
 
428 aa  58.9  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1331  extracellular solute-binding protein family 1  20.54 
 
 
448 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000205805  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7725  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.15 
 
 
420 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  23.42 
 
 
403 aa  58.9  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 
421 aa  58.9  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3337  extracellular solute-binding protein family 1  27.2 
 
 
427 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0556  ABC transporter, solute-binding protein  24.9 
 
 
461 aa  57.8  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  23.33 
 
 
421 aa  58.2  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  22.22 
 
 
426 aa  57.8  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  20.77 
 
 
439 aa  57.8  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0234  extracellular solute-binding protein family 1  22.97 
 
 
412 aa  57.8  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.497123  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  20.95 
 
 
433 aa  57  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  23.6 
 
 
439 aa  57.4  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0671  extracellular solute-binding protein  24.66 
 
 
436 aa  57  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.687145  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  20.45 
 
 
440 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  22.2 
 
 
402 aa  57  0.0000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  24.1 
 
 
412 aa  56.6  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0540  ABC transporter, substrate-binding protein  24.9 
 
 
461 aa  56.6  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2920  extracellular solute-binding protein family 1  23.55 
 
 
424 aa  56.6  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>