218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3207 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2983  extracellular solute-binding protein  92.93 
 
 		 467 aa  892    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3207  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 467 aa  947    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1941  extracellular solute-binding protein family 1  39.29 
 
 		 487 aa  300  3e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.948884  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7707  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  38.96 
 
 		 485 aa  296  7e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.570568 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2047  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  36.83 
 
 		 479 aa  276  6e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23850  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  37.7 
 
 		 484 aa  269  8.999999999999999e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5528  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  37.11 
 
 		 485 aa  266  7e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.217643  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2855  extracellular solute-binding protein family 1  37.65 
 
 		 483 aa  243  5e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.830086 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3996  extracellular solute-binding protein family 1  29.14 
 
 		 472 aa  197  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0734403  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0556  ABC transporter, solute-binding protein  29.53 
 
 		 461 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0540  ABC transporter, substrate-binding protein  29.31 
 
 		 461 aa  170  5e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2102  periplasmic protein  26.67 
 
 		 447 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.502645  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0573  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 		 460 aa  93.2  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1792  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 		 462 aa  88.2  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0145  extracellular solute-binding protein family 1  24.76 
 
 		 442 aa  85.9  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 		 435 aa  82.4  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1705  extracellular solute-binding protein  30.17 
 
 		 444 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.751939  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  24.61 
 
 		 408 aa  73.2  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25 
 
 		 427 aa  72  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  24 
 
 		 408 aa  72  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  26.79 
 
 		 431 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  24.73 
 
 		 495 aa  68.2  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3246  extracellular solute-binding protein family 1  23.99 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  22.53 
 
 		 468 aa  67.4  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 452 aa  67.4  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  24.59 
 
 		 454 aa  67.4  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1001  extracellular solute-binding protein family 1  23.21 
 
 		 427 aa  67  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.628257  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  24.64 
 
 		 434 aa  66.6  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  28.5 
 
 		 411 aa  66.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1218  extracellular solute-binding protein family 1  23.81 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  26.45 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  28.74 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  26.45 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  28.74 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  23.98 
 
 		 417 aa  63.5  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2255  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.74 
 
 		 440 aa  63.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190437  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  28.34 
 
 		 420 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  28.34 
 
 		 420 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  24.7 
 
 		 429 aa  62.8  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 		 419 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  28.34 
 
 		 419 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  24.23 
 
 		 411 aa  62.4  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  28.04 
 
 		 422 aa  62  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.53 
 
 		 366 aa  62  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  30.1 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0616  extracellular solute-binding protein family 1  25.55 
 
 		 432 aa  61.6  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  21.68 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7806  extracellular solute-binding protein family 1  25.51 
 
 		 452 aa  61.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1490  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.53 
 
 		 442 aa  60.8  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.095095  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 		 411 aa  60.5  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0998  extracellular solute-binding protein family 1  28.29 
 
 		 451 aa  60.1  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.22 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.283496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  23.5 
 
 		 434 aa  59.3  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  27.36 
 
 		 431 aa  59.7  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000238529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5137  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 		 433 aa  59.7  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.319423  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  22.14 
 
 		 423 aa  59.3  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  28.81 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  29.11 
 
 		 441 aa  58.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  26.3 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0625  extracellular solute-binding protein family 1  29.41 
 
 		 437 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1306  extracellular solute-binding protein family 1  23.12 
 
 		 445 aa  57.4  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3985  extracellular solute-binding protein  27.85 
 
 		 631 aa  56.6  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0580929  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3350  extracellular solute-binding protein family 1  23.89 
 
 		 461 aa  55.8  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1289  extracellular solute-binding protein  28.66 
 
 		 479 aa  56.2  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  22.44 
 
 		 493 aa  56.2  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  27.36 
 
 		 431 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25 
 
 		 435 aa  56.6  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  24.57 
 
 		 441 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3379  extracellular solute-binding protein  24.14 
 
 		 445 aa  55.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1303  extracellular solute-binding protein  25.8 
 
 		 432 aa  55.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313179  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  30.46 
 
 		 432 aa  55.5  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  25.59 
 
 		 410 aa  55.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.87 
 
 		 428 aa  55.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  27.12 
 
 		 448 aa  54.7  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 		 412 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 		 412 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.62 
 
 		 441 aa  54.3  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0127  extracellular solute-binding protein family 1  23.23 
 
 		 442 aa  54.3  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4321  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 		 409 aa  54.3  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.739189 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3386  extracellular solute-binding protein family 1  25.94 
 
 		 440 aa  53.9  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  26.18 
 
 		 424 aa  53.9  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  25.57 
 
 		 422 aa  53.5  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 		 420 aa  52.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0596  extracellular solute-binding protein  28.32 
 
 		 390 aa  52.8  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00439649  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  23.4 
 
 		 441 aa  53.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1342  5'-Nucleotidase domain protein  24.04 
 
 		 618 aa  53.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.206839  normal  0.550173 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  21.96 
 
 		 451 aa  52.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27700  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.02 
 
 		 426 aa  52.4  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  22.96 
 
 		 441 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4984  extracellular solute-binding protein family 1  25.5 
 
 		 428 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  25.67 
 
 		 449 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8464  extracellular solute-binding protein family 1  30.73 
 
 		 481 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.635867  normal  0.0842744 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  27.98 
 
 		 395 aa  52  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  24.64 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3858  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 		 449 aa  52.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000022263  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.9 
 
 		 452 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.45 
 
 		 449 aa  52  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>