232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1853 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1853  maltose ABC transporter substrate binding protein  100 
 
 
409 aa  817    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225735  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0219  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  49.14 
 
 
423 aa  367  1e-100  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000685496  hitchhiker  0.000000202467 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1441  maltose/maltodextrin ABC transporter, maltose/maltodextrin-binding protein  36.45 
 
 
415 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0332503  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1295  extracellular solute-binding protein  32.46 
 
 
409 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1120  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  26.9 
 
 
419 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000383609  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1170  extracellular solute-binding protein family 1  29.94 
 
 
397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.441465  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1118  extracellular solute-binding protein family 1  28.93 
 
 
400 aa  116  6e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704817  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1181  extracellular solute-binding protein  28.09 
 
 
413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000595288  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2873  extracellular solute-binding protein family 1  28.9 
 
 
425 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3132  maltose ABC transporter periplasmic protein  27.37 
 
 
395 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0559599  normal  0.0111617 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  29.02 
 
 
415 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  24.71 
 
 
424 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2308  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 
440 aa  108  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000253431  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1879  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 
437 aa  107  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000146819  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3183  extracellular solute-binding protein family 1  25.46 
 
 
411 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.641192  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2574  extracellular solute-binding protein family 1  29.11 
 
 
401 aa  103  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000602333  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2714  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 
419 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.182746  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1485  extracellular solute-binding protein family 1  24.2 
 
 
424 aa  101  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3841  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 
419 aa  101  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000013033  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4138  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  25.63 
 
 
419 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00348898  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4064  maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein, putative  25.63 
 
 
419 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0421403  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1276  extracellular solute-binding protein family 1  26.49 
 
 
417 aa  100  7e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000485827  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0712  extracellular solute-binding protein family 1  25.38 
 
 
397 aa  99.4  9e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.518168  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0701  extracellular solute-binding protein family 1  26.38 
 
 
432 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3922  maltosaccharide ABC transporter maltosaccharide-binding protein  25.38 
 
 
419 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0134813  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3754  maltose-maltodextrin ABC-related solute binding protein  25.38 
 
 
419 aa  98.2  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000542287  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3770  maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  25.38 
 
 
419 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000087749  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4229  maltosaccharide ABC transporter maltosaccharide-binding protein  25.38 
 
 
419 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.749727  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4032  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  25.38 
 
 
419 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4119  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  25.38 
 
 
419 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000674051  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0294  maltose ABC transporter periplasmic protein  27.27 
 
 
406 aa  94.7  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.491527  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0968  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 
411 aa  93.6  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155665  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3883  maltose/maltodextrin ABC transporter periplasmic maltose/maltodextrin-binding protein  26.54 
 
 
411 aa  93.2  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.265603 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0854  extracellular solute-binding protein family 1  26.29 
 
 
398 aa  92.8  9e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.124504  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2152  extracellular solute-binding protein family 1  24.07 
 
 
415 aa  92.8  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.410183  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0914  maltose/maltodextrin ABC transporter, periplasmic maltose/maltodextrin-binding protein  26.54 
 
 
411 aa  92.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.459005  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0966  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 
392 aa  91.7  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000011003  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0984  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 
392 aa  91.7  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000118485  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2652  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, maltose/maltodextrin-binding protein  26.72 
 
 
408 aa  90.9  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2338  maltose-binding periplasmic protein precursor  26.19 
 
 
408 aa  90.5  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2958  extracellular solute-binding protein family 1  25.87 
 
 
410 aa  90.5  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.347864  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1500  extracellular solute-binding protein  27.81 
 
 
393 aa  90.1  6e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001328  maltose/maltodextrin ABC transporter substrate binding periplasmic protein MalE  26.28 
 
 
392 aa  89.7  8e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0306  maltose ABC transporter periplasmic protein  25.81 
 
 
403 aa  89  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000110695  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3914  maltose ABC transporter periplasmic protein  25.81 
 
 
403 aa  89  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0378  maltose ABC transporter periplasmic protein  25.81 
 
 
403 aa  89  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2347  extracellular solute-binding protein  21.88 
 
 
431 aa  88.2  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1321  extracellular solute-binding protein family 1  25.33 
 
 
410 aa  87.8  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2135  maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein MalE  27.5 
 
 
410 aa  88.2  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1262  extracellular solute-binding protein  23.35 
 
 
408 aa  87  5e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.953049  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0199  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 
423 aa  86.7  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.136897  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0205  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 
423 aa  86.7  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2162  extracellular solute-binding protein family 1  23.54 
 
 
415 aa  86.7  8e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.183799  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04140  maltose-binding periplasmic protein  26.16 
 
 
449 aa  83.6  0.000000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1055  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 
418 aa  83.2  0.000000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.404897  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03906  maltose ABC transporter periplasmic protein  24.27 
 
 
396 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3962  extracellular solute-binding protein family 1  24.27 
 
 
396 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4274  maltose ABC transporter periplasmic protein  24.27 
 
 
396 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4586  maltose ABC transporter periplasmic protein  24.27 
 
 
396 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03866  hypothetical protein  24.27 
 
 
396 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4496  maltose ABC transporter periplasmic protein  24.27 
 
 
396 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13860  maltose-binding periplasmic protein  24.75 
 
 
412 aa  82.4  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5515  maltose ABC transporter periplasmic protein  24.27 
 
 
396 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.241432  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  24.2 
 
 
428 aa  81.3  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16190  extracellular solute-binding protein family 1  24.46 
 
 
401 aa  80.9  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  21.62 
 
 
434 aa  80.9  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0238  maltose ABC transporter periplasmic protein  24.93 
 
 
396 aa  80.9  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.941451 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3995  maltose ABC transporter periplasmic protein  24.03 
 
 
396 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0495972  normal  0.57528 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5151  extracellular solute-binding protein family 1  24.75 
 
 
400 aa  80.5  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.385349  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05214  maltose ABC transporter periplasmic protein  25 
 
 
416 aa  80.1  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0832  multiple sugar transport system substrate-binding protein  24.49 
 
 
416 aa  80.1  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.669088  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  23.1 
 
 
391 aa  79.7  0.00000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.21 
 
 
426 aa  79.7  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4136  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  27.67 
 
 
400 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4623  maltose ABC transporter periplasmic protein  24.15 
 
 
396 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.108824 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4572  maltose ABC transporter periplasmic protein  24.15 
 
 
396 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0168981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  27.3 
 
 
430 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4571  maltose ABC transporter periplasmic protein  24.15 
 
 
396 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.552535  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4421  maltose ABC transporter periplasmic protein  24.15 
 
 
396 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100315 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  23.1 
 
 
391 aa  78.2  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4486  maltose ABC transporter periplasmic protein  24.15 
 
 
396 aa  78.2  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1527  extracellular solute-binding protein family 1  24.36 
 
 
412 aa  78.2  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207567  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4472  maltose ABC transporter periplasmic protein  25.83 
 
 
397 aa  77.4  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  26.45 
 
 
422 aa  77  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0940  maltose ABC transporter periplasmic protein  22.73 
 
 
409 aa  76.6  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69507  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4267  extracellular solute-binding protein family 1  27 
 
 
400 aa  76.3  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4289  extracellular solute-binding protein family 1  27.33 
 
 
400 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0744  extracellular solute-binding protein  23.6 
 
 
432 aa  76.3  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0587531  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  23.36 
 
 
395 aa  75.1  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4563  extracellular solute-binding protein  25.43 
 
 
439 aa  74.3  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0596  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 
390 aa  73.9  0.000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00439649  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0694  extracellular solute-binding protein family 1  22.41 
 
 
415 aa  73.6  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.333505 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20470  extracellular solute-binding protein family 1  22.08 
 
 
406 aa  73.2  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000403753  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  24.03 
 
 
427 aa  72  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  23.98 
 
 
420 aa  71.6  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 
433 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  22.28 
 
 
433 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1438  extracellular solute-binding protein  22.96 
 
 
400 aa  70.9  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000172655  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  25.84 
 
 
435 aa  70.1  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  24.81 
 
 
435 aa  70.1  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>