28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1705 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1705  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 		 283 aa  577  1e-164  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1713  extracellular solute-binding protein  83.75 
 
 		 402 aa  503  1e-141  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1534  extracellular solute-binding protein  28.67 
 
 		 430 aa  102  7e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000145285  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1583  extracellular solute-binding protein  28.67 
 
 		 420 aa  99.8  5e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000175887  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1550  extracellular solute-binding protein  28.26 
 
 		 428 aa  96.3  5e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0173  extracellular solute-binding protein family 1  26.36 
 
 		 443 aa  94.7  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5385  extracellular solute-binding protein family 1  26.49 
 
 		 424 aa  85.9  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.832628 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0672  extracellular solute-binding protein family 1  25.28 
 
 		 428 aa  83.6  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.305152 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  24.46 
 
 		 423 aa  53.5  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  27.32 
 
 		 431 aa  52.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  26.94 
 
 		 411 aa  49.3  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01900  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.24 
 
 		 442 aa  48.9  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.867357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.48 
 
 		 366 aa  47.4  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12078  sugar-binding lipoprotein  27.62 
 
 		 439 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  26.57 
 
 		 419 aa  47.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  26.26 
 
 		 411 aa  47  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0375  extracellular solute-binding protein family 1  28.07 
 
 		 421 aa  45.8  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0378  extracellular solute-binding protein family 1  28.07 
 
 		 420 aa  45.8  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 		 411 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  26.37 
 
 		 419 aa  44.3  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 		 393 aa  44.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6732  extracellular solute-binding protein family 1  25.56 
 
 		 425 aa  43.5  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25.94 
 
 		 431 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  23.74 
 
 		 435 aa  42.7  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 402 aa  42.7  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  33.67 
 
 		 440 aa  42.4  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  24.38 
 
 		 408 aa  42.4  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 410 aa  42  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>