More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0174 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2274  extracellular solute-binding protein  38.02 
 
 		 1012 aa  667    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1594  extracellular solute-binding protein family 1  47.51 
 
 		 961 aa  883    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0174  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 951 aa  1943    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.01491  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0089  extracellular solute-binding protein family 1  29.12 
 
 		 951 aa  387  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0294  extracellular solute-binding protein  30.27 
 
 		 998 aa  360  5e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  24.29 
 
 		 399 aa  88.6  5e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3988  extracellular solute-binding protein family 1  27.3 
 
 		 422 aa  82.8  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  28.52 
 
 		 457 aa  79.7  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0890  extracellular solute-binding protein  24.45 
 
 		 450 aa  80.1  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.315589  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  25.53 
 
 		 449 aa  79  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  27.95 
 
 		 406 aa  78.2  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 		 419 aa  75.5  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  25.72 
 
 		 446 aa  75.1  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.91 
 
 		 453 aa  74.7  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  22.51 
 
 		 446 aa  73.6  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  23.91 
 
 		 440 aa  74.3  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.75 
 
 		 419 aa  73.9  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1296  extracellular solute-binding protein family 1  25.75 
 
 		 443 aa  73.6  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  28 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  25.68 
 
 		 411 aa  71.2  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  25.72 
 
 		 430 aa  71.2  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  28.97 
 
 		 436 aa  70.5  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 		 439 aa  70.9  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  22.44 
 
 		 424 aa  70.9  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  27.72 
 
 		 488 aa  70.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  25.14 
 
 		 445 aa  70.1  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  21.51 
 
 		 427 aa  68.6  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  28.46 
 
 		 428 aa  68.6  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 		 488 aa  68.6  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.13 
 
 		 407 aa  68.6  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  25.62 
 
 		 445 aa  68.2  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  32.92 
 
 		 404 aa  66.6  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  24.16 
 
 		 403 aa  65.9  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  30.63 
 
 		 455 aa  66.2  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  24.73 
 
 		 421 aa  65.9  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3304  extracellular solute-binding protein family 1  23 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753481 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  28.48 
 
 		 420 aa  65.5  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0075  extracellular solute-binding protein family 1  22.33 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  25.28 
 
 		 437 aa  65.1  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0375  extracellular solute-binding protein family 1  25.23 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 		 411 aa  63.9  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0358  extracellular solute-binding protein family 1  23.48 
 
 		 441 aa  63.9  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  23.89 
 
 		 443 aa  63.2  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  27.04 
 
 		 423 aa  63.2  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  27.47 
 
 		 437 aa  63.5  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  29.38 
 
 		 446 aa  63.5  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  22.94 
 
 		 415 aa  63.2  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 424 aa  63.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  30.94 
 
 		 424 aa  63.2  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  21.72 
 
 		 429 aa  62.4  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3366  extracellular solute-binding protein family 1  25.53 
 
 		 441 aa  63.2  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.63 
 
 		 366 aa  62.8  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 412 aa  62.4  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  23.97 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 		 428 aa  62.8  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  25.95 
 
 		 408 aa  62.8  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  27.69 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  23.74 
 
 		 461 aa  62.4  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  20.89 
 
 		 430 aa  62  0.00000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  26.51 
 
 		 420 aa  62  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  20.89 
 
 		 430 aa  62  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  24.72 
 
 		 427 aa  62  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0378  extracellular solute-binding protein family 1  23.62 
 
 		 420 aa  62  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  25.71 
 
 		 439 aa  62  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0310  extracellular solute-binding protein family 1  22.94 
 
 		 440 aa  62  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0877495  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  25.63 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0291  extracellular solute-binding protein  22.95 
 
 		 449 aa  61.2  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2194  extracellular solute-binding protein  20.73 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00903267  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25 
 
 		 426 aa  60.8  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  21.73 
 
 		 421 aa  61.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  23.2 
 
 		 420 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1634  extracellular solute-binding protein  22.91 
 
 		 428 aa  60.8  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  33.64 
 
 		 425 aa  60.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  24.07 
 
 		 464 aa  60.5  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1527  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  22.91 
 
 		 428 aa  60.8  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6090  extracellular solute-binding protein family 1  22.62 
 
 		 425 aa  60.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4993  extracellular solute-binding protein family 1  25.93 
 
 		 432 aa  59.7  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0450999  normal  0.012477 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0648  extracellular solute-binding protein family 1  23.39 
 
 		 447 aa  59.7  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  24.23 
 
 		 422 aa  60.1  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  22.54 
 
 		 415 aa  59.7  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  23.68 
 
 		 414 aa  60.1  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  21.16 
 
 		 405 aa  59.3  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1088  extracellular solute-binding protein family 1  25.78 
 
 		 414 aa  59.7  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00683834  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  26.27 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1390  extracellular solute-binding protein  23.33 
 
 		 444 aa  58.9  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00129811  normal  0.103249 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  22.39 
 
 		 363 aa  58.9  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  23.53 
 
 		 422 aa  59.3  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  23.53 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14550  extracellular solute-binding protein family 1  27.59 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000299418  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  26.79 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  31.85 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04930  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.04 
 
 		 442 aa  58.2  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7516  extracellular solute-binding protein family 1  28.17 
 
 		 452 aa  57.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.24 
 
 		 422 aa  57.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  26.73 
 
 		 422 aa  57.8  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4289  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 400 aa  56.6  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0048  extracellular solute-binding protein family 1  24.07 
 
 		 434 aa  56.6  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>