278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0234 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0234  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 412 aa  828    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.497123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1045  extracellular solute-binding protein family 1  40.93 
 
 		 488 aa  281  2e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0733801  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05710  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  35.61 
 
 		 425 aa  194  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13799  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3730  extracellular solute-binding protein family 1  34.18 
 
 		 435 aa  180  4e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163607  normal  0.040318 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  32.46 
 
 		 422 aa  162  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0403  extracellular solute-binding protein family 1  33.64 
 
 		 426 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512139  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0552  extracellular solute-binding protein  29.9 
 
 		 445 aa  144  4e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.764632 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  31.71 
 
 		 443 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7201  extracellular solute-binding protein family 1  30.68 
 
 		 447 aa  136  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0446  extracellular solute-binding protein family 1  28 
 
 		 424 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900099  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.18 
 
 		 430 aa  131  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0772443  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7721  extracellular solute-binding protein family 1  31.2 
 
 		 462 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  29.04 
 
 		 425 aa  123  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7725  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.68 
 
 		 420 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2194  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.57 
 
 		 443 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3337  extracellular solute-binding protein family 1  27.42 
 
 		 427 aa  96.3  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 		 424 aa  79.3  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  26.58 
 
 		 411 aa  78.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  24.05 
 
 		 399 aa  75.1  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  23.72 
 
 		 402 aa  74.7  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  24.04 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  22.86 
 
 		 434 aa  70.5  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  25.27 
 
 		 423 aa  70.1  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  23.77 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  24.41 
 
 		 446 aa  68.6  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03906  maltose ABC transporter periplasmic protein  25.94 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3962  extracellular solute-binding protein family 1  25.94 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03866  hypothetical protein  25.94 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5515  maltose ABC transporter periplasmic protein  25.94 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.241432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4496  maltose ABC transporter periplasmic protein  25.94 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4274  maltose ABC transporter periplasmic protein  25.94 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4586  maltose ABC transporter periplasmic protein  25.94 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3995  maltose ABC transporter periplasmic protein  25.94 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0495972  normal  0.57528 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 		 427 aa  66.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  23.41 
 
 		 424 aa  66.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0238  maltose ABC transporter periplasmic protein  25.65 
 
 		 396 aa  66.2  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.941451 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0596  extracellular solute-binding protein  24.85 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00439649  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  27.22 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3709  extracellular solute-binding protein  25.8 
 
 		 437 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  24.29 
 
 		 429 aa  65.5  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3575  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  25.8 
 
 		 437 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2652  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, maltose/maltodextrin-binding protein  22.73 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4016  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  25.8 
 
 		 437 aa  64.7  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0298  extracellular solute-binding protein  23.7 
 
 		 486 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 440 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1170  extracellular solute-binding protein family 1  27.62 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.441465  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  27.04 
 
 		 466 aa  63.5  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 		 459 aa  63.2  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4486  maltose ABC transporter periplasmic protein  24.23 
 
 		 396 aa  63.2  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3914  maltose ABC transporter periplasmic protein  25.43 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0378  maltose ABC transporter periplasmic protein  25.43 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0306  maltose ABC transporter periplasmic protein  25.43 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000110695  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2338  maltose-binding periplasmic protein precursor  22.73 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  23.77 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2574  extracellular solute-binding protein family 1  25.6 
 
 		 401 aa  63.2  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000602333  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0890  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 		 450 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.315589  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4572  maltose ABC transporter periplasmic protein  24.29 
 
 		 396 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0168981 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4623  maltose ABC transporter periplasmic protein  24.29 
 
 		 396 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.108824 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  24.01 
 
 		 459 aa  62  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4571  maltose ABC transporter periplasmic protein  24.29 
 
 		 396 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.552535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4421  maltose ABC transporter periplasmic protein  24.29 
 
 		 396 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100315 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  23.38 
 
 		 440 aa  62  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0712  extracellular solute-binding protein family 1  25.45 
 
 		 397 aa  62  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.518168  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4472  maltose ABC transporter periplasmic protein  24.78 
 
 		 397 aa  62  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  26.06 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  25.36 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4989  extracellular solute-binding protein family 1  24.71 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1181  extracellular solute-binding protein  23.68 
 
 		 413 aa  59.3  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000595288  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  26.98 
 
 		 439 aa  59.3  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  27.38 
 
 		 428 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3553  extracellular solute-binding protein  27.55 
 
 		 419 aa  58.9  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0915  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  25.89 
 
 		 443 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1756  ABC transporter substrate-binding protein  25.6 
 
 		 439 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  0.574192 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  24 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  23.54 
 
 		 433 aa  58.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.36 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  21.9 
 
 		 430 aa  58.2  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  21.9 
 
 		 430 aa  58.2  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  26.62 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1681  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 		 436 aa  57.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.901925  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5074  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 		 447 aa  57.4  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2194  extracellular solute-binding protein  22.97 
 
 		 414 aa  57.4  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00903267  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  23.63 
 
 		 435 aa  57  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  26.62 
 
 		 432 aa  57  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1853  maltose ABC transporter substrate binding protein  25.12 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225735  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  24.73 
 
 		 427 aa  56.6  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0138  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 		 434 aa  56.2  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  27.57 
 
 		 441 aa  56.2  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  24.06 
 
 		 442 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 		 455 aa  56.2  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  22.96 
 
 		 424 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  24.38 
 
 		 435 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0701  extracellular solute-binding protein family 1  24.37 
 
 		 432 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0854  extracellular solute-binding protein family 1  23.71 
 
 		 398 aa  55.8  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.124504  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3183  extracellular solute-binding protein family 1  23.16 
 
 		 411 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.641192  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4563  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 		 439 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  24.38 
 
 		 443 aa  55.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>