53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1713 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1713  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 402 aa  820    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1705  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  83.75 
 
 		 283 aa  503  1e-141  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1706  hypothetical protein  70.09 
 
 		 107 aa  159  6e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1550  extracellular solute-binding protein  27.34 
 
 		 428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1534  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 		 430 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000145285  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1583  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 		 420 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000175887  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0672  extracellular solute-binding protein family 1  24.63 
 
 		 428 aa  104  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.305152 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0173  extracellular solute-binding protein family 1  27.22 
 
 		 443 aa  87.4  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5385  extracellular solute-binding protein family 1  25.37 
 
 		 424 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.832628 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  24.72 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2194  extracellular solute-binding protein  21.15 
 
 		 414 aa  62  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00903267  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  23.02 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.92 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  22.54 
 
 		 423 aa  54.3  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2870  extracellular solute-binding protein  23.44 
 
 		 447 aa  51.2  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  24.34 
 
 		 431 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12078  sugar-binding lipoprotein  21.11 
 
 		 439 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  22.48 
 
 		 435 aa  50.4  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3982  extracellular solute-binding protein family 1  22.76 
 
 		 435 aa  50.1  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  22.54 
 
 		 430 aa  49.3  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1976  extracellular solute-binding protein family 1  20.68 
 
 		 477 aa  49.3  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1276  extracellular solute-binding protein family 1  23.72 
 
 		 417 aa  49.3  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000485827  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  22.54 
 
 		 430 aa  49.3  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16190  extracellular solute-binding protein family 1  22.44 
 
 		 401 aa  48.5  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  22.79 
 
 		 452 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 		 422 aa  48.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5048  extracellular solute-binding protein family 1  25.52 
 
 		 424 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1321  extracellular solute-binding protein family 1  22.54 
 
 		 410 aa  47.4  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0944  extracellular solute-binding protein family 1  23.33 
 
 		 433 aa  47.4  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.322748 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2652  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, maltose/maltodextrin-binding protein  25.23 
 
 		 408 aa  47.4  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  24.36 
 
 		 412 aa  46.6  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4357  extracellular solute-binding protein  21.25 
 
 		 455 aa  46.2  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4443  extracellular solute-binding protein  21.25 
 
 		 455 aa  46.2  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0226595 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0008  ABC transporter periplasmic-binding protein  23.75 
 
 		 325 aa  45.8  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000406397  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  25.19 
 
 		 437 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6090  extracellular solute-binding protein family 1  22.57 
 
 		 425 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2958  extracellular solute-binding protein family 1  22.25 
 
 		 410 aa  45.8  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.347864  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  21.68 
 
 		 421 aa  45.1  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  25.09 
 
 		 413 aa  45.8  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5331  extracellular solute-binding protein family 1  23.97 
 
 		 424 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0298  extracellular solute-binding protein  28.97 
 
 		 486 aa  45.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  21.37 
 
 		 410 aa  44.3  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0954  extracellular solute-binding protein  23.29 
 
 		 397 aa  44.3  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.233769  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03790  maltose-binding periplasmic protein  30.85 
 
 		 467 aa  43.9  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0386362 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  25.08 
 
 		 419 aa  43.9  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2346  extracellular solute-binding protein family 1  22.54 
 
 		 382 aa  43.5  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00216942 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7590  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  22.61 
 
 		 447 aa  43.5  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3709  extracellular solute-binding protein  20.47 
 
 		 437 aa  43.5  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4016  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  20.47 
 
 		 437 aa  43.5  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3575  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  20.47 
 
 		 437 aa  43.5  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  25.4 
 
 		 427 aa  43.1  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 		 393 aa  43.1  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  23.67 
 
 		 411 aa  42.7  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>